Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03449
• Subject: XM_017023332.1
• Aligned Length: 1219
• Identities: 1137
• Gaps: 56

Alignment

Query    1  ---ATGCTG--GCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCG-TGCCTA---TG---AT-TGTACCGGCAG  61
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Sbjct    1  ATGATGCAGCATCCTCTGACGGGGGCCACCTGC------GTGGCGCTCCCCAACGTGGGCATGTGTCCC--CAG  66

Query   62  CT--------CCTT-ACCTTCCTGGACTGA-TTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGC  125
            ||        |||| ||.||..||.|||.| ..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  CTTTCGTGTGCCTTGACTTTTATGTACTTACAGCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGC  140

Query  126  TCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCC  199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  TCAGCCTTACGCTTCGGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCC  214

Query  200  ACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACG  273
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Sbjct  215  ACCCCGCGCCAGAGTACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACG  288

Query  274  CACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGC  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  CACTCCGAGCAGAGCCCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGC  362

Query  348  ACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATG  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  ACCGACGGATGGCCAGCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATG  436

Query  422  TCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGAT  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  TCTCCAATATCCCCTTCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGAT  510

Query  496  GTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGA  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  GTTGAAATTATTTTTAATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGA  584

Query  570  CAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTG  643
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Sbjct  585  CAGGGCGAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTG  658

Query  644  TAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTAC  717
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Sbjct  659  TAATGACAAATAAAAAGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTAC  732

Query  718  AGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCC  791
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Sbjct  733  AGTCCCGAATTCTATGCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCC  806

Query  792  CAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAG  865
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Sbjct  807  CAGTTCACTTGTATATACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAG  880

Query  866  GGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCG  939
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Sbjct  881  GGGCGCACCTGCGAGGCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCG  954

Query  940  GCCTACGGCGGAGTAGTGTATCAAGAGCCTG---TGTATGGCAATAAATTGCTGCAG--------GGTGGTTAT  1002
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Sbjct  955  GCCTACGGCGGTGTTGTTTACCAGGA---TGGATTTTATGG-----------TGCAGACATTTATGGTGGTTAT  1014

Query 1003  GCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGT  1076
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Sbjct 1015  GCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGT  1088

Query 1077  TGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGC  1150
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Sbjct 1089  TGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGC  1162

Query 1151  ACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA  1185
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Sbjct 1163  ACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGCCA  1197