Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_017023321.2
- Aligned Length:
- 1400
- Identities:
- 1150
- Gaps:
- 235
Alignment
Query 1 -----ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTG--------CCT--ATGATTGTACC--G 57
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Sbjct 1 ATGAAATCTTGGCAGCTAA----------TTGCA-------GTCGTGGGAGATGCCCTTCAGGA---TATCAAA 54
Query 58 GCAG-CT-CCTTACCTTCCTG---------GACTGA-----TTCA----------------------------- 86
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Sbjct 55 GCAGACTGCAATACCTGCGTGGAAATAGAAGACAGAAAGGTTTCAAGACAACAGATGAATTGTGAAAGAGAGCA 128
Query 87 ------GGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTC 154
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Sbjct 129 GCTAAGGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTC 202
Query 155 CCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACC 228
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Sbjct 203 CCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACC 276
Query 229 ACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAG 302
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Sbjct 277 ACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAG 350
Query 303 CGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAAC 376
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Sbjct 351 CGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAAC 424
Query 377 CTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGAT 450
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Sbjct 425 CTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGAT 498
Query 451 CCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTC 524
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Sbjct 499 CCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTC 572
Query 525 AAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCG 598
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Sbjct 573 AAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCG 646
Query 599 TGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCT 672
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Sbjct 647 TGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCT 720
Query 673 TATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCT 746
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Sbjct 721 TATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCT 794
Query 747 GTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGC 820
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Sbjct 795 GTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGC 868
Query 821 CAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACC 894
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Sbjct 869 CAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACC 942
Query 895 GTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCC 968
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Sbjct 943 GTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCC 1016
Query 969 TGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCG 1042
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Sbjct 1017 TGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCG 1090
Query 1043 CTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACG 1116
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Sbjct 1091 CTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACG 1164
Query 1117 GACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA----- 1185
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Sbjct 1165 GACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCATGCCC 1238
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1239 CAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCACACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAGGCAGCTG 1312
Query 1186 -------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1313 AGAATCTGACTGCCTCTCCTCCCCTATTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAAAGAAAA 1380