Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03094
• Subject: XM_011248502.1
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1131
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATG-----TAC-------------AAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAG  56
            |||     |||             .|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCTCTCTACTCTTCTCCCTCTGGAGATGAACATCTGCAACAAACCCTCCAACAAGACAGCCCCCGAGAAGAG  74

Query   57  TGTGTGGACGGCACCGGCACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGT  130
            |||||||||.||.||..|||||..|||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|
Sbjct   75  TGTGTGGACAGCGCCCTCACAGGACAGTGGGCCTTCCCCAGAACTGCAGGGCCAGCGCTCTCGAAGGAATGGAT  148

Query  131  GGAGCTGGCCCCCTCACCCGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGG  204
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  149  GGAGCTGGCCGCCCCACCCGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTCTACCTCTTCTTCGCGGTGATTGGCTTTGGG  222

Query  205  ATCCTTGTTCCCCTCCTGCCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCA  278
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCTTGTTCCCCTCTTGCCTCACCACTGGGTGCCTGCTGGCTATGCTTGCATGGGGGCCATCTTTGCTGGCCA  296

Query  279  CCTTGTGGTGCACCTGACCGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGC  352
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||
Sbjct  297  CCTTGTGGTGCACCTGACTGCTGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAATGTGCGGGACAAGAGCTACTCTGGGC  370

Query  353  CCCTGCCCATCTTCAACCGAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGAT  426
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.
Sbjct  371  CCCTGCCCATCTTCAACCGCAGCCAGCATGCGCATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACCTATGCGACGTGGAC  444

Query  427  GTGAGCGCTCGCTCCAAGCACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCT  500
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  GTGAGTGCGCGATCCAAACACTGCAGCGCCTGCAATAAGTGCGTATGCGGCTTCGATCACCATTGCAAGTGGCT  518

Query  501  CAACAACTGTGTGGGCGAGCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGC  574
            |||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||
Sbjct  519  CAACAACTGCGTGGGCGAGAGGAACTATCGGCTCTTTCTACACAGTGTGGCATCTGCTTTATTGGGTGTCCTGC  592

Query  575  TCCTGGTGCTGGTGGCCACATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACAC  648
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||
Sbjct  593  TCCTGGTGCTGGTGGCCACTTATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGACTTCGTACCAACCAACAC  666

Query  649  TTTGAAGTCCTGAAGAATCACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCC  722
            |||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTTGAAGTCTTGAAGAACCACACGGATGTGTGGTTTGTGTTCTTGCCTGCTGCCCCTGTGGAGACCCAGGCTCC  740

Query  723  TGCCATCCTGGCCCTGGCCGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  TGCCATCCTGGCCCTGGCCGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTGCTTTCTACAGCCCTGCTTGGCCACCTGCTCT  814

Query  797  GCTTCCACATTTATCTCATGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAG  870
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.
Sbjct  815  GCTTCCACATTTATCTAATGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAATACATCGTGCAGCACCGTCCAGCTCAGGAA  888

Query  871  GCCAAGGGGGTTCACAGGGAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACAT  944
            ||.||||.|...||||.||||||.||||||||.||.|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCAAAGGAGACCCACAAGGAGCTGGAGTCATGCCCCCGCAAGGTGCGGTCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACAT  962

Query  945  GCGGACCTTCAGACATATGCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTC  1018
            |.||||||||||.|||.||||.|||||||||.||||||||||..||.||||||||.|.||||||||        
Sbjct  963  GAGGACCTTCAGCCATGTGCGTCCAGAGCCCTCTGGCCAGGCTAGGACAGCAGCATTAAATGCCAA--------  1028

Query 1019  GCCCTGCCTCCCCGGATCCGACCCCAGGTAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGA  1092
                                                                                      
Sbjct 1029  --------------------------------------------------------------------------  1028

Query 1093  AAGAAGCCTCTACCCTGGCGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCTCTG  1166
                                                                                      
Sbjct 1029  --------------------------------------------------------------------------  1028

Query 1167  CAGAAAAAGAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCG---GC------------  1225
               ||||||||||||.||||.|||||||.|.|||..|.|||||.|..||.||| |||   ||            
Sbjct 1029  ---AAAAAGAGGAAGCGGCGAGTGTATAGATTGCCCAGGTCTGGGGTCTTGGA-CCGAGAGCTCCCACTGCCCA  1098

Query 1226  -GT--CGGG-GCCTAGGGCCCCCAGCCGCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGAC----GCCAGCCCTGT  1291
             ||  |||| |.||.||.|.||.|||||||||||||||||.||..|.||||||    ||    ||||||||.||
Sbjct 1099  GGTTACGGGAGACTGGGACTCCTAGCCGCCGCTCCAGCTCTTCATCTGATTCC----ACCAGTGCCAGCCCAGT  1168

Query 1292  GCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACTCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGA  1365
            |||.||.|.||||.||||.|||||||||.|||||||.||.||.||||||.||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1169  GCATGCTGGTGGCTCTGCAGGCGCCTACTACTCGGCATCAGCTGAGTCCATGGAAGAGATTCCAGTGGCCCAGA  1242

Query 1366  CGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCGCGGGGCC-GGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCG  1438
            |||||||||||||.|||||.||||..||||| .||.||| ||||.|||.||.|...||||||.|..|||||.||
Sbjct 1243  CGCGCCTGGGCAGTGCCGCACTGGGTGCCCC-AGGAGCCAGGGGTCGAGAGTCTGGGCTGGCTCTACAGGCACG  1315

Query 1439  TGCGCCCGCCGTTTTCG  1455
            |.||||.||.|||||.|
Sbjct 1316  TTCGCCTGCTGTTTTTG  1332