Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03237
• Subject: XM_006714233.1
• Aligned Length: 1255
• Identities: 836
• Gaps: 416

Alignment

Query    1  ATGCCCCAACTCTCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCGGGGGGGACCCGGAACTCTGCGCCACGGACGAGATGATCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTCAAGGACGAGGGCGATCCTCAGAAGGAAAAGATCTTCGCCGAGATCAGTCATCCCGAAGAGGAAGGCGATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAGCTGACATCAAGTCTTCCTTGGTGAACGAGTCTGAAATCATCCCGGCCAGCAACGGACACGAGGTGGCCAGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAAGCACAAACCTCTCAGGAGCCCTACCACGACAAGGCCAGAGAACACCCCGATGACGGAAAGCATCCAGATGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGGCCTCTACAACAAGGGACCCTCCTACTCGAGTTATTCCGGGTACATAATGATGCCAAATATGAATAACGACC  370
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGATGCCAAATATGAATAACGACC  25

Query  371  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  CATACATGTCAAATGGATCTCTTTCTCCACCCATCCCGAGAACATCAAATAAAGTGCCCGTGGTGCAGCCATCC  99

Query  445  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CATGCGGTCCATCCTCTCACCCCCCTCATCACTTACAGTGACGAGCACTTTTCTCCAGGATCACACCCGTCACA  173

Query  519  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  CATCCCATCAGATGTCAACTCCAAACAAGGCATGTCCAGACATCCTCCAGCTCCTGATATCCCTACTTTTTATC  247

Query  593  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  CCTTGTCTCCGGGTGGTGTTGGACAGATCACCCCACCTCTTGGCTGGCAAGGTCAGCCTGTATATCCCATCACG  321

Query  667  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GGTGGATTCAGGCAACCCTACCCATCCTCACTGTCAGTCGACACTTCCATGTCCAGGTTTTCCCATCATATGAT  395

Query  741  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  TCCCGGTCCTCCTGGTCCCCACACAACTGGCATCCCTCATCCAGCTATTGTAACACCTCAGGTCAAACAGGAAC  469

Query  815  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  ATCCCCACACTGACAGTGACCTAATGCACGTGAAGCCTCAGCATGAACAGAGAAAGGAGCAGGAGCCAAAAAGA  543

Query  889  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  CCTCACATTAAGAAGCCTCTGAATGCTTTTATGTTATACATGAAAGAAATGAGAGCGAATGTCGTTGCTGAGTG  617

Query  963  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  TACTCTAAAAGAAAGTGCAGCTATCAACCAGATTCTTGGCAGAAGGTGGCATGCCCTCTCCCGTGAAGAGCAGG  691

Query 1037  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  CTAAATATTATGAATTAGCACGGAAAGAAAGACAGCTACATATGCAGCTTTATCCAGGCTGGTCTGCAAGAGAC  765

Query 1111  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGTACAGGTCCAAGAATGAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    |.||.|| 
Sbjct  766  AATTATGGTAAGAAAAAGAAGAGGAAGAGAGAGAAACTACAGGAATCTGCATCAGGT---GG----AAAACGA-  831

Query 1185  AGCTGCCTACATC----------------------------------------------------------  1197
            ||||     |||.                                                          
Sbjct  832  AGCT-----CATTCCCAACGTGCAAAGCCAAGGCAGCGACCCCAGGACCTCTTCTGGAGATGGAAGCTTGT  897