Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03129
• Subject: NM_015774.3
• Aligned Length: 1405
• Identities: 1218
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGGCCGCGGCTGGGGATT-CTTGTTTGGCCTCCTGGGCGCCGTGTGGCTGCTCAGCTCGGGCCACGGAGAGG  73
            ||||||||||.||||||.|| ||.| ||||.||||||||||.||||||||||||..|||.|||||||||.||||
Sbjct    1  ATGGGCCGCGCCTGGGGCTTGCTCG-TTGGACTCCTGGGCGTCGTGTGGCTGCTGCGCTTGGGCCACGGCGAGG  73

Query   74  AGCAGCCCCCGGAGACAGCGGCACAGAGGTGCTTCTGCCAGGTTAGTGGTTACTTGGATGATTGTACCTGTGAT  147
            |||.||..||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||
Sbjct   74  AGCGGCGGCCGGAGACAGCGGCACAGCGCTGCTTCTGCCAGGTTAGTGGTTACCTGGACGACTGTACCTGTGAT  147

Query  148  GTTGAAACCATTGATAGATTTAATAACTACAGGCTTTTCCCAAGACTACAAAAACTTCTTGAAAGTGACTACTT  221
            ||.||.|||||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GTCGAGACCATCGATAAGTTTAATAACTACAGACTTTTCCCAAGACTACAAAAGCTTCTTGAAAGTGACTACTT  221

Query  222  TAGGTATTACAAGGTAAACCTGAAGAGGCCGTGTCCTTTCTGGAATGACATCAGCCAGTGTGGAAGAAGGGACT  295
            |||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct  222  TAGATATTACAAGGTGAACTTGAAGAAGCCTTGTCCTTTCTGGAATGACATCAACCAGTGTGGAAGAAGAGACT  295

Query  296  GTGCTGTCAAACCATGTCAATCTGATGAAGTTCCTGATGGAATTAAATCTGCGAGCTACAAGTATTCTGAAGAA  369
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  296  GTGCCGTCAAACCCTGCCATTCTGATGAAGTTCCTGATGGAATTAAGTCTGCGAGCTACAAGTATTCTGAGGAA  369

Query  370  GCCAATAATCTCATTGAAGAATGTGAACAAGCTGAACGACTTGGAGCAGTGGATGAATCTCTGAGTGAGGAAAC  443
            |||   ||.|.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  370  GCC---AACCGCATTGAAGAATGTGAGCAAGCTGAGCGACTTGGAGCCGTGGATGAGTCTCTGAGTGAGGAGAC  440

Query  444  ACAGAAGGCTGTTCTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCTTCAGATAACTTCTGTGAAGCTGATGACATTCAGT  517
            .|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||..|||.||.||.||||
Sbjct  441  CCAGAAAGCTGTACTTCAGTGGACCAAGCATGATGATTCGTCAGACAGCTTCTGCGAAATTGACGATATACAGT  514

Query  518  CCCCTGAAGCTGAATATGTAGATTTGCTTCTTAATCCTGAGCGCTACACTGGTTACAAGGGACCAGATGCTTGG  591
            ||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  515  CCCCCGATGCTGAGTATGTGGACTTACTCCTTAACCCTGAGCGCTACACAGGCTACAAGGGGCCAGACGCTTGG  588

Query  592  AAAATATGGAATGTCATCTACGAAGAAAACTGTTTTAAGCCACAGACAATTAAAAGACCTTTAAATCCTTTGGC  665
            |..|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||         .||||||||
Sbjct  589  AGGATATGGAGTGTCATCTATGAAGAAAACTGTTTTAAGCCACAGACAATTCAAAG---------GCCTTTGGC  653

Query  666  TTCTGGTCAAGGGACAAGTGAAGAGAACACTTTTTACAGTTGGCTAGAAGGTCTCTGTGTAGAAAAAAGAGCAT  739
            ||||||.|.|||.|.||||.||||||||||.|||||||..|||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  654  TTCTGGGCGAGGAAAAAGTAAAGAGAACACATTTTACAACTGGCTAGAAGGCCTCTGTGTAGAAAAGAGAGCAT  727

Query  740  TCTACAGACTTATATCTGGCCTACATGCAAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGATATCTTTTACAAGAGACC  813
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  728  TCTACAGACTTATATCTGGCCTGCACGCAAGCATTAATGTGCATTTGAGTGCAAGGTATCTTTTACAAGATACT  801

Query  814  TGGTTAGAAAAGAAATGGGGACACAACATTACAGAATTTCAACAGCGATTTGATGGAATTTTGACTGAAGGAGA  887
            |||.|.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  802  TGGCTGGAAAAGAAATGGGGTCACAATGTCACAGAGTTCCAGCAGCGCTTTGATGGGATTCTGACTGAAGGAGA  875

Query  888  AGGTCCAAGAAGGCTTAAGAACTTGTATTTTCTCTACTTAATAGAACTAAGGGCTTTATCCAAAGTGTTACCAT  961
            |||.|||.|||||||.|.|||||||||.||.||.|||.|.|||||..||||||||.|.|||||||||.|.||||
Sbjct  876  AGGCCCACGAAGGCTGAGGAACTTGTACTTCCTGTACCTGATAGAGTTAAGGGCTCTCTCCAAAGTGCTTCCAT  949

Query  962  TCTTCGAGCGCCCAGATTTTCAACTCTTTACTGGAAATAAAATTCAGGATGAGGAAAACAAAATGTTACTTCTG  1035
            |.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||||||..|||||||||..||||||||||
Sbjct  950  TTTTTGAGCGTCCAGATTTTCAGCTCTTCACTGGGAATAAAGTTCAGGATGCAGAAAACAAAGCGTTACTTCTG  1023

Query 1036  GAAATACTTCATGAAATCAAGTCATTTCCTTTGCATTTTGATGAGAATTCATTTTTTGCTGGGGATAAAAAAGA  1109
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1024  GAGATACTTCATGAAATCAAGTCATTTCCTTTGCACTTCGATGAGAATTCTTTTTTTGCTGGGGATAAAAACGA  1097

Query 1110  AGCACACAAACTAAAGGAGGACTTTCGACTGCATTTTAGAAATATTTCAAGAATTATGGATTGTGTTGGTTGTT  1183
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1098  AGCACATAAACTAAAGGAGGACTTCCGGCTACACTTTAGGAACATTTCAAGAATCATGGACTGTGTTGGCTGCT  1171

Query 1184  TTAAATGTCGTCTGTGGGGAAAGCTTCAGACTCAGGGTTTGGGCACTGCTCTGAAGATCTTATTTTCTGAGAAA  1257
            |.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1172  TCAAGTGCCGCCTGTGGGGCAAGCTTCAGACGCAGGGGCTGGGCACTGCTCTGAAGATCTTGTTTTCCGAAAAA  1245

Query 1258  TTGATAGCAAATATGCCAGAAAGTGGACCTAGTTATGAATTCCATCTAACCAGACAAGAAATAGTATCATTATT  1331
            .||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1246  CTGATCGCAAATATGCCGGAAAGCGGACCAAGTTATGAGTTCCAGCTAACCAGACAAGAAATAGTATCACTGTT  1319

Query 1332  CAACGCATTTGGAAGAATTTCTACAAGTGTGAAAGAATTAGAAAACTTCAGGAACTTGTTACAGAATATTCAT  1404
            .||.|||||||||||.|||||.||||||||||.||||.||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.
Sbjct 1320  TAATGCATTTGGAAGGATTTCCACAAGTGTGAGAGAACTAGAGAACTTCAGGCACTTGTTACAGAATGTTCAC  1392