Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03449
• Subject: XM_005255390.4
• Aligned Length: 1342
• Identities: 1115
• Gaps: 227

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATG-ATTGTACCG-------GCAGCTCCT  66
                                                         ||| |||||   |       ||||||   
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGAATTGT---GAAAGAGAGCAGCT---  23

Query   67  TACCTTCCTGGACTGATTCA--GGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCT  138
                               |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   24  -------------------AAGGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCT  78

Query  139  TCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGA  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  TCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGA  152

Query  213  GTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGA  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  GTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGA  226

Query  287  GCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGC  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  GCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGC  300

Query  361  CAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCC  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  CAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCC  374

Query  435  CTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTT  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  CTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTT  448

Query  509  TTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAG  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAG  522

Query  583  AAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAA  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  AAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAA  596

Query  657  AAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCT  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  AAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCT  670

Query  731  ATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTA  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  ATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTA  744

Query  805  TATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCG  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  TATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCG  818

Query  879  AGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAG  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  AGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAG  892

Query  953  TAGTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCT  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  TAGTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCT  966

Query 1027  ACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAA  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  ACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAA  1040

Query 1101  CACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGG  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  CACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGG  1114

Query 1175  CGTTGGTGCCA---------------------------------------------------------------  1185
            |||||||||||                                                               
Sbjct 1115  CGTTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCACACTTCCAGGCCTC  1188

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1189  TGCTGTCAGGCAGCTGAGAATCTGACTGCCTCTCCTCCCCTATTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCA  1262

Query 1186  ----------  1185
                      
Sbjct 1263  GGAAAGAAAA  1272