Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_006522175.3
- Aligned Length:
- 1354
- Identities:
- 1063
- Gaps:
- 182
Alignment
Query 1 ATGCTG--GCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGG----------CGTGCCTATGATTGTACCGGCAGC 62
||||.| .|.|||.|.||.|..|.||||| .||| ||||...||| |||.|| ||||
Sbjct 1 ATGCAGCATCCTCTGACGGGGGCCACCTGC------GTGGCACTCCCCAACGTGGGCATG--TGTCCC--CAGC 64
Query 63 T--------CCTT-ACCTTCCTGGACTGA-TTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCT 126
| |||| ||.||..||.|||.| ..|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 65 TCTCCTGTGCCTTGACTTTTATGTACTTACAGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCT 138
Query 127 CAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCA 200
||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 139 CAGCCTTATGCCTCAGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCA 212
Query 201 CCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGC 274
.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||
Sbjct 213 TCCCGCGCCAGAGTACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGC 286
Query 275 ACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCA 348
||||.|||||||| .||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 287 ACTCGGAGCAGAG---TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCC 357
Query 349 CCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGT 422
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CCGACCGACGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGT 431
Query 423 CTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATG 496
.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 432 GTCCAACATCCCTTTCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATG 505
Query 497 TTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGAC 570
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 506 TTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGAC 579
Query 571 AGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGT 644
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 580 AGGGCGAGGGAGAAATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGT 653
Query 645 AATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACA 718
.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 654 GATGACAAATAAGAAGACTGTCAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACA 727
Query 719 GTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCC 792
|.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 728 GCCCCGACTTCTATGCAGGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCC 801
Query 793 AGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGG 866
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct 802 AGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGG 875
Query 867 GGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGG 940
|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 876 GGCTCACCTTCGAGGCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGG 949
Query 941 CCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGC 1014
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 950 CCTATGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGC 1023
Query 1015 TACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGA 1088
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1024 TATGCCCAGCCCACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGA 1097
Query 1089 AATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGC 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1098 AATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGC 1171
Query 1163 CCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA--------------------------------------------------- 1185
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 CCCCACCTACGGCGTTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGA 1245
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1246 CTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGGCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGT 1319
Query 1186 ---------------------- 1185
Sbjct 1320 CATAGTCGCCCAGGAGAGAAAG 1341