Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03282
• Subject: XM_017316535.1
• Aligned Length: 2067
• Identities: 1754
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCTCAAATGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCCCAAATGAA  74

Query   75  GCAGGATCCACAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCAAAATCACAGCTTTGAGTGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGGATCCACAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCAAAATCACAGCTTTGAGTGAGA  148

Query  149  AACAGAAAAGAGTAGTTGAACAGCTACGGAAGAACCTGATAGTAAAGCAAGAACAACCGGACAAGTTCCAAATA  222
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AACAGAAAAGAGTAGTTGAGCAGCTGCGCAAGAACCTGATAGTCAAACAAGAGCAGCCGGACAAGTTCCAGATA  222

Query  223  CAGCCATTGCCACAATCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAACCACTA--------------------  276
            |||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||                    
Sbjct  223  CAGCCATTGTCACAGTCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAGCCACTACAGCCACTGCAGCAGCAGCA  296

Query  277  ----CAGCAACTACAACAACAGCAGCAGTACCACCACCACCACGCCCAGCAGTCAGCTGCAGCCTCTCCCAACC  346
                |||||||..||.||.|||||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.||.|..|
Sbjct  297  ACCGCAGCAACCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACGCCCAGCAGTCAGCAGCAGCACCGCCTAGTC  370

Query  347  TGACTGCTTCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCA  420
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAACTGCATCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCA  444

Query  421  GCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTGGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGTCA  494
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  GCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTTGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGCCA  518

Query  495  GAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTG  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTG  592

Query  569  GGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCT---GGTTCAGGCAACACCTCCTCAGCCCATC  639
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCTGCAGGTTCAAGCAACACCTCCTCAGCCCATC  666

Query  640  AAAGTACCACAGTTTATCCCCCCTCCTAGACTCACTCCACGTCCAAACTTTCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCC  713
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTACCACAGTTTATCCCTCCTCCTAGACTCACTCCACGCCCAAACTTCCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCC  740

Query  714  TGTGGCCCAGAATAACATTCCTATTGCCCCAGCACCACCTCCCATGCTCGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGC  787
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGCCCAGAATAACATTCCTATCGCTCCAGCGCCTCCTCCCATGCTTGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGC  814

Query  788  CCGTCATGCTGACCAAGTTCACCCCCACAACCCTTCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCCGTCCGTGTCGTC  861
            |.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  CTGTCATGCTGACCAAGTTTACACCCACAACCCTCCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCTGTCCGTGTTGTC  888

Query  862  AATGGGCAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTGATAGCTACTCCAGG  935
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  AATGGACAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTCATAGCTACTCCAGG  962

Query  936  GACCAGACTCGCTGGACCTCAAACTGTACAGCTTAGCAAGCCAAGTCTTGAAAAACAGACAGTTAAATCTCACA  1009
            ||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct  963  GACCAGACTCCCTGGACCTCAGACTGTACAGCTTAGCAAACCAAGCCTGGAGAAACAGACAGTTAAATCCCACC  1036

Query 1010  CAGAAACAGATGAGAAACAAACAGAGAGCCGCACCATCACCCCACCTGCTGCACCCAAACCAAAACGGGAGGAG  1083
            |||||.||||.||.||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1037  CAGAAGCAGAGGAAAAACAAGCAGAGAGCCGTACCGTTACCCCACCTGCTGCACCAAAACCAAAACGAGAAGAG  1110

Query 1084  AACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAA  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAA  1184

Query 1158  GAGGCAAGAGCGAAAAAGAAGAACAACAGCAAATCCGGTCTACAGTGGAGCAGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGA  1231
            ||||||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGCAGGAAAGAAAGAGAAGAACAACAGCAAACCCGGTGTACAGTGGGGCTGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGA  1258

Query 1232  AGAGTGCAGTGACATACCTAAACAGCACAATGCACCCTGGGACCCGGAAGAGAGGTCGTCCTCCAAAATACAAT  1305
            ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||        ||||        
Sbjct 1259  AGAGTGCAGTCACTTACCTTAACAGCACAATGCATCCTGGGACGCGGAAGAGAG--------CCAA--------  1316

Query 1306  GCAGTGCTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCAATCCAGTCATCCTGACTCCCCTGAAAATGAAAA  1379
                   ||.||                 ||||                   |||.|                 
Sbjct 1317  -------TGAGG-----------------AACA-------------------CTGGC-----------------  1330

Query 1380  GACAGAGACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCCCTGCCCAGCCCCACCTCCACAGACGGTG  1453
                                                                             ||.|.||||
Sbjct 1331  -----------------------------------------------------------------CAAAGGGTG  1339

Query 1454  ATATTCATGAGGATTTTTGCAGCGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTACTGATGTGCGACACATGTTCCCGTGTA  1527
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1340  ATATCCATGAGGATTTTTGCAGTGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTGCTGATGTGTGACACGTGTTCCCGTGTG  1413

Query 1528  TATCATTTGGACTGCTTAGACCCCCCTCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGA  1601
            ||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1414  TATCATCTGGACTGCTTAGAGCCGCCCCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGA  1487

Query 1602  CCAGATGCTGAAGAAGGAAGAAGCAATTCCATGGCCTGGAACTTTAGCAATTGTTCATTCCTATATTGCCTACA  1675
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1488  CCAGATGCTAAAGAAGGAAGAAGCAATTCCTTGGCCTGGAACCTTAGCCATTGTTCATTCCTACATCGCCTACA  1561

Query 1676  AAGCAGCAAAAGAAGAAGAGAAACAGAAGTTACTTAAATGGAGTTCAGATTTAAAACAAGAACGAGAACAACTA  1749
            ||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1562  AAGCAGCAAAAGAAGAGGAGAAACAGAAGCTACTTAAGTGGAGTTCAGATTTAAAACAGGAGCGGGAACAACTG  1635

Query 1750  GAGCAAAAGGTGAAACAGCTCAGCAATTCCATAAGTAAATGCATGGAAATGAAGAACACCATCCTGGCCCGGCA  1823
            |||||.|||||.|||.|||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||||.||.|||||||||.|||||
Sbjct 1636  GAGCAGAAGGTCAAAGAGCTCAGCAGTTCTATAAGTAAATGTATGGAGATGAAGAGCAGCATCCTGGCGCGGCA  1709

Query 1824  GAAGGAGATGCACAGCTCCCTGGAGAAGGTAAAACAGCTGATTCGCCTCATCCACGGCATCGACCTCTCCAAAC  1897
            |||||||||||.||||||||||||.|||||.||.|.|||.||.|||||..|.||.|||.|||||||||.||.||
Sbjct 1710  GAAGGAGATGCGCAGCTCCCTGGACAAGGTGAAGCGGCTCATCCGCCTTGTGCATGGCGTCGACCTCTGCAGAC  1783

Query 1898  CTGTAGACTCTGAGGCCACTGTGGGGGCCATCTCCAATGGCCCGGACTGCACCCCCCCTGCCAATGCCGCCACC  1971
            ||||.|||||.||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||   ||||.||
Sbjct 1784  CTGTGGACTCAGAGGCCACGGCGGGGGCCCTCTCCAATGGCCCAGACTGCACTCCCCCTGCCAA---CGCCGCC  1854

Query 1972  TCCACGCCGGCCCCTTCCCCCTCCTCCCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  2040
            |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  TCCACACCCGCCCCTTCCCCCTCCTCGCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  1923