Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03189
• Subject: NM_001320227.1
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1507
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGAGTATATGGCAGAATCCACCGACCGCAGCCCTGGACACATCTTGTGCTGTGAGTGTGGTGTTCCGATAAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTATATGGCAGAATCCACCGACCGCAGCCCTGGACACATCTTGTGCTGTGAGTGTGGTGTTCCGATAAG  74

Query   75  TCCAAATCCTGCCAATATTTGTGTGGCCTGTTTGCGAAGTAAAGTGGACATCAGCCAAGGTATTCCGAAACAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCAAATCCTGCCAATATTTGTGTGGCCTGTTTGCGAAGTAAAGTGGACATCAGCCAAGGTATTCCGAAACAAG  148

Query  149  TCTCGATTTCGTTCTGCAAACAATGTCAAAGGTATTTTCAACCACCAGGAACTTGGATACAGTGTGCTTTAGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCGATTTCGTTCTGCAAACAATGTCAAAGGTATTTTCAACCACCAGGAACTTGGATACAGTGTGCTTTAGAA  222

Query  223  TCCAGGGAACTTCTTGCTTTGTGCTTGAAAAAAATCAAAGCCCCTCTGAGTAAGGTACGGCTTGTAGATGCAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAGGGAACTTCTTGCTTTGTGCTTGAAAAAAATCAAAGCCCCTCTGAGTAAGGTACGGCTTGTAGATGCAGG  296

Query  297  CTTTGTTTGGACTGAGCCTCATTCTAAGAGACTTAAAGTTAAACTGACTATTCAGAAAGAGGTGATGAATGGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTTGTTTGGACTGAGCCTCATTCTAAGAGACTTAAAGTTAAACTGACTATTCAGAAAGAGGTGATGAATGGTG  370

Query  371  CTATCCTTCAACAAGTGTTTGTGGTGGATTATGTTGTTCAGTCCCAAATGTGTGGAGATTGCCATAGAGTAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTATCCTTCAACAAGTGTTTGTGGTGGATTATGTTGTTCAGTCCCAAATGTGTGGAGATTGCCATAGAGTAGAA  444

Query  445  GCTAAGGATTTCTGGAAGGCTGTGATTCAAGTGAGGCAAAAGACTTTGCATAAAAAAACTTTCTACTATCTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTAAGGATTTCTGGAAGGCTGTGATTCAAGTGAGGCAAAAGACTTTGCATAAAAAAACTTTCTACTATCTGGA  518

Query  519  ACAGTTAATTCTGAAATATGGAATGCATCAGAATACACTTCGTATCAAAGAGATTCATGATGGTCTGGATTTTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGTTAATTCTGAAATATGGAATGCATCAGAATACACTTCGTATCAAAGAGATTCATGATGGTCTGGATTTTT  592

Query  593  ATTATTCCTCAAAACAACATGCTCAGAAGATGGTCGAATTTCTTCAGTGTACAGTTCCCTGTAGATACAAAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTATTCCTCAAAACAACATGCTCAGAAGATGGTCGAATTTCTTCAGTGTACAGTTCCCTGTAGATACAAAGCA  666

Query  667  TCACAAAGACTGATCTCTCAAGATATCCATAGTAACACATACAATTACAAAAGCACTTTTTCTGTGGAAATTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCACAAAGACTGATCTCTCAAGATATCCATAGTAACACATACAATTACAAAAGCACTTTTTCTGTGGAAATTGT  740

Query  741  TCCAATATGCAAGGATAATGTTGTCTGTCTGTCTCCAAAACTGGCACAAAGCCTGGGAAATATGAACCAGATTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCAATATGCAAGGATAATGTTGTCTGTCTGTCTCCAAAACTGGCACAAAGCCTGGGAAATATGAACCAGATTT  814

Query  815  GTGTGTGTATTCGAGTAACCAGTGCCATTCACCTCATTGATCCAAACACCCTACAAGTGGCAGATATTGATGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGTGTGTATTCGAGTAACCAGTGCCATTCACCTCATTGATCCAAACACCCTACAAGTGGCAGATATTGATGGG  888

Query  889  AGCACTTTCTGGAGTCACCCTTTCAATAGTTTATGTCATCCCAAACAGCTAGAGGAGTTTATTGTGATGGAATG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCACTTTCTGGAGTCACCCTTTCAATAGTTTATGTCATCCCAAACAGCTAGAGGAGTTTATTGTGATGGAATG  962

Query  963  CAGCATAGTCCAAGATATAAAACGTGCTGCAGGTGCTGGAATGATATCAAAAAAGCATACCCTCGGGGAAGTCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCATAGTCCAAGATATAAAACGTGCTGCAGGTGCTGGAATGATATCAAAAAAGCATACCCTCGGGGAAGTCT  1036

Query 1037  GGGTACAGAAGACATCTGAAATGAATACAGATAAACAGTATTTTTGTCGTACTCATTTGGGACATCTTCTAAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGTACAGAAGACATCTGAAATGAATACAGATAAACAGTATTTTTGTCGTACTCATTTGGGACATCTTCTAAAT  1110

Query 1111  CCCGGAGACCTGGTGTTAGGGTTTGATTTGGCCAACTGTAACTTAAATGATGAGCATGTCAACAAAATGAACTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCGGAGACCTGGTGTTAGGGTTTGATTTGGCCAACTGTAACTTAAATGATGAGCATGTCAACAAAATGAACTC  1184

Query 1185  AGATAGAGTTCCAGATGTGGTATTAATCAAGAAGAGCTATGACCGGACCAAACGTCAGCGTCGTAGAAACTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATAGAGTTCCAGATGTGGTATTAATCAAGAAGAGCTATGACCGGACCAAACGTCAGCGTCGTAGAAACTGGA  1258

Query 1259  AATTGAAAGAGCTTGCAAGAGAGAGAGAAAACATGGATACAGATGATGAAAGGCAATACCAAGATTTTCTTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATTGAAAGAGCTTGCAAGAGAGAGAGAAAACATGGATACAGATGATGAAAGGCAATACCAAGATTTTCTTGAA  1332

Query 1333  GATCTTGAAGAAGATGAGGCAATTCGAAAAAATGTCAACATTTACAGAGATTCAGCCATCCCTGTGGAAAGTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATCTTGAAGAAGATGAGGCAATTCGAAAAAATGTCAACATTTACAGAGATTCAGCCATCCCTGTGGAAAGTGA  1406

Query 1407  CACCGATGATGAAGGAGCACCTCGAATTAGTCTGGCTGAGATGCTTGAAGACCTTCATATTTCCCAAGATGCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACCGATGATGAAGGAGCACCTCGAATTAGTCTGGCTGAGATGCTTGAAGACCTTCATATTTCCCAAGATGCCA  1480

Query 1481  CTGGTGAAGAAG------GTGCA--TCAA--TGCTGA--------CA---------------------------  1509
            ||||||||||||      .||||  |.||  ||||||        ||                           
Sbjct 1481  CTGGTGAAGAAGCCAAATCTGCACCTGAAGCTGCTGATTTAGAGTCAGAAGTCACTGAGGGGCCAAGTGTGGTG  1554

Query 1510  ---------------------------------  1509
                                             
Sbjct 1555  GTTGACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC  1587