Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03526
- Subject:
- NM_018054.6
- Aligned Length:
- 2643
- Identities:
- 2409
- Gaps:
- 234
Alignment
Query 1 ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT 74
Query 75 TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT 148
Query 149 TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT 222
Query 223 GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA 296
Query 297 TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT 370
Query 371 ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG 444
Query 445 GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT 518
Query 519 AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA 592
Query 593 TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC 666
Query 667 CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGATAAGTGGGCGGAAAA 740
Query 741 ACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAGATTGCGCTGCCCATTGAAGCCT 814
Query 815 GTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAATTGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTA 888
Query 889 AAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCTATTCAGACCCCCATGCTGTAGC 962
Query 963 AGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTTAATCTGTATGAAGAATGGACAC 1036
Query 1037 AAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAACATGTCAGAAGTTGCCACCACAA 1110
Query 1111 AATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGACCAGCGATGTGAATAAAATGAC 1184
Query 1185 TCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAATGAAGGAACACTTGCTGAAATGG 1258
Query 1259 CAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCATGCCGACTGGTTCTTCCCTGAA 1332
Query 1333 GAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTTCTAATCACTCATTCCACACTGG 1406
Query 1407 AAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCGGTGATGGAAGGAGACTTGGTGA 1480
Query 1481 AGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGGTGGCACTCTAAATAGAAAGCAC 1554
||||||||
Sbjct 1481 AGAAGGAA------------------------------------------------------------------ 1488
Query 1555 ATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGGTGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCC 1628
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1629 TCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCTTCCGCGGGCATACTGGAGCAGG 1702
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1703 GGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 --------------------AGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGCAGCTGTGCCAGCACCAGGGAGA 1542
Query 1777 AACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 AACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCTCCCACCAGCTCTCCATGGGCCA 1616
Query 1851 ACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 ACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAAAAACCCGCTCCAGCACCCCCGA 1690
Query 1925 AACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 AACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAACATCTCAGCATCCACCCAGTCTG 1764
Query 1999 TCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 TCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCCAGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGC 1838
Query 2073 CCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 CCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATCCAAGCTCCCAATCACCCACCGC 1912
Query 2147 CGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCAGGGCCCTCCCAACCCCATGGCA 1986
Query 2221 TTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 TTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTCCAACGCCCCCCAGTACTCCGCC 2060
Query 2295 CCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 CCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGTAACCCTGAAACTGCACAGCCAC 2134
Query 2369 ATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 ATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCCCAGCGTGCCCCCACCCCCCCAA 2208
Query 2443 CCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 CCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAACAGCTTCCAAGATAGTAACAGA 2282
Query 2517 CTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 CTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCACTCAGACTCAGCCAGCAAAGACG 2356
Query 2591 TGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG 2643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 TGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCTG 2409