Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03449
- Subject:
- XM_017023328.2
- Aligned Length:
- 1275
- Identities:
- 1141
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 ATG----CTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCA-----TCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGC--T 63
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Sbjct 1 ATGGAAACTGG----TCAA--AGAACTCATGCAAGTGGAACTTACAGC-TTCCT-TGATCGGAC--TCAGCATT 64
Query 64 C---------------CT----TACCTTCCTG---------GACTGA-----TTCA------------------ 86
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Sbjct 65 CAGATATCAAAGCAGACTGCAATACCTGCGTGGAAATAGAAGACAGAAAGGTTTCAAGACAACAGATGAATTGT 138
Query 87 -----------------GGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGC 143
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Sbjct 139 GAAAGAGAGCAGCTAAGGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGC 212
Query 144 CCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACA 217
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Sbjct 213 CCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACA 286
Query 218 CAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCG 291
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Sbjct 287 CAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCG 360
Query 292 GCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCC 365
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Sbjct 361 GCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCC 434
Query 366 CCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCA 439
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Sbjct 435 CCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCA 508
Query 440 GGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAAT 513
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Sbjct 509 GGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAAT 582
Query 514 GAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATT 587
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Sbjct 583 GAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATT 656
Query 588 ACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGA 661
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Sbjct 657 ACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGA 730
Query 662 CCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCA 735
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Sbjct 731 CCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCA 804
Query 736 GGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATAC 809
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Sbjct 805 GGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATAC 878
Query 810 TTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCC 883
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Sbjct 879 TTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCC 952
Query 884 GCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTG 957
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Sbjct 953 GCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGTGTTGTT 1026
Query 958 TATCAAGAGCCTG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCC 1020
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Sbjct 1027 TACCAGGA---TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCC 1086
Query 1021 CAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTC 1094
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Sbjct 1087 CAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTC 1160
Query 1095 TTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCAC 1168
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Sbjct 1161 TTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCAC 1234
Query 1169 CTACGGCGTTGGTGCCA 1185
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Sbjct 1235 CTACGGCGTTGGTGCCA 1251