Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03442
- Subject:
- NM_026574.3
- Aligned Length:
- 1559
- Identities:
- 1510
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 MASELGARDDGGCTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDSNPLLPQSGDPLIQVKE 74
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Sbjct 1 MASELGAGDDGSSTELAKPLYLQYLERALRLDHFLRQTSAIFNRNISSDDSEDGLDDNNPLLPESGDPLIQVKE 74
Query 75 EPPNSLLGETSGAGSSGMLNTYSLNGVLQSESKCDKGNLYNFSKLKKSRKWLKSILLSDESSEADSQSE--DDD 146
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Sbjct 75 EPPNSLLGETSGASSSGLLNPYSLNGVLQSESKSDKGNLYNFSKLKKSRKWLKSILLSDESSEADSQSEDNDDE 148
Query 147 EEELNLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKELQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEEKKLKA 220
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Sbjct 149 EEELSLSREELHNMLRLHKYKKLHQNKYSKDKELQQYQYYSAGLLSTYDPFYEQQRHLLGPKKKKFKEDKKLKA 222
Query 221 KLKKVKKKRRRDEELSSEESPRRHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANK 294
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Sbjct 223 KLKKVKKKRRRDEEFSSEESPRHHHHQTKVFAKFSHDAPPPGTKKKHLSIEQLNARRRKVWLSIVKKELPKANK 296
Query 295 QKASARNLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQ 368
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Sbjct 297 QKSSARNLFLTNSRKLAHQCMKEVRRAALQAQKNCKETLPRARRLTKEMLLYWKKYEKVEKEHRKRAEKEALEQ 370
Query 369 RKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDY 442
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Sbjct 371 RKLDEEMREAKRQQRKLNFLITQTELYAHFMSRKRDMGHDGIQEEILRKLEDSSTQRQIDIGGGVVVNITQEDY 444
Query 443 DSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAANKSGTGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNG 516
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Sbjct 445 DSNHFKAQALKNAENAYHIHQARTRSFDEDAKESRAAALRAADKSGSGFGESYSLANPSIRAGEDIPQPTIFNG 518
Query 517 KLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFV 590
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Sbjct 519 KLKGYQLKGMNWLANLYEQGINGILADEMGLGKTVQSIALLAHLAERENIWGPFLIISPASTLNNWHQEFTRFV 592
Query 591 PKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVR 664
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Sbjct 593 PKFKVLPYWGNPHDRKVIRRFWSQKTLYTQDAPFHVVITSYQLVVQDVKYFQRVKWQYMVLDEAQALKSSSSVR 666
Query 665 WKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMI 738
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Sbjct 667 WKILLQFQCRNRLLLTGTPIQNTMAELWALLHFIMPTLFDSHEEFNEWFSKDIESHAENKSAIDENQLSRLHMI 740
Query 739 LKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILMYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQF 812
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Sbjct 741 LKPFMLRRIKKDVENELSDKIEILTYCQLTSRQKLLYQALKNKISIEDLLQSSMGSTQQAQNTTSSLMNLVMQF 814
Query 813 RKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYHISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLRV-LSPFAPDYIQRSLFHRKGINEE 885
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Sbjct 815 RKVCNHPELFERQETWSPFHISLKPYEISKFIYRHGQIRVFNHSRDRWLKVLLSPFAPDYIQQSLFHRKGINEG 888
Query 886 SCFSFLRFIDISPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWGAPEGESHQRYLRNKDFLLGVNFPLSF 959
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Sbjct 889 SCFSFLRFIDVSPAEMANLMLQGLLARWLALFLSLKASYRLHQLRSWAEPDGTSHQSYLRNKDFLLGVDFPLSF 962
Query 960 PNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDQVVHQRRSATSSLRRCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEY 1033
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Sbjct 963 PNLCSCPLLKSLVFSSHCKAVSGYSDHVVHQRRSATSSLRCCLLTELPSFLCVASPRVTAVPLDSYCNDRSAEY 1036
Query 1034 ERRVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELAADWLNRRSQFFPEPAGGLWSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALD 1107
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Sbjct 1037 ERGVLKEGGSLAAKQCLLNGAPELATDWLSRRSQFFPEPAGGLLSIRPQNGWSFIRIPGKESLITDSGKLYALD 1110
Query 1108 VLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQNRNDIFVFLLSTRAGGL 1181
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Sbjct 1111 VLLTRLKSQGHRVLIYSQMTRMIDLLEEYMVYRKHTYMRLDGSSKISERRDMVADFQTRNDIFVFLLSTRAGGL 1184
Query 1182 GINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFK 1255
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Sbjct 1185 GINLTAADTVIFYDSDWNPTVDQQAMDRAHRLGQTKQVTVYRLICKGTIEERILQRAKEKSEIQRMVISGGNFK 1258
Query 1256 PDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEETNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPF 1329
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Sbjct 1259 PDTLKPKEVVSLLLDDEELEKKLRLRQEEKRQQEESNRVKERKRKREKYAEKKKKEDELDGKRRKEGVNLVIPF 1332
Query 1330 VPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPLDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASI 1403
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Sbjct 1333 VPSADNSNLSADGDDSFISVDSAMPSPFSEISISSELHTGSIPPDESSSDMLVIVDDPASSAPQSRATNSPASI 1406
Query 1404 TGSVSDTVNGISIQEMPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAA 1477
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Sbjct 1407 TGSVSDTVNGISIQEVPAAGRGHSARSRGRPKGSGSTAKGAGKGRSRKSTAGSAAAMAGAKAGAAAASAAAYAA 1480
Query 1478 YGYNVSKGISASSPLQTSLVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLSKGNNVPGNPKNLHMTSSLAPDSLVRKQGKGTN 1551
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Sbjct 1481 YGYNVSKGISASSPLQTSIVRPAGLADFGPSSASSPLSSPLNKGNNIPGTPKSLHMTSSLASDSLIRKQGKGTN 1554
Query 1552 PSGGR 1556
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Sbjct 1555 PSGGR 1559