Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03462
• Subject: XM_011536847.3
• Aligned Length: 1713
• Identities: 1713
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACCACACATCCCCGACCTACATGCTTGCTAACTTAACCCACTTGCATTCTGAACAACTTCTGCAGGGCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCACACATCCCCGACCTACATGCTTGCTAACTTAACCCACTTGCATTCTGAACAACTTCTGCAGGGCTT  74

Query   75  GAATCTTCTTCGCCAACATCACGAACTCTGTGACATCATTCTTCGAGTAGGTGATGTTAAAATTCATGCTCACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAATCTTCTTCGCCAACATCACGAACTCTGTGACATCATTCTTCGAGTAGGTGATGTTAAAATTCATGCTCACA  148

Query  149  AAGTGGTACTTGCCAGCGTCAGCCCGTATTTCAAAGCTATGTTCACTGGAAACCTTTCTGAAAAAGAGAACAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTGGTACTTGCCAGCGTCAGCCCGTATTTCAAAGCTATGTTCACTGGAAACCTTTCTGAAAAAGAGAACAGT  222

Query  223  GAGGTTGAGTTTCAATGCATTGATGAAACTGCTCTCCAGGCCATTGTGGAGTATGCCTATACAGGGACTGTTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGTTGAGTTTCAATGCATTGATGAAACTGCTCTCCAGGCCATTGTGGAGTATGCCTATACAGGGACTGTTTT  296

Query  297  TATTTCTCAGGACACAGTTGAATCTCTCCTGCCAGCAGCAAACCTACTCCAGATAAAACTTGTCCTGAAAGAAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTTCTCAGGACACAGTTGAATCTCTCCTGCCAGCAGCAAACCTACTCCAGATAAAACTTGTCCTGAAAGAAT  370

Query  371  GTTGTGCATTTCTTGAAAGCCAACTTGATCCTGGTAATTGTATTGGAATTTCTCGTTTTGCAGAAACATATGGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTTGTGCATTTCTTGAAAGCCAACTTGATCCTGGTAATTGTATTGGAATTTCTCGTTTTGCAGAAACATATGGT  444

Query  445  TGCCGTGACCTTTATTTGGCAGCCACTAAATACATATGCCAGAATTTTGAAGCTGTTTGCCAGACTGAAGAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCCGTGACCTTTATTTGGCAGCCACTAAATACATATGCCAGAATTTTGAAGCTGTTTGCCAGACTGAAGAGTT  518

Query  519  TTTTGAGCTTACACATGCTGACTTGGATGAAATTGTTTCCAATGACTGTTTGAATGTAGCTACCGAAGAGACTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTTGAGCTTACACATGCTGACTTGGATGAAATTGTTTCCAATGACTGTTTGAATGTAGCTACCGAAGAGACTG  592

Query  593  TTTTTTATGCATTAGAGTCTTGGATCAAGTATGATGTACAAGAACGCCAGAAATACTTAGCACAGTTACTAAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTTTATGCATTAGAGTCTTGGATCAAGTATGATGTACAAGAACGCCAGAAATACTTAGCACAGTTACTAAAC  666

Query  667  AGTGTACGATTACCATTGTTGAGTGTTAAGTTTCTCACTAGACTATATGAAGCAAATCATCTTATTCGTGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGTACGATTACCATTGTTGAGTGTTAAGTTTCTCACTAGACTATATGAAGCAAATCATCTTATTCGTGATGA  740

Query  741  TCGCACTTGTAAACATCTTTTGAATGAAGCCCTAAAGTACCACTTTATGCCTGAACATAGACTCTCTCATCAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGCACTTGTAAACATCTTTTGAATGAAGCCCTAAAGTACCACTTTATGCCTGAACATAGACTCTCTCATCAGA  814

Query  815  CAGTCTTGATGACACGACCTCGCTGTGCTCCCAAAGTACTTTGTGCAGTAGGAGGGAAATCTGGACTCTTTGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGTCTTGATGACACGACCTCGCTGTGCTCCCAAAGTACTTTGTGCAGTAGGAGGGAAATCTGGACTCTTTGCC  888

Query  889  TGTTTGGATAGTGTGGAGATGTACTTTCCTCAGAATGACTCTTGGATTGGTTTGGCACCCCTAAACATTCCTCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTTTGGATAGTGTGGAGATGTACTTTCCTCAGAATGACTCTTGGATTGGTTTGGCACCCCTAAACATTCCTCG  962

Query  963  CTATGAATTTGGAATATGCGTTTTAGACCAAAAAGTATATGTTATAGGTGGTATTGCAACTAATGTGCGTCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATGAATTTGGAATATGCGTTTTAGACCAAAAAGTATATGTTATAGGTGGTATTGCAACTAATGTGCGTCCTG  1036

Query 1037  GCGTCACTATCAGAAAACATGAAAATTCAGTGGAATGCTGGAATCCTGATACAAATACTTGGACTTCTCTAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGTCACTATCAGAAAACATGAAAATTCAGTGGAATGCTGGAATCCTGATACAAATACTTGGACTTCTCTAGAG  1110

Query 1111  AGAATGAATGAAAGCCGAAGTACTCTTGGAGTAGTAGTACTTGCAGGAGAACTTTATGCCTTAGGTGGTTATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAATGAATGAAAGCCGAAGTACTCTTGGAGTAGTAGTACTTGCAGGAGAACTTTATGCCTTAGGTGGTTATGA  1184

Query 1185  TGGACAATCTTATTTACAATCTGTAGAGAAGTACATTCCCAAAATAAGAAAATGGCAACCTGTGGCACCAATGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGACAATCTTATTTACAATCTGTAGAGAAGTACATTCCCAAAATAAGAAAATGGCAACCTGTGGCACCAATGA  1258

Query 1259  CGACAACAAGAAGTTGTTTTGCTGCAGCGGTATTGGATGGAATGATATATGCCATTGGTGGGTATGGTCCTGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGACAACAAGAAGTTGTTTTGCTGCAGCGGTATTGGATGGAATGATATATGCCATTGGTGGGTATGGTCCTGCC  1332

Query 1333  CACATGAACAGTGTGGAGCGTTATGATCCAAGTAAGGACTCCTGGGAGATGGTTGCATCCATGGCAGATAAAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACATGAACAGTGTGGAGCGTTATGATCCAAGTAAGGACTCCTGGGAGATGGTTGCATCCATGGCAGATAAAAG  1406

Query 1407  GATTCACTTTGGCGTGGGTGTCATGCTAGGCTTTATTTTTGTGGTGGGTGGACATAATGGAGTCTCACATTTGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATTCACTTTGGCGTGGGTGTCATGCTAGGCTTTATTTTTGTGGTGGGTGGACATAATGGAGTCTCACATTTGT  1480

Query 1481  CCAGCATTGAAAGATACGATCCTCATCAAAATCAGTGGACTGTGTGTAGACCAATGAAAGAACCTAGAACAGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAGCATTGAAAGATACGATCCTCATCAAAATCAGTGGACTGTGTGTAGACCAATGAAAGAACCTAGAACAGGA  1554

Query 1555  GTTGGTGCTGCTGTAATCGATAACTACCTTTATGTCGTCGGTGGTCACTCAGGGTCTTCCTATCTGAATACAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTGGTGCTGCTGTAATCGATAACTACCTTTATGTCGTCGGTGGTCACTCAGGGTCTTCCTATCTGAATACAGT  1628

Query 1629  GCAGAAATATGATCCTATCTCAGATACGTGGCTGGATTCAGCTGGCATGATATACTGTCGCTGCAACTTTGGGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGAAATATGATCCTATCTCAGATACGTGGCTGGATTCAGCTGGCATGATATACTGTCGCTGCAACTTTGGGT  1702

Query 1703  TAACTGCACTT  1713
            |||||||||||
Sbjct 1703  TAACTGCACTT  1713