Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03199
• Subject: NM_001199327.1
• Aligned Length: 963
• Identities: 705
• Gaps: 235

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MRAVRRGLREGGAMAAARDPPEVSLREATQRKLRRFSELRGKLVARGEFWDIVAITAADEKQELAYNQQLSEKL  74

Query   1  ---------------------MGNYKSRPTQTC----------------------TDEWKKKVSESYVITIERL  31
                                .||..|   ..|                      .||||||||||||||||||
Sbjct  75  KRKELPLGVQYHVFVDPAGAKIGNGGS---TLCALQCLEKLYGDKWNSFTILLIHSDEWKKKVSESYVITIERL  145

Query  32  EDDLQIKEKELTELRNIFGSDEAFSKVNLNYRTENGLSLLHLCCICGGKKSHIRTLMLKGLRPSRLTRNGFTAL  105
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146  EDDLQIKEKELTELRNIFGSDEAFSKVNLNYRTENGLSLLHLCCICGGKKSHIRTLMLKGLRPSRLTRNGFTAL  219

Query 106  HLAVYKDNAELITSLLHSGADIQQVGYGGLTALHIATIAGHLEAADVLLQHGANVNIQDAVFFTPLHIAAYYGH  179
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220  HLAVYKDNAELITSLLHSGADIQQVGYGGLTALHIATIAGHLEAADVLLQHGANVNIQDAVFFTPLHIAAYYGH  293

Query 180  EQVTRLLLKFGADVNVSGEVGDRPLHLASAKGFLNIAKLLMEEGSKADVNAQDNEDHVPLHFCSRFGHHDIVKY  253
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294  EQVTRLLLKFGADVNVSGEVGDRPLHLASAKGFLNIAKLLMEEGSKADVNAQDNEDHVPLHFCSRFGHHDIVKY  367

Query 254  LLQSDLEVQPHVVNIYGDTPLHLACYNGKFEVAKEIIQISGTESLTKENIFSETAFHSACTYGKSIDLVKFLLD  327
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368  LLQSDLEVQPHVVNIYGDTPLHLACYNGKFEVAKEIIQISGTESLTKENIFSETAFHSACTYGKSIDLVKFLLD  441

Query 328  QNVININHQGRDGHTGLHSACYHGHIRLVQFLLDNGADMNLVACDPSRSSGEKDEQTCLMWAYEKGHDAIVTLL  401
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442  QNVININHQGRDGHTGLHSACYHGHIRLVQFLLDNGADMNLVACDPSRSSGEKDEQTCLMWAYEKGHDAIVTLL  515

Query 402  KHYKRPQDELPCNEYSQPGGDGSYVSVPSPLGKIKSMTKEKADILLLRAGLPSHFHLQLSEIEFHEIIGSGSFG  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516  KHYKRPQDELPCNEYSQPGGDGSYVSVPSPLGKIKSMTKEKADILLLRAGLPSHFHLQLSEIEFHEIIGSGSFG  589

Query 476  KVYKGRCRNKIVAIKRYRANTYCSKSDVDMFCREVSILCQLNHPCVIQFVGACLNDPSQFAIVTQYISGGSLFS  549
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590  KVYKGRCRNKIVAIKRYRANTYCSKSDVDMFCREVSILCQLNHPCVIQFVGACLNDPSQFAIVTQYISGGSLFS  663

Query 550  LLHEQKRILDLQSKLIIAVDVAKGMEYLHNLTQPIIHRDLNSHNILLYEDGHAVVADFGESRFLQSLDEDNMTK  623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664  LLHEQKRILDLQSKLIIAVDVAKGMEYLHNLTQPIIHRDLNSHNILLYEDGHAVVADFGESRFLQSLDEDNMTK  737

Query 624  QPGNLRWMAPEVFTQCTRYTIKADVFSYALCLWEILTGEIPFAHLKPAAAAADMAYHHIRPPIGYSIPKPISSL  697
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738  QPGNLRWMAPEVFTQCTRYTIKADVFSYALCLWEILTGEIPFAHLKPAAAAADMAYHHIRPPIGYSIPKPISSL  811

Query 698  LIRGWNACPE--GRPE-------FSEVVMKLEECLCN--IELMSPASSNSSGSLSPSSSSDCLVNRGGPGRSHV  760
           ||||||||||  .||.       ..|...|..|....  ||....                             
Sbjct 812  LIRGWNACPEAKSRPSHYPVSSVYTETLKKKNEDRFGMWIEYLRR-----------------------------  856

Query 761  AALRSRFELEYALNARSYAALSQSAGQYSSQGLSLEEMKRSLQYTPIDKYGYVSDPMSSMHFHSCRNSSSFEDS  834
                                                                                     
Sbjct 857  --------------------------------------------------------------------------  856

Query 835  S  835
            
Sbjct 857  -  856