Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03509
• Subject: XM_017021391.1
• Aligned Length: 2145
• Identities: 2133
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ------------ATGCACCTAAAGCCATATTGGAAGCTCCAGAAGAAAGAGCACCCCCCGGAAGTCAGCAGGGA  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTTTGTTATGCACCTAAAGCCATATTGGAAGCTCCAGAAGAAAGAGCACCCCCCGGAAGTCAGCAGGGA  74

Query   63  AACGCAGAGAACTCCTATGAACCACCAAAAGGCTGTAAATGATGAAACATGCAAAGCTAGCCACATAACATCAA  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACGCAGAGAACTCCTATGAACCACCAAAAGGCTGTAAATGATGAAACATGCAAAGCTAGCCACATAACATCAA  148

Query  137  GTGTCTTTCCTTCAGCCTCTCTCGGTAAAGCATCATCTCGAAAGCCATTTGGGATCCTTTCTCCAAATGTTCTG  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGTCTTTCCTTCAGCCTCTCTCGGTAAAGCATCATCTCGAAAGCCATTTGGGATCCTTTCTCCAAATGTTCTG  222

Query  211  TGCAGTATGAGTGGGAAGAGTCCTGTAGAGAGCAGCTTGAATGTTAAAACCAAAAAGAATGCACCATCTGCAAC  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAGTATGAGTGGGAAGAGTCCTGTAGAGAGCAGCTTGAATGTTAAAACCAAAAAGAATGCACCATCTGCAAC  296

Query  285  GATCCACCAGGGCGAAGAAGAAGGACCACTTGATATCTGGGCTGTTGTGAAACCTGGAAATACCAAGGAAAAAA  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCCACCAGGGCGAAGAAGAAGGACCACTTGATATCTGGGCTGTTGTGAAACCTGGAAATACCAAGGAAAAAA  370

Query  359  TTGCATTCTTTGCATCCCACCAGTGTAGTAACAGGATAGGATCTATGAAAATAAAAAGTTCCTGGGATATTGAT  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGCATTCTTTGCATCCCACCAGTGTAGTAACAGGATAGGATCTATGAAAATAAAAAGTTCCTGGGATATTGAT  444

Query  433  GGGAGAGCTACTAAGAGAAGGAAAAAATCAGGGGATCTTAAAAAAGCCAAGGTACAGGTGGAAAGGATGAGGGA  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGAGAGCTACTAAGAGAAGGAAAAAATCAGGGGATCTTAAAAAAGCCAAGGTACAGGTGGAAAGGATGAGGGA  518

Query  507  GGTTAACAGCAGGTGCTACCAACCTGAGCCTTTTGCATGTGGCATTGAGCACTGTTCTGTGCACTATGTGAGTG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTTAACAGCAGGTGCTACCAACCTGAGCCTTTTGCATGTGGCATTGAGCACTGTTCTGTGCACTATGTGAGTG  592

Query  581  ACAGTGGGGATGGAGTCTATGCTGGGAGGCCTCTGTCAGTTATACAGATGGTTGCCTTCTTGGAGCAAAGAGCC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGTGGGGATGGAGTCTATGCTGGGAGGCCTCTGTCAGTTATACAGATGGTTGCCTTCTTGGAGCAAAGAGCC  666

Query  655  AGTGCTCTGCTAGCTAGCTGTTCAAAAAACTGCACAAACTCACCTGCAATTGTGAGGTTTTCTGGCCAATCCAG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGCTCTGCTAGCTAGCTGTTCAAAAAACTGCACAAACTCACCTGCAATTGTGAGGTTTTCTGGCCAATCCAG  740

Query  729  AGGTGTGCCTGCAGTGTCTGAGTCCTATTCTGCCCCAGGAGCTTGTGAAGAACCCACAGAAAGGGGAAATCTTG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGTGTGCCTGCAGTGTCTGAGTCCTATTCTGCCCCAGGAGCTTGTGAAGAACCCACAGAAAGGGGAAATCTTG  814

Query  803  AGGTTGGTGAACCACAGAGCGAACCAGTCCGTGTCCTTGACATGGTAGCCAAGTTGGAGTCTGAGTGCCTGAAG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGTTGGTGAACCACAGAGCGAACCAGTCCGTGTCCTTGACATGGTAGCCAAGTTGGAGTCTGAGTGCCTGAAG  888

Query  877  CGGCAGGGCCAGCGTGAGCCTGGGAGCCTCTCAAGGAATAACAGCTTCCGTCGAAATGTGGGCAGAGTATTGCT  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGCAGGGCCAGCGTGAGCCTGGGAGCCTCTCAAGGAATAACAGCTTCCGTCGAAATGTGGGCAGAGTATTGCT  962

Query  951  TGCAAATAGCACTCAGGCTGATGAAGGCAAAACAAAGAAAGGCGTCTTGGAGGCACCTGACACTCAGGTGAATC  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCAAATAGCACTCAGGCTGATGAAGGCAAAACAAAGAAAGGCGTCTTGGAGGCACCTGACACTCAGGTGAATC  1036

Query 1025  CTGTGGGGTCTGTATCTGTGGATTGTGGCCCTTCAAGAGCTGATCGTTGTTCTCCTAAGGAGGACCAGGCCTGG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGTGGGGTCTGTATCTGTGGATTGTGGCCCTTCAAGAGCTGATCGTTGTTCTCCTAAGGAGGACCAGGCCTGG  1110

Query 1099  GACGGTGCTTCTCAGGACTGCCCCCCATTGCCAGCAGGAGTGAGTTTCCACATAGACAGTGCAGAGTTAGAGCC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACGGTGCTTCTCAGGACTGCCCCCCATTGCCAGCAGGAGTGAGTTTCCACATAGACAGTGCAGAGTTAGAGCC  1184

Query 1173  GGGTTCGCAAACTGCCGTGAAAAACAGCAACAGATATGATGTGGAAATGACAGATGAACTCGTTGGGTTACCTT  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGTTCGCAAACTGCCGTGAAAAACAGCAACAGATATGATGTGGAAATGACAGATGAACTCGTTGGGTTACCTT  1258

Query 1247  TTTCCTCTCATACCTATTCCCAAGCCTCTGAATTGCCCACAGATGCTGTTGATTGTATGAGCAGAGAGCTTGTG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTCCTCTCATACCTATTCCCAAGCCTCTGAATTGCCCACAGATGCTGTTGATTGTATGAGCAGAGAGCTTGTG  1332

Query 1321  TCCCTTACTAGCCGAAATCCTGATCAAAGAAAAGAATCTTTGTGCATTAGTATCACTGTGTCCAAGGTAGACAA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCCTTACTAGCCGAAATCCTGATCAAAGAAAAGAATCTTTGTGCATTAGTATCACTGTGTCCAAGGTAGACAA  1406

Query 1395  AGACCAGCCTTCCATTTTAAACTCCTGTGAAGACCCAGTTCCAGGGATGTTGTTTTTTTTGCCACCTGGTCAGC  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGACCAGCCTTCCATTTTAAACTCCTGTGAAGACCCAGTTCCAGGGATGTTGTTTTTTTTGCCACCTGGTCAGC  1480

Query 1469  ACTTGTCAGACTATTCCCAGTTGAATGAAAGCACAACAAAAGAGTCTTCAGAGGCCAGCCAGCTTGAAGATGCT  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTTGTCAGACTATTCCCAGTTGAATGAAAGCACAACAAAAGAGTCTTCAGAGGCCAGCCAGCTTGAAGATGCT  1554

Query 1543  GCTGGGGGTGACAGTGCATCTGAGGAAAAAAGTGGGTCTGCTGAGCCATTTGTACTGCCAGCCTCTTCTGTGGA  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTGGGGGTGACAGTGCATCTGAGGAAAAAAGTGGGTCTGCTGAGCCATTTGTACTGCCAGCCTCTTCTGTGGA  1628

Query 1617  AAGTACATTACCAGTGCTTGAGGCATCCAGTTGGAAGAAGCAGGTGTCGCATGACTTCCTGGAGACCAGGTTTA  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGTACATTACCAGTGCTTGAGGCATCCAGTTGGAAGAAGCAGGTGTCGCATGACTTCCTGGAGACCAGGTTTA  1702

Query 1691  AAATCCAGCAGCTTTTGGAGCCTCAGCAGTACATGGCTTTTCTGCCCCACCACATTATGGTAAAAATCTTCAGG  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAATCCAGCAGCTTTTGGAGCCTCAGCAGTACATGGCTTTTCTGCCCCACCACATTATGGTAAAAATCTTCAGG  1776

Query 1765  TTACTTCCCACCAAGAGTTTAGTGGCCCTTAAATGTACCTGCTGCTATTTCAAGTTTATCATTGAGTACTACAA  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTACTTCCCACCAAGAGTTTAGTGGCCCTTAAATGTACCTGCTGCTATTTCAAGTTTATCATTGAGTACTACAA  1850

Query 1839  TATCAGGCCAGCAGATTCTCGCTGGGTTCGAGATCCACGCTATAGAGAGGATCCTTGCAAACAGTGCAAGAAAA  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TATCAGGCCAGCAGATTCTCGCTGGGTTCGAGATCCACGCTATAGAGAGGATCCTTGCAAACAGTGCAAGAAAA  1924

Query 1913  AGTATGTGAAAGGGGATGTGTCCCTGTGCCGATGGCACCCCAAGCCCTATTGCCAGGCATTGCCCTATGGGCCA  1986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGTATGTGAAAGGGGATGTGTCCCTGTGCCGATGGCACCCCAAGCCCTATTGCCAGGCATTGCCCTATGGGCCA  1998

Query 1987  GGGTATTGGATGTGCTGCCACCGGTCTCAGAAAGGATTCCCTGGCTGTAAGCTGGGGCTTCATGACAATCACTG  2060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGGTATTGGATGTGCTGCCACCGGTCTCAGAAAGGATTCCCTGGCTGTAAGCTGGGGCTTCATGACAATCACTG  2072

Query 2061  GGTTCCTGCCTGCCACAGCTTTAATCGGGCAATCCATAAGAAAGCAAAAGGGACTGAAGCTGAAGAGGAATAC  2133
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGTTCCTGCCTGCCACAGCTTTAATCGGGCAATCCATAAGAAAGCAAAAGGGACTGAAGCTGAAGAGGAATAC  2145