Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03116
• Subject: XM_011538248.2
• Aligned Length: 3072
• Identities: 1857
• Gaps: 1215

Alignment

Query    1  ATGGGGGAAGACGACGCCGCGCTTCGGGCTGGCAGCAGGGGGCTCTCCGACCCGTGGGCAGACTCAGTGGGAGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCCGTACACAAGCGGCTTGTGCTGGCCTTCGCTGTGTCCCTCGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CATTGCTCGCGGTCACAATGCTCGCTGTGCTGCTCAGCCTGCGCTTCGACGAGTGCGGGGCGAGTGCCACGCCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGCGCCGACGGTGGCCCCTCAGGCTTTCCGGAGCGCGGCGGCAACGGGAGCCTCCCTGGATCGGCCCGGCGCAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCACCACGCAGGCGGGGACTCCTGGCAGCCCGAGGCGGGTGGGGTGGCCAGTCCGGGGACCACGTCGGCCCAGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CGCCGTCGGAGGAGGAGCGGGAGCCGTGGGAGCCGTGGACGCAGCTGCGCCTGTCGGGCCACCTGAAGCCGCTG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CACTACAATCTGATGCTCACCGCCTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCCGGGGAGGTCAACGTGGAGATCGCGTG  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CCGGAACGCCACCCGCTACGTAGTGCTGCACGCTTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAAGTGCAGCTGGCCGAGGACC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  GGGCGTTCGGGGCTGTCCCTGTAGCCGGTTTTTTCCTCTACCCGCAAACCCAGGTCTTAGTGGTGGTGCTGAAT  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  AGGACACTGGACGCGCAGAGGAATTACAATCTGAAGATTATCTACAACGCGCTCATCGAGAATGAGCTCCTGGG  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  CTTCTTCCGCAGCTCCTATGTGCTCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCGCCTACACATG  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  CCAGAAAGGCATTTCCTTGTTTTGATGAGCCAATCTACAAGGCTACTTTCAAAATCAGCATCAAGCATCAAGCA  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  ACCTATTTATCTTTATCTAATATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATCACTT  962
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  963  TTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACTACCA  1036
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1037  CCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGCTCTC  1110
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1111  CATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAGATCT  1184
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 1185  TTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGAATAC  1258
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------ATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGAATAC  43

Query 1259  TGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATGTCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  TGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATGTCAC  117

Query 1333  CAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACTACTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  CAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACTACTT  191

Query 1407  TGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTTCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  TGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTTCTGC  265

Query 1481  ATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGATATT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  ATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGATATT  339

Query 1555  GACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGGGCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  GACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGGGCCA  413

Query 1629  TTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGATCTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  TTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGATCTCT  487

Query 1703  GGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTGGACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  GGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTGGACA  561

Query 1777  CTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCCAACA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  CTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCCAACA  635

Query 1851  GCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAGATTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  GCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAGATTC  709

Query 1925  CATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATCAGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATCAGAG  783

Query 1999  CACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTAGAGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  CACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTAGAGT  857

Query 2073  CAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTCAGTA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTCAGTA  931

Query 2147  ACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCTGGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  ACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCTGGAG  1005

Query 2221  ATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTCTAGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  ATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTCTAGA  1079

Query 2295  TAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACATATA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  TAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACATATA  1153

Query 2369  TCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACTACGT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  TCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACTACGT  1227

Query 2443  AGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTTCAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  AGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTTCAGA  1301

Query 2517  TTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCACTAC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  TTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCACTAC  1375

Query 2591  TGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAATATTA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  TGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAATATTA  1449

Query 2665  TTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTGAGGT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  TTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTGAGGT  1523

Query 2739  GGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCCTGGA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  GGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCCTGGA  1597

Query 2813  AGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACTCATC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598  AGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACTCATC  1671

Query 2887  AGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATGATGG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672  AGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATGATGG  1745

Query 2961  GGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTACCAAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746  GGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTACCAAG  1819

Query 3035  ACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC  3072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820  ACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC  1857