Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03237
• Subject: XM_005263046.3
• Aligned Length: 1255
• Identities: 1181
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC  74

Query   75  CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT  148

Query  149  TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA  222

Query  223  CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG  296

Query  297  AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC  370

Query  371  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  444

Query  445  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  518

Query  519  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  592

Query  593  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  666

Query  667  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  740

Query  741  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  814

Query  815  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  888

Query  889  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  962

Query  963  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  1036

Query 1037  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  1110

Query 1111  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGTACAGGTCCAAGAATGAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    |.||.|| 
Sbjct 1111  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGT---GG----AAAACGA-  1176

Query 1185  AGCTGCCTACATC----------------------------------------------------------  1197
            ||||     |||.                                                          
Sbjct 1177  AGCT-----CATTCCCAACGTGCAAAGCCAAGGCAGCGACCCCAGGACCTCTTCTGGAGATGGAAGCTTGT  1242