Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03282
• Subject: XM_017316536.1
• Aligned Length: 2067
• Identities: 1751
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCTCAAATGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCCCAAATGAA  74

Query   75  GCAGGATCCACAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCAAAATCACAGCTTTGAGTGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGGATCCACAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCAAAATCACAGCTTTGAGTGAGA  148

Query  149  AACAGAAAAGAGTAGTTGAACAGCTACGGAAGAACCTGATAGTAAAGCAAGAACAACCGGACAAGTTCCAAATA  222
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AACAGAAAAGAGTAGTTGAGCAGCTGCGCAAGAACCTGATAGTCAAACAAGAGCAGCCGGACAAGTTCCAGATA  222

Query  223  CAGCCATTGCCACAATCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAACCACTA--------------------  276
            |||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||                    
Sbjct  223  CAGCCATTGTCACAGTCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAGCCACTACAGCCACTGCAGCAGCAGCA  296

Query  277  ----CAGCAACTACAACAACAGCAGCAGTACCACCACCACCACGCCCAGCAGTCAGCTGCAGCCTCTCCCAACC  346
                |||||||..||.||.|||||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.||.|..|
Sbjct  297  ACCGCAGCAACCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACGCCCAGCAGTCAGCAGCAGCACCGCCTAGTC  370

Query  347  TGACTGCTTCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCA  420
            |.|||||.||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAACTGCATCAC---AGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACACTACCTCTCGTCTTGAAAGCA  441

Query  421  GCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTGGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGTCA  494
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  442  GCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTTGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTATGGTGACCGCCATCAACAGCCA  515

Query  495  GAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTG  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGTCTAGTAAGGTCACTGGGCCTG  589

Query  569  GGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCT---GGTTCAGGCAACACCTCCTCAGCCCATC  639
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  590  GGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCTGCAGGTTCAAGCAACACCTCCTCAGCCCATC  663

Query  640  AAAGTACCACAGTTTATCCCCCCTCCTAGACTCACTCCACGTCCAAACTTTCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCC  713
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AAAGTACCACAGTTTATCCCTCCTCCTAGACTCACTCCACGCCCAAACTTCCTTCCACAGGTTCGACCCAAGCC  737

Query  714  TGTGGCCCAGAATAACATTCCTATTGCCCCAGCACCACCTCCCATGCTCGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGC  787
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  TGTGGCCCAGAATAACATTCCTATCGCTCCAGCGCCTCCTCCCATGCTTGCAGCTCCTCAGCTTATCCAGAGGC  811

Query  788  CCGTCATGCTGACCAAGTTCACCCCCACAACCCTTCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCCGTCCGTGTCGTC  861
            |.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  812  CTGTCATGCTGACCAAGTTTACACCCACAACCCTCCCCACATCCCAGAATTCCATCCACCCTGTCCGTGTTGTC  885

Query  862  AATGGGCAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTGATAGCTACTCCAGG  935
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  886  AATGGACAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAGCATTGTCATAGCTACTCCAGG  959

Query  936  GACCAGACTCGCTGGACCTCAAACTGTACAGCTTAGCAAGCCAAGTCTTGAAAAACAGACAGTTAAATCTCACA  1009
            ||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct  960  GACCAGACTCCCTGGACCTCAGACTGTACAGCTTAGCAAACCAAGCCTGGAGAAACAGACAGTTAAATCCCACC  1033

Query 1010  CAGAAACAGATGAGAAACAAACAGAGAGCCGCACCATCACCCCACCTGCTGCACCCAAACCAAAACGGGAGGAG  1083
            |||||.||||.||.||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1034  CAGAAGCAGAGGAAAAACAAGCAGAGAGCCGTACCGTTACCCCACCTGCTGCACCAAAACCAAAACGAGAAGAG  1107

Query 1084  AACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAA  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  AACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCATCTAGAAGAAATCCAAAGCAA  1181

Query 1158  GAGGCAAGAGCGAAAAAGAAGAACAACAGCAAATCCGGTCTACAGTGGAGCAGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGA  1231
            ||||||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GAGGCAGGAAAGAAAGAGAAGAACAACAGCAAACCCGGTGTACAGTGGGGCTGTCTTTGAGCCAGAGCGTAAGA  1255

Query 1232  AGAGTGCAGTGACATACCTAAACAGCACAATGCACCCTGGGACCCGGAAGAGAGGTCGTCCTCCAAAATACAAT  1305
            ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||        ||||        
Sbjct 1256  AGAGTGCAGTCACTTACCTTAACAGCACAATGCATCCTGGGACGCGGAAGAGAG--------CCAA--------  1313

Query 1306  GCAGTGCTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCAATCCAGTCATCCTGACTCCCCTGAAAATGAAAA  1379
                   ||.||                 ||||                   |||.|                 
Sbjct 1314  -------TGAGG-----------------AACA-------------------CTGGC-----------------  1327

Query 1380  GACAGAGACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCCCTGCCCAGCCCCACCTCCACAGACGGTG  1453
                                                                             ||.|.||||
Sbjct 1328  -----------------------------------------------------------------CAAAGGGTG  1336

Query 1454  ATATTCATGAGGATTTTTGCAGCGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTACTGATGTGCGACACATGTTCCCGTGTA  1527
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1337  ATATCCATGAGGATTTTTGCAGTGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTGCTGATGTGTGACACGTGTTCCCGTGTG  1410

Query 1528  TATCATTTGGACTGCTTAGACCCCCCTCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGA  1601
            ||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  TATCATCTGGACTGCTTAGAGCCGCCCCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTGGATCTGTCCCAGATGTCAGGA  1484

Query 1602  CCAGATGCTGAAGAAGGAAGAAGCAATTCCATGGCCTGGAACTTTAGCAATTGTTCATTCCTATATTGCCTACA  1675
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1485  CCAGATGCTAAAGAAGGAAGAAGCAATTCCTTGGCCTGGAACCTTAGCCATTGTTCATTCCTACATCGCCTACA  1558

Query 1676  AAGCAGCAAAAGAAGAAGAGAAACAGAAGTTACTTAAATGGAGTTCAGATTTAAAACAAGAACGAGAACAACTA  1749
            ||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1559  AAGCAGCAAAAGAAGAGGAGAAACAGAAGCTACTTAAGTGGAGTTCAGATTTAAAACAGGAGCGGGAACAACTG  1632

Query 1750  GAGCAAAAGGTGAAACAGCTCAGCAATTCCATAAGTAAATGCATGGAAATGAAGAACACCATCCTGGCCCGGCA  1823
            |||||.|||||.|||.|||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||||.||.|||||||||.|||||
Sbjct 1633  GAGCAGAAGGTCAAAGAGCTCAGCAGTTCTATAAGTAAATGTATGGAGATGAAGAGCAGCATCCTGGCGCGGCA  1706

Query 1824  GAAGGAGATGCACAGCTCCCTGGAGAAGGTAAAACAGCTGATTCGCCTCATCCACGGCATCGACCTCTCCAAAC  1897
            |||||||||||.||||||||||||.|||||.||.|.|||.||.|||||..|.||.|||.|||||||||.||.||
Sbjct 1707  GAAGGAGATGCGCAGCTCCCTGGACAAGGTGAAGCGGCTCATCCGCCTTGTGCATGGCGTCGACCTCTGCAGAC  1780

Query 1898  CTGTAGACTCTGAGGCCACTGTGGGGGCCATCTCCAATGGCCCGGACTGCACCCCCCCTGCCAATGCCGCCACC  1971
            ||||.|||||.||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||   ||||.||
Sbjct 1781  CTGTGGACTCAGAGGCCACGGCGGGGGCCCTCTCCAATGGCCCAGACTGCACTCCCCCTGCCAA---CGCCGCC  1851

Query 1972  TCCACGCCGGCCCCTTCCCCCTCCTCCCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  2040
            |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852  TCCACACCCGCCCCTTCCCCCTCCTCGCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCAGGGGGAAGAGACTAAA  1920