Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03530
- Subject:
- XM_017012389.1
- Aligned Length:
- 2379
- Identities:
- 2052
- Gaps:
- 327
Alignment
Query 1 ATGGCCGGCCTGACCTTATTTGTGGGCCGCCTCCCGCCCTCGGCCCGCAGTGAGCAGCTGGAGGAACTGTTCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGGCCTGACCTTATTTGTGGGCCGCCTCCCGCCCTCGGCCCGCAGTGAGCAGCTGGAGGAACTGTTCAG 74
Query 75 TCAGGTGGGGCCGGTGAAGCAGTGCTTCGTGGTGACTGAAAA-------------------------------- 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGGTGGGGCCGGTGAAGCAGTGCTTCGTGGTGACTGAAAAAGTTTATGTAGATCAGTGTCCTGTGTCAAAGG 148
Query 117 ----------------------------------------------------------------------AGGG 120
||||
Sbjct 149 GCTTATACCCTGAAGGAGATTCAAATGCAGTGGAAAGAGAAGCAGAGCATATGAACTATGTGTCCTTTTCAGGG 222
Query 121 AGTAAGGCATGTCGAGGCTTTGGCTATGTCACTTTTTCAATGCTGGAAGATGTTCAGAGGGCCCTCAAGGAGAT 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTAAGGCATGTCGAGGCTTTGGCTATGTCACTTTTTCAATGCTGGAAGATGTTCAGAGGGCCCTCAAGGAGAT 296
Query 195 TACCACCTTTGAAGGTTGCAAGATCAACGTGACTGTTGCCAAGAAAAAACTGAGGAACAAGACAAAGGAAAAGG 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACCACCTTTGAAGGTTGCAAGATCAACGTGACTGTTGCCAAGAAAAAACTGAGGAACAAGACAAAGGAAAAGG 370
Query 269 GGAAAAATGAAAACTCAGAGTGCCCAAAGAAGGAGCCGAAGGCTAAAAAAGCCAAAGTGGCAGATAAGAAAGCC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAAAATGAAAACTCAGAGTGCCCAAAGAAGGAGCCGAAGGCTAAAAAAGCCAAAGTGGCAGATAAGAAAGCC 444
Query 343 AGATTAATTATTCGGAACCTGAGCTTTAAGTGTTCAGAAGATGACTTGAAGACAGTATTTGCTCAATTTGGAGC 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGATTAATTATTCGGAACCTGAGCTTTAAGTGTTCAGAAGATGACTTGAAGACAGTATTTGCTCAATTTGGAGC 518
Query 417 TGTCCTGGAAGTAAATATCCCTAGGAAACCAGATGGGAAGATGCGCGGTTTTGGTTTTGTTCAGTTCAAAAACC 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTCCTGGAAGTAAATATCCCTAGGAAACCAGATGGGAAGATGCGCGGTTTTGGTTTTGTTCAGTTCAAAAACC 592
Query 491 TCCTAGAAGCAGGTAAAGCTCTCAAAGGCATGAACATGAAAGAGATAAAAGGCCGGACAGTGGCTGTGGATTGG 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCTAGAAGCAGGTAAAGCTCTCAAAGGCATGAACATGAAAGAGATAAAAGGCCGGACAGTGGCTGTGGATTGG 666
Query 565 GCCGTGGCAAAGGATAAATATAAAGATACACAGTCTGTTTCTGCTATAGGTGAGGAAAAGAGCCATGAATCTAA 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCGTGGCAAAGGATAAATATAAAGATACACAGTCTGTTTCTGCTATAGGTGAGGAAAAGAGCCATGAATCTAA 740
Query 639 ACATCAGGAATCAGTTAAAAAGAAGGGCAGAGAGGAAGAGGATATGGAAGAGGAAGAAAACGATGATGATGACG 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACATCAGGAATCAGTTAAAAAGAAGGGCAGAGAGGAAGAGGATATGGAAGAGGAAGAAAACGATGATGATGACG 814
Query 713 ATGATGATGATGAAGAAGATGGGGTTTTTGATGATGAAGATGAAGAGGAAGAGAATATAGAATCAAAGGTGACC 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGATGATGATGAAGAAGATGGGGTTTTTGATGATGAAGATGAAGAGGAAGAGAATATAGAATCAAAGGTGACC 888
Query 787 AAGCCTGTGCAAATTCAGAAGAGAGCAGTCAAGAGACCAGCCCCTGCAAAAAGCAGTGATCATTCTGAGGAGGA 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCCTGTGCAAATTCAGAAGAGAGCAGTCAAGAGACCAGCCCCTGCAAAAAGCAGTGATCATTCTGAGGAGGA 962
Query 861 CAGTGACCTAGAGGAAAGCGATAGTATTGATGATGGAGAGGAACTGGCTCAGAGTGATACCAGCACTGAGGAGC 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTGACCTAGAGGAAAGCGATAGTATTGATGATGGAGAGGAACTGGCTCAGAGTGATACCAGCACTGAGGAGC 1036
Query 935 AAGAGGATAAAGCTGTGCAAGTCTCAAACAAAAAGAAGAGGAAATTACCCTCTGATGTGAATGAAGGGAAAACT 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGAGGATAAAGCTGTGCAAGTCTCAAACAAAAAGAAGAGGAAATTACCCTCTGATGTGAATGAAGGGAAAACT 1110
Query 1009 GTTTTTATCAGAAATCTGTCCTTTGACTCAGAAGAAGAAGAACTTGGGGAGCTTCTCCAACAGTTTGGAGAACT 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTTTTTATCAGAAATCTGTCCTTTGACTCAGAAGAAGAAGAACTTGGGGAGCTTCTCCAACAGTTTGGAGAACT 1184
Query 1083 CAAATATGTCCGCATTGTCTTGCATCCAGACACAGAGCATTCTAAAGGTTGTGCATTTGCCCAGTTCATGACTC 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAAATATGTCCGCATTGTCTTGCATCCAGACACAGAGCATTCTAAAGGTTGTGCATTTGCCCAGTTCATGACTC 1258
Query 1157 AAGAAGCAGCTCAGAAATGCCTTCTAGCTGCTTCTCCAGAGAATGAGGCTGGTGGGCTTAAACTGGATGGCCGG 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGAAGCAGCTCAGAAATGCCTTCTAGCTGCTTCTCCAGAGAATGAGGCTGGTGGGCTTAAACTGGATGGCCGG 1332
Query 1231 CAGCTCAAGGTTGACTTGGCGGTGACCCGTGATGAGGCTGCAAAGCTTCAGACGACGAAGGTGAAGAAGCCGAC 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCTCAAGGTTGACTTGGCGGTGACCCGTGATGAGGCTGCAAAGCTTCAGACGACGAAGGTGAAGAAGCCGAC 1406
Query 1305 TGGCACCCGGAATCTCTATCTGGCCCGAGAAGGCTTGATTCGTGCTGGGACGAAGGCTGCAGAGGGTGTGAGTG 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGCACCCGGAATCTCTATCTGGCCCGAGAAGGCTTGATTCGTGCTGGGACGAAGGCTGCAGAGGGTGTGAGTG 1480
Query 1379 CTGCTGATATGGCCAAAAGAGAACGGTTTGAGCTGCTGAAGCATCAGAAACTCAAGGACCAGAATATCTTTGTC 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGCTGATATGGCCAAAAGAGAACGGTTTGAGCTGCTGAAGCATCAGAAACTCAAGGACCAGAATATCTTTGTC 1554
Query 1453 TCCCGAACCAGGCTCTGCCTGCACAATCTCCCAAAGGCTGTAGATGACAAACAGCTCAGAAAGCTGCTGCTGAG 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCCCGAACCAGGCTCTGCCTGCACAATCTCCCAAAGGCTGTAGATGACAAACAGCTCAGAAAGCTGCTGCTGAG 1628
Query 1527 TGCTACTAGTGGAGAGAAAGGGGTGCGCATCAAGGAGTGTAGAGTGATGCGAGACCTCAAAGGAGTTCATGGGA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCTACTAGTGGAGAGAAAGGGGTGCGCATCAAGGA-------------------------------------- 1664
Query 1601 ACATGAAGGGTCAGTCCCTGGGCTACGCCTTTGCGGAGTTCCAAGAGCACGAGCATGCCCTGAAAGCCCTCCGC 1674
Sbjct 1665 -------------------------------------------------------------------------- 1664
Query 1675 CTCATCAACAACAATCCAGAAATCTTTGGGCCTCTGAAGAGACCAATAGTGGAGTTCTCTTTAGAAGATCGAAG 1748
Sbjct 1665 -------------------------------------------------------------------------- 1664
Query 1749 AAAACTTAAAATGAAGGAATTAAGGATCCAGCGCAGCTTGCAAAAAATGAGATCCAAGCCTGCAACTGGTGAGC 1822
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665 ---------------------------------------GCAAAAAATGAGATCCAAGCCTGCAACTGGTGAGC 1699
Query 1823 CTCAGAAGGGGCAACCAGAGCCTGCAAAAGACCAGCAACAGAAGGCAGCTCAACACCACACAGAGGAACAAAGC 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CTCAGAAGGGGCAACCAGAGCCTGCAAAAGACCAGCAACAGAAGGCAGCTCAACACCACACAGAGGAACAAAGC 1773
Query 1897 AAGGTGCCCCCAGAGCAGAAGAGAAAGGCGGGCTCTACCTCATGGACCGGGTTCCAGACCAAGGCTGAAGTGGA 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 AAGGTGCCCCCAGAGCAGAAGAGAAAGGCGGGCTCTACCTCATGGACCGGGTTCCAGACCAAGGCTGAAGTGGA 1847
Query 1971 GCAGGTGGAGCTGCCTGATGGAAAGAAGAGAAGAAAGGTCCTGGCGCTCCCCTCACACCGAGGCCCCAAAATCA 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 GCAGGTGGAGCTGCCTGATGGAAAGAAGAGAAGAAAGGTCCTGGCGCTCCCCTCACACCGAGGCCCCAAAATCA 1921
Query 2045 GGTTGCGGGACAAAGGCAAAGTGAAGCCCGTCCATCCCAAAAAGCCAAAGCCACAGATAAACCAGTGGAAGCAG 2118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 GGTTGCGGGACAAAGGCAAAGTGAAGCCCGTCCATCCCAAAAAGCCAAAGCCACAGATAAACCAGTGGAAGCAG 1995
Query 2119 GAGAAGCAGCAATTATCGTCCGAGCAGGTATCTAGGAAAAAAGCTAAGGGAAATAAGACGGAAACCCGCTTCAA 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 GAGAAGCAGCAATTATCGTCCGAGCAGGTATCTAGGAAAAAAGCTAAGGGAAATAAGACGGAAACCCGCTTCAA 2069
Query 2193 CCAGCTGGTCGAACAATATAAGCAGAAATTATTGGGACCTTCTAAAGGAGCACCTCTTGCAAAGAGGAGCAAAT 2266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CCAGCTGGTCGAACAATATAAGCAGAAATTATTGGGACCTTCTAAAGGAGCACCTCTTGCAAAGAGGAGCAAAT 2143
Query 2267 GGTTTGATAGT 2277
|||||||||||
Sbjct 2144 GGTTTGATAGT 2154