Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03336
• Subject: XM_017316550.1
• Aligned Length: 980
• Identities: 900
• Gaps: 16

Alignment

Query   1  ATGGGGAATCTTCTTAAAGTTTT-------GACATGCACAGACCTTGA-GCAGGGGCCAAATTTTTTCCTTGAT  66
           |||||.|||||..||||.||..|       |||||    |||||...| ||||    ||.||||||||.|.||.
Sbjct   1  ATGGGTAATCTCATTAAGGTGCTAACCAGGGACAT----AGACCACAATGCAG----CACATTTTTTCTTGGAC  66

Query  67  TTTGAAAATGCCCAGCCTACAGAGTCTGAGAAGGAAATTTATAATCAGGTGAATGTAGTATTAAAAGATGCAGA  140
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  67  TTTGAAAATGCCCAGCCTACAGAGTCTGAGAAGGAAATATATAATCAGGTGAATGTAGTGTTAAAAGATGCAGA  140

Query 141  AGGCATCTTGGAGGACTTGCAGTCATACAGAGGAGCTGGCCACGAAATACGAGAGGCAATCCAGCATCCAGCAG  214
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 141  AGGCATCTTGGAGGATTTGCAGTCATACAGAGGAGCTGGCCACGAAATACGAGAGGCAATCCAGCATCCAGCCG  214

Query 215  ATGAGAAGTTGCAAGAGAAGGCATGGGGTGCAGTTGTTCCACTAGTAGGCAAATTAAAGAAATTTTACGAATTT  288
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 215  ATGAGAAGTTGCAAGAGAAGGCGTGGGGTGCAGTCGTGCCACTAGTAGGCAAATTAAAGAAGTTTTACGAATTT  288

Query 289  TCTCAGAGGTTAGAAGCAGCATTAAGAGGTCTTCTGGGAGCCTTAACAAGTACCCCATATTCTCCCACCCAGCA  362
           ||||||||..|||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 289  TCTCAGAGACTAGAAGCAGCACTAAGAGGCCTTCTGGGAGCCTTGACTAGTACGCCATACTCGCCCACCCAACA  362

Query 363  TCTAGAGCGAGAGCAGGCTCTTGCTAAACAGTTTGCAGAAATTCTTCATTTCACACTCCGGTTTGATGAACTCA  436
           |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 363  TCTAGAGCGAGAGCAGGCTCTCGCTAAACAGTTTGCAGAGATTCTTCACTTCACACTCCGGTTTGATGAGCTCA  436

Query 437  AGATGACAAATCCTGCCATACAGAATGATTTCAGCTATTATAGAAGAACATTGAGTCGTATGAGGATTAACAAT  510
           ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 437  AGATGACAAATCCTGCCATACAAAATGACTTCAGCTACTACAGAAGAACATTGAGTCGTATGAGAATTAATAAT  510

Query 511  GTACCGGCAGAAGGAGAAAATGAAGTAAATAATGAATTGGCAAATCGAATGTCTTTGTTTTATGCTGAGGCAAC  584
           ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 511  GTCCCGGCAGAAGGAGAAAATGAAGTAAATAATGAATTGGCAAATCGAATGTCATTGTTTTACGCTGAGGCCAC  584

Query 585  TCCAATGCTGAAAACCTTGAGTGATGCCACAACAAAATTTGTATCAGAGAATAAAAATTTACCAATAGAAAATA  658
           .|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 585  CCCAATGCTGAAAACCTTAAGTGATGCAACAACAAAATTTGTATCGGAGAATAAAAATTTGCCAATAGAAAATA  658

Query 659  CCACAGATTGTTTAAGCACAATGGCTAGTGTATGCAGAGTCATGCTGGAAACACCGGAATACAGAAGCAGATTT  732
           |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659  CCACAGATTGTTTAAGCACCATGGCAAGTGTATGCAGAGTCATGCTGGAGACACCGGAATACAGAAGCAGATTT  732

Query 733  ACAAATGAAGAGACAGTGTCATTCTGCTTGAGGGTAATGGTGGGTGTCATAATACTCTATGACCACGTACATCC  806
           ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 733  ACCAATGAAGAGACAGTATCATTCTGCTTGAGGGTAATGGTGGGTGTCATAATACTCTATGACCACGTCCATCC  806

Query 807  AGTGGGAGCATTTGCTAAAACTTCCAAAATTGATATGAAAGGTTGTATCAAAGTTCTTAAGGACCAACCTCCTA  880
           |||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807  AGTGGGAGCATTTGCCAAAACTTCTAAGATTGATATGAAAGGTTGTATCAAAGTTCTTAAGGACCAACCTCCTA  880

Query 881  ATAGTGTGGAAGGTCTTCTAAATGCTCTCAGGTACACAACAAAACATTTGAATGATGAGACTACCTCCAAGCAA  954
           |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881  ATAGTGTAGAAGGTCTTCTCAATGCTCTCAGGTACACAACAAAACATTTGAATGATGAGACTACCTCCAAGCAA  954

Query 955  ATTAAATCCATGCTGCAA  972
           ||||..|||||||||||.
Sbjct 955  ATTAGGTCCATGCTGCAG  972