Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03368
• Subject: NM_001304771.1
• Aligned Length: 1602
• Identities: 1209
• Gaps: 393

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGTGCGGTAGGGGTGGTGGCGATCCTGCGTAGGGACCCACGTGAGGGGTGCACCGACTGGACGTGTGTGTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCGAGGGGCCAAGGAAGCGGGTGTTGGTCCCAGTGTGCGTAAACGGACAACGACATCTGGGAGTTGGGCAGTGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGAGAGAGAAGAGTGTGTCCAGGAGGAACCTGCCTGGAGGAGGCCTAGCGGTGTGTGTGCGCCTAGGTGTATAC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGGGGCGTTGGTGACTTCGAGAGGCACCGGGCGGGATCGATCCTCTCTGCGTCCTGGACCTGGTGCTGGTGTGT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TTCGGGGAAGTTACTGCTTATGAACCCCCCTTGGAGCGTGGCCTGGGGGCAGGAAGGCTTCCGCGCTGGGACCC  370

Query    1  -----------------------ATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACCAGGTGCTCACCTTC  51
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGGTCGCGATACCTCCCTCGAATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACCAGGTGCTCACCTTC  444

Query   52  CTCCTGCTCTTCGTGATCACCTCGGTGGCCTCTGAAAACGCCAGCACATCCCGAGGCTGTGGGCTGGACCTCCT  125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCCTGCTCTTCGTGATCACCTCGGTGGCCTCTGAAAACGCCAGCACATCCCGAGGCTGTGGGCTGGACCTCCT  518

Query  126  CCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCGACCTGGACGCCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGGCG  199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCGACCTGGACGCCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGGCG  592

Query  200  CCCTGATCACACTGCTCCTGATGCTCATCCTCCTGGTGCGGCTGCCCTTCATCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGC  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTGATCACACTGCTCCTGATGCTCATCCTCCTGGTGCGGCTGCCCTTCATCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGC  666

Query  274  CCTGTGGGCCTCCACTTTCTGTTCCTCCTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCA  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTGTGGGCCTCCACTTTCTGTTCCTCCTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCA  740

Query  348  GGAGGACGAGACCATCTGCTCTGTCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCTTTGCGCTCTGCTTCTCCTGCCTGC  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGACGAGACCATCTGCTCTGTCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCTTTGCGCTCTGCTTCTCCTGCCTGC  814

Query  422  TGAGCCAGGCATGGCGCGTGCGGAGGCTGGTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGCTGGCAGCTGGTGGGCCTG  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAGCCAGGCATGGCGCGTGCGGAGGCTGGTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGCTGGCAGCTGGTGGGCCTG  888

Query  496  GCGCTGTGCCTGATGCTGGTGCAAGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCACCGTGCTGCGTGACACAAG  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGCTGTGCCTGATGCTGGTGCAAGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCACCGTGCTGCGTGACACAAG  962

Query  570  GCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCATGGACTTTGTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGGTCACCC  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCATGGACTTTGTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGGTCACCC  1036

Query  644  TGGGGCTGGCCCTCTTCACTCTGTGCGGCAAGTTCAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGGCCTTCCTCCTCATCACA  717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGGGCTGGCCCTCTTCACTCTGTGCGGCAAGTTCAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGGCCTTCCTCCTCATCACA  1110

Query  718  GCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTGGGTGGCCTGGATGACCATGTACCTCTTCGGCAATGTCAAGCTGCAGCAGGG  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTGGGTGGCCTGGATGACCATGTACCTCTTCGGCAATGTCAAGCTGCAGCAGGG  1184

Query  792  GGATGCCTGGAACGACCCCACCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGCGGCTGGGTCTTCGTCATCTTCCACGCCA  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGATGCCTGGAACGACCCCACCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGCGGCTGGGTCTTCGTCATCTTCCACGCCA  1258

Query  866  TCCCTGAGATCCACTGCACCCTTCTGCCAGCCCTGCAGGAGAACACGCCCAACTACTTCGACACGTCGCAGCCC  939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCTGAGATCCACTGCACCCTTCTGCCAGCCCTGCAGGAGAACACGCCCAACTACTTCGACACGTCGCAGCCC  1332

Query  940  AGGATGCGGGAGACGGCCTTCGAGGAGGACGTGCAGCTGCCGCGGGCCTATATGGAGAACAAGGCCTTCTCCAT  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGATGCGGGAGACGGCCTTCGAGGAGGACGTGCAGCTGCCGCGGGCCTATATGGAGAACAAGGCCTTCTCCAT  1406

Query 1014  GGATGAACACAATGCAGCTCTCCGAACAGCAGGATTTCCCAACGGCAGCTTGGGAAAAAGACCCAGTGGCAGCT  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGATGAACACAATGCAGCTCTCCGAACAGCAGGATTTCCCAACGGCAGCTTGGGAAAAAGACCCAGTGGCAGCT  1480

Query 1088  TGGGGAAAAGACCCAGCGCTCCGTTTAGAAGCAACGTGTATCAGCCAACTGAGATGGCCGTCGTGCTCAACGGT  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGGGAAAAGACCCAGCGCTCCGTTTAGAAGCAACGTGTATCAGCCAACTGAGATGGCCGTCGTGCTCAACGGT  1554

Query 1162  GGGACCATCCCAACTGCTCCGCCAAGTCACACAGGAAGACACCTTTGG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGACCATCCCAACTGCTCCGCCAAGTCACACAGGAAGACACCTTTGG  1602