Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_006522177.3
- Aligned Length:
- 1333
- Identities:
- 1034
- Gaps:
- 206
Alignment
Query 1 ATGCTGGCGTCTCAAG-GAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGCTCCTTACCTTC 73
|||..|| || ||| |.||||.| |||| .||||
Sbjct 1 ATGGAGG-------AGAGAG----CATGCAGC---ATGG------------------TGCAG------------ 30
Query 74 CTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAG 147
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 31 -----------CAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAG 93
Query 148 TTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGG 221
||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 94 TTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGG 167
Query 222 CCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGG 295
|||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| .||.|
Sbjct 168 CCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTG 238
Query 296 ACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAG 369
||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 239 ACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAG 312
Query 370 ACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTT 443
||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct 313 ACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTT 386
Query 444 CCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC 517
|||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 CCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC 460
Query 518 GAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACAC 591
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 461 GAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCAC 534
Query 592 GGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGT 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 535 GGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGT 608
Query 666 CAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCA 739
||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 609 CAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCA 682
Query 740 CGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT 813
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 683 CGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT 756
Query 814 GCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGG 887
||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 757 GCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGG 830
Query 888 TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATC 961
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 831 TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATC 904
Query 962 AAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCC 1035
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 905 AAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCC 978
Query 1036 ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC 1109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC 1052
Query 1110 AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC 1183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC 1126
Query 1184 CA------------------------------------------------------------------------ 1185
||
Sbjct 1127 CATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAG 1200
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1201 GCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAGAGAAA 1274
Query 1186 - 1185
Sbjct 1275 G 1275