Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03189
- Subject:
- NM_133787.2
- Aligned Length:
- 1509
- Identities:
- 1379
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGAGTATATGGCAGAATCCACCGACCGCAGCCCTGGACACATCTTGTGCTGTGAGTGTGGTGTTCCGATAAG 74
||||||||.||||||||.||||..||.|.||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 1 ATGGAGTACATGGCAGAGTCCATTGAGCACAGCCCGGGACACATCTTGTGCTGTGAATGTGGTGTCCCAATTAG 74
Query 75 TCCAAATCCTGCCAATATTTGTGTGGCCTGTTTGCGAAGTAAAGTGGACATCAGCCAAGGTATTCCGAAACAAG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.|
Sbjct 75 TCCAAATCCTGCCAATATTTGTGTGGCCTGTTTACGAAGTAAAGTTGACATCAGCCAAGGTGTTCCAAAGCAGG 148
Query 149 TCTCGATTTCGTTCTGCAAACAATGTCAAAGGTATTTTCAACCACCAGGAACTTGGATACAGTGTGCTTTAGAA 222
||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||.|.|.|||.||||||||||||||||.
Sbjct 149 TCTCCATTTCTTTCTGCAAACAGTGTCAGAGATATTTTCAGCCACCAGCATCATGGGTACAGTGTGCTTTAGAG 222
Query 223 TCCAGGGAACTTCTTGCTTTGTGCTTGAAAAAAATCAAAGCCCCTCTGAGTAAGGTACGGCTTGTAGATGCAGG 296
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 223 TCCAGGGAACTTCTTGCTTTGTGTTTGAAAAAAATTAAAGCTCCTCTGAGTAAGGTTCGGCTTGTCGATGCAGG 296
Query 297 CTTTGTTTGGACTGAGCCTCATTCTAAGAGACTTAAAGTTAAACTGACTATTCAGAAAGAGGTGATGAATGGTG 370
||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTTGTTTGGACTGAGCCCCATTCCAAGAGACTTAAAGTTAAATTGACAATTCAGAAAGAGGTGATGAATGGTG 370
Query 371 CTATCCTTCAACAAGTGTTTGTGGTGGATTATGTTGTTCAGTCCCAAATGTGTGGAGATTGCCATAGAGTAGAA 444
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 371 CTATCCTGCAGCAAGTGTTTGTGGTGGATTATGTTGTTCAGTCCCAAATGTGTGGAGACTGCCATAGAGTGGAA 444
Query 445 GCTAAGGATTTCTGGAAGGCTGTGATTCAAGTGAGGCAAAAGACTTTGCATAAAAAAACTTTCTACTATCTGGA 518
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GCTAAGGATTTCTGGAAGGCTGTGATCCAAGTCAGGCAAAAGACTCTACACAAGAAAACATTCTACTATCTGGA 518
Query 519 ACAGTTAATTCTGAAATATGGAATGCATCAGAATACACTTCGTATCAAAGAGATTCATGATGGTCTGGATTTTT 592
||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACAGTTGATTTTAAAATATGGAATGCATCAGAATACACTGCGTATCAAGGAGATTCATGATGGTCTGGATTTTT 592
Query 593 ATTATTCCTCAAAACAACATGCTCAGAAGATGGTCGAATTTCTTCAGTGTACAGTTCCCTGTAGATACAAAGCA 666
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATTATTCTTCAAAACAGCATGCTCAGAAGATGGTGGAGTTTCTTCAGGGTATAGTTCCCTGTAGATACAAAGCA 666
Query 667 TCACAAAGACTGATCTCTCAAGATATCCATAGTAACACATACAATTACAAAAGCACTTTTTCTGTGGAAATTGT 740
|||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCACAAAGATTGATCTCTCAGGATATTCATAGTAACACATACAATTACAAGAGTACTTTTTCTGTGGAAATTGT 740
Query 741 TCCAATATGCAAGGATAATGTTGTCTGTCTGTCTCCAAAACTGGCACAAAGCCTGGGAAATATGAACCAGATTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|
Sbjct 741 TCCAATATGCAAGGATAATGTTGTCTGTCTATCACCAAAACTGGCACAGAGCCTTGGAAATATGAGTCAGATAT 814
Query 815 GTGTGTGTATTCGAGTAACCAGTGCCATTCACCTCATTGATCCAAACACCCTACAAGTGGCAGATATTGATGGG 888
||.|.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 815 GTATTTGTATACGAGTAACTAGTGCCATCCACCTCATAGACCCAAATACCCTACAAGTTGCAGATATTGATGGA 888
Query 889 AGCACTTTCTGGAGTCACCCTTTCAATAGTTTATGTCATCCCAAACAGCTAGAGGAGTTTATTGTGATGGAATG 962
|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 AACACTTTCTGGAGTCATCCTTTCAATAGTTTATGCCATCCTAAACAGCTCGAAGAGTTTATTGTGATAGAATG 962
Query 963 CAGCATAGTCCAAGATATAAAACGTGCTGCAGGTGCTGGAATGATATCAAAAAAGCATACCCTCGGGGAAGTCT 1036
|||||.|||||.||||.|.||.||...|||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 963 CAGCACAGTCCGAGATCTGAAGCGAAGTGCGGGGGCTGGAGTGATATCAAAAAAGCACACCCTTGGGGAAGTCT 1036
Query 1037 GGGTACAGAAGACATCTGAAATGAATACAGATAAACAGTATTTTTGTCGTACTCATTTGGGACATCTTCTAAAT 1110
||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1037 GGATCCAGAAGACATCTGAAATGAATACAGATAAACAGTATTTTTGCCGAACTCACTTGGGACATCTTTTAAAT 1110
Query 1111 CCCGGAGACCTGGTGTTAGGGTTTGATTTGGCCAACTGTAACTTAAATGATGAGCATGTCAACAAAATGAACTC 1184
||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTGGAGACCTGGTGCTGGGATTTGATTTGGCCAACTGTAACTTAAATGATGAGTATGTCAACAAAATGAACTC 1184
Query 1185 AGATAGAGTTCCAGATGTGGTATTAATCAAGAAGAGCTATGACCGGACCAAACGTCAGCGTCGTAGAAACTGGA 1258
|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1185 AGACAGAGTTCCAGATGTGGTGTTAATTAAGAAGAGCTATGACCGCACCAAACGCCAGCGCCGTAGAAACTGGA 1258
Query 1259 AATTGAAAGAGCTTGCAAGAGAGAGAGAAAACATGGATACAGATGATGAAAGGCAATACCAAGATTTTCTTGAA 1332
||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 AACTGAAAGAGCTTGCAAGAGACAGAGAAAACATGGACACAGATGATGAAAGGCAATATCAAGATTTTCTTGAA 1332
Query 1333 GATCTTGAAGAAGATGAGGCAATTCGAAAAAATGTCAACATTTACAGAGATTCAGCCATCCCTGTGGAAAGTGA 1406
||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATCTTGAAGAAGATGAGGCAATTAGAAAACATGTCAACATTTACAGAGATGCAACCATCCCTGTGGAAAGTGA 1406
Query 1407 CACCGATGATGAAGGAGCACCTCGAATTAGTCTGGCTGAGATGCTTGAAGACCTTCATATTTCCCAAGATGCCA 1480
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407 CACAGATGATGAAGGAGCACCTCGAATTAGTCTGGCTGAGATGCTTGAAGACCTTCATATTTCTCAAGATGCCA 1480
Query 1481 CTGGTGAAGAAGGTGCATCAATGCTGACA 1509
|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1481 CTGGTGAAGAAGGTGCATCAATGATGTCA 1509