Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03217
• Subject: NM_023248.2
• Aligned Length: 750
• Identities: 662
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGTCGATCTTCACCCCCACCAACCAGATCCGCCTAACCAATGTGGCCGTGGTACGGATGAAGCGTGCCGGGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|..|||||
Sbjct   1  ATGTCGATCTTCACCCCCACCAACCAGATCCGACTGACCAATGTGGCCGTGGTGCGGATGAAGCGGGGAGGGAA  74

Query  75  GCGCTTCGAAATCGCCTGCTACAAAAACAAGGTCGTCGGCTGGCGGAGCGGCGTGGAAAAAGACCTCGATGAAG  148
           |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  75  GCGCTTCGAAATCGCCTGCTATAAAAACAAGGTCGTCGGCTGGCGGAGTGGCGTGGAAAAAGACCTTGATGAAG  148

Query 149  TTCTGCAGACCCACTCAGTGTTTGTAAATGTTTCTAAAGGTCAGGTTGCCAAAAAGGAAGATCTCATCAGTGCG  222
           |||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149  TTCTGCAGACCCATTCAGTGTTTGTAAATGTTTCCAAAGGTCAGGTTGCCAAGAAGGAAGACCTCATCAGTGCA  222

Query 223  TTTGGAACAGATGACCAAACTGAAATCTGTAAGCAGATTTTGACTAAAGGAGAAGTTCAAGTATCAGATAAAGA  296
           |||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223  TTTGGGACAGACGACCAGACTGAAATCTGCAAGCAGATTTTGACTAAAGGAGAAGTTCAAGTGTCAGATAAAGA  296

Query 297  AAGACACACACAACTGGAGCAGATGTTTAGGGACATTGCAACTATTGTGGCAGACAAATGTGTGAATCCTGAAA  370
           |.|.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 297  ACGGCACACACAGCTGGAGCAGATGTTTAGGGATATCGCCACCATTGTGGCAGACAAGTGTGTGAACCCAGAAA  370

Query 371  CAAAGAGACCATACACCGTGATCCTTATTGAGAGAGCCATGAAGGACATCCACTATTCGGTGAAAACCAACAAG  444
           ||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||
Sbjct 371  CAAAGAGACCTTACACCGTTATCCTCATCGAGAGAGCCATGAAGGACATCCACTACTCCGTGAAACCCAACAAG  444

Query 445  AGTACAAAACAGCAGGCTTTGGAAGTGATAAAGCAGTTAAAAGAGAAAATGAAGATAGAACGTGCTCACATGAG  518
           ||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||.|
Sbjct 445  AGCACAAAGCAACAGGCTTTGGAAGTGATAAAGCAGCTGAAAGAGAAGATGAAGATAGAGCGGGCCCACATGCG  518

Query 519  GCTTCGGTTCATCCTTCCAGTCAATGAAGGCAAGAAGCTGAAAGAAAAGCTCAAGCCACTGATCAAGGTCATAG  592
           ..|.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 519  ATTGCGCTTCATCCTGCCAGTGAACGAAGGGAAGAAGCTGAAGGAGAAGCTGAAGCCACTGATGAAGGTGGTGG  592

Query 593  AAAGTGAAGATTATGGCCAACAGTTAGAAATCGTATGTCTGATTGACCCGGGCTGCTTCCGAGAAATTGATGAG  666
           |.|||||.||.||..||||.|||.|.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 593  AGAGTGAGGACTACAGCCAGCAGCTGGAGATCGTGTGCCTCATCGACCCAGGCTGCTTCAGAGAAATTGATGAG  666

Query 667  CTAATAAAAAAGGAAACTAAAGGCAAAGGTTCTTTGGAAGTACTCAATCTGAAAGATGTAGAAGAAGGAGATGA  740
           |||||||||||||||||.|||||||..||||||.|||||||.||||.||||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 667  CTAATAAAAAAGGAAACGAAAGGCAGGGGTTCTCTGGAAGTGCTCAGTCTGAAGGACGTGGAGGAAGGCGATGA  740

Query 741  GAAATTTGAA  750
           |||.||||||
Sbjct 741  GAAGTTTGAA  750