Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03526
• Subject: XM_011545877.3
• Aligned Length: 2739
• Identities: 2412
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  ATGAAGAAGCAGTTCAACCGCATGAAGCAGCTGGCTAACCAGACCGTGGGCAGAGCTGAGAAAACAGAAGTCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAGTGAAGATCTATTACAGATTGAGAGACGCCTGGACACGGTGCGGTCAATATGCCACCATTCCCATAAGCGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTGGCATGTTTCCAGGGCCAGCATGGCACCGATGCCGAGAGGAGACACAAAAAACTGCCTCTGACAGCTCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCTCAAAATATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  296
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGCAAGAAGCATCGACTCAGCTGGAAGACTCTCTCCTGGGGAAGATGCTGGAGACGTGTGGAGA  65

Query  297  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   66  TGCTGAGAATCAGCTGGCTCTCGAGCTCTCCCAGCACGAAGTCTTTGTTGAGAAGGAGATCGTGGACCCTCTGT  139

Query  371  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  ACGGCATAGCTGAGGTGGAGATTCCCAACATCCAGAAGCAGAGGAAGCAGCTTGCAAGATTGGTGTTAGACTGG  213

Query  445  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  GATTCAGTCAGAGCCAGGTGGAACCAAGCTCACAAATCCTCAGGAACCAACTTTCAGGGGCTTCCATCAAAAAT  287

Query  519  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  AGATACTCTAAAGGAAGAGATGGATGAAGCTGGAAATAAAGTAGAACAGTGCAAGGATCAACTTGCAGCAGACA  361

Query  593  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TGTACAACTTTATGGCCAAAGAAGGGGAGTATGGCAAATTCTTTGTTACGTTATTAGAAGCCCAAGCAGATTAC  435

Query  667  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCA------------------  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  436  CATAGAAAAGCATTAGCAGTCTTAGAAAAGACCCTCCCCGAAATGCGAGCCCATCAAGGCAGCCCACTAAACCC  509

Query  723  --------------------------------------------------------------------------  722
                                                                                      
Sbjct  510  GCTGGCGTGTGTTGATGAAGTGTGGTGCAGGTGCAGCGTGCCACTGCAGCTTCTGGGCAGCCTGAGTTGGTGCC  583

Query  723  ----AGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAG  792
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  ATCTAGATAAGTGGGCGGAAAAACCAGCCTTTGGGACTCCCCTAGAAGAACACCTGAAGAGGAGCGGGCGCGAG  657

Query  793  ATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAAT  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  ATTGCGCTGCCCATTGAAGCCTGTGTCATGCTGCTTCTGGAGACAGGCATGAAGGAGGAGGGCCTTTTCCGAAT  731

Query  867  TGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCT  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  TGGGGCTGGGGCCTCCAAGTTAAAGAAGCTGAAAGCTGCTTTGGACTGTTCTACTTCTCACCTGGATGAGTTCT  805

Query  941  ATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTT  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  ATTCAGACCCCCATGCTGTAGCAGGTGCTTTAAAATCCTATTTACGGGAATTGCCTGAACCTTTGATGACTTTT  879

Query 1015  AATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAAC  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  AATCTGTATGAAGAATGGACACAAGTTGCAAGTGTGCAGGATCAAGACAAAAAACTTCAAGACTTGTGGAGAAC  953

Query 1089  ATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGA  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  ATGTCAGAAGTTGCCACCACAAAATTTTGTTAACTTTAGATATTTGATCAAGTTCCTTGCAAAGCTTGCTCAGA  1027

Query 1163  CCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAAT  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  CCAGCGATGTGAATAAAATGACTCCCAGCAACATTGCGATTGTGTTAGGCCCTAACTTGTTATGGGCCAGAAAT  1101

Query 1237  GAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCA  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  GAAGGAACACTTGCTGAAATGGCAGCAGCCACATCCGTCCATGTGGTTGCAGTGATTGAACCCATCATTCAGCA  1175

Query 1311  TGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTT  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  TGCCGACTGGTTCTTCCCTGAAGAGGTGGAATTTAATGTATCAGAAGCATTTGTACCTCTCACCACCCCGAGTT  1249

Query 1385  CTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCG  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CTAATCACTCATTCCACACTGGAAACGACTCTGACTCGGGGACCCTGGAGAGGAAGCGGCCTGCTAGCATGGCG  1323

Query 1459  GTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGG  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  GTGATGGAAGGAGACTTGGTGAAGAAGGAAAGCTTTGGTGTGAAGCTTATGGACTTCCAGGCCCACCGGCGGGG  1397

Query 1533  TGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGG  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  TGGCACTCTAAATAGAAAGCACATATCCCCCGCTTTCCAGCCGCCACTTCCGCCCACAGATGGCAGCACCGTGG  1471

Query 1607  TGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCT  1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  TGCCCGCTGGCCCAGAGCCCCCTCCCCAGAGCTCTAGGGCTGAAAGCAGCTCTGGGGGTGGGACTGTCCCCTCT  1545

Query 1681  TCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGC  1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  TCCGCGGGCATACTGGAGCAGGGGCCGAGCCCAGGCGACGGCAGTCCTCCCAAACCGAAGGACCCTGTATCTGC  1619

Query 1755  AGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCT  1828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  AGCTGTGCCAGCACCAGGGAGAAACAACAGTCAGATAGCATCTGGCCAAAATCAGCCCCAGGCAGCTGCTGGCT  1693

Query 1829  CCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAA  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  CCCACCAGCTCTCCATGGGCCAACCTCACAATGCTGCAGGGCCCAGCCCGCATACACTGCGCCGAGCTGTTAAA  1767

Query 1903  AAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAAC  1976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  AAACCCGCTCCAGCACCCCCGAAACCGGGCAACCCACCTCCTGGCCACCCCGGGGGCCAGAGTTCTTCAGGAAC  1841

Query 1977  ATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCC  2050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  ATCTCAGCATCCACCCAGTCTGTCACCAAAGCCACCCACCCGAAGCCCCTCTCCTCCCACCCAGCACACGGGCC  1915

Query 2051  AGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATC  2124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  AGCCTCCAGGCCAGCCCTCCGCCCCCTCCCAGCTCTCAGCACCCCGGAGGTACTCCAGCAGCTTGTCTCCAATC  1989

Query 2125  CAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCA  2198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990  CAAGCTCCCAATCACCCACCGCCGCAGCCCCCTACGCAGGCCACGCCACTGATGCACACCAAACCCAATAGCCA  2063

Query 2199  GGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTC  2272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064  GGGCCCTCCCAACCCCATGGCATTGCCCAGTGAGCATGGACTTGAGCAGCCATCTCACACCCCTCCCCAGACTC  2137

Query 2273  CAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGT  2346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138  CAACGCCCCCCAGTACTCCGCCCCTAGGAAAACAGAACCCCAGTCTGCCAGCTCCTCAGACCCTGGCAGGGGGT  2211

Query 2347  AACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCC  2420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212  AACCCTGAAACTGCACAGCCACATGCTGGAACCTTACCGAGACCGAGACCAGTACCAAAGCCAAGGAACCGGCC  2285

Query 2421  CAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAA  2494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286  CAGCGTGCCCCCACCCCCCCAACCTCCTGGTGTCCACTCAGCTGGGGACAGCAGCCTCACCAACACAGCACCAA  2359

Query 2495  CAGCTTCCAAGATAGTAACAGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCAC  2568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360  CAGCTTCCAAGATAGTAACAGACTCCAATTCCAGGGTTTCAGAACCGCATCGCAGCATCTTTCCTGAAATGCAC  2433

Query 2569  TCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCT  2642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434  TCAGACTCAGCCAGCAAAGACGTGCCTGGCCGCATCCTGCTGGATATAGACAATGATACCGAGAGCACTGCCCT  2507

Query 2643  G  2643
            |
Sbjct 2508  G  2508