Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02966
- Subject:
- XM_011527907.2
- Aligned Length:
- 1652
- Identities:
- 1205
- Gaps:
- 439
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGAGACCGGCTTCCATTCTATGCGGAGTCCACGGTCTGCTCTGATCTTGCTGTGTGGAGTTGTTGTGTGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAAATGCTTGTGACCCTGCGAAGCGCCCTCCTGGCAAGTCCCCTGCAGGTGCGGTGGGTGCCATGCAGGAGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGCTGAGCTTGGATGGAAGCAGGCCCTCTCTGCGGCAGATGGCGGCTCTCAGGACGCCATGGGTCTGCGGTGTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCTTACCCACTGGGGGGGCTCGGCAGCCTGAGGAGCTCCCTCTTCCTGATGCAGAGCCCTCACTGCTCACTGCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 ATGGAGGAGGCAGGAGATCCCGCCGGACCCCGCTTGGAGGGCTGGGCCTGGAGCATGCATGGGTGCGGGGTCAA 370
Query 1 -------------------------------------ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAG------------- 24
..|.|| |||.|.| ||||.|.||
Sbjct 371 CGCCTCAGGAGACTTGGAGCTTGGGAGCCCCCTGTTCTGGGAC-ACTTGTG-GCCGTCCAGCTGCTGCCCTGGG 442
Query 25 -ATC----------GGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC 87
||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 AATCCACACCTGGAAGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC 516
Query 88 TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG 590
Query 162 GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA 664
Query 236 ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATGGCAGAAA 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 665 ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATG---GAAA 735
Query 310 GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA 809
Query 384 GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC 883
Query 458 CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC 957
Query 532 ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG 1031
Query 606 TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC 1105
Query 680 AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA 1179
Query 754 GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC 1253
Query 828 TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC 1327
Query 902 CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG 1401
Query 976 CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTATGC 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTAT-- 1473
Query 1050 AGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG 1123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 -GGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG 1546
Query 1124 GTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAACGTG 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 GTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAACGTG 1620
Query 1198 CAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC 1221
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC 1644