Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03543
• Subject: NM_001033136.3
• Aligned Length: 1430
• Identities: 1200
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ATGTCTAGACTGGGAGCCCTGGGTGGTGCCCGTGCCGGGCTGGGACTGTTGCTGGGTACCGCCGCCGGCCTTGG  74
            ||||||||||||||.||||||||.||..||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTAGACTGGGGGCCCTGGGCGGCTCCCGCGCCGGGTTGGGACTGTTACTTGGTACTGCCGCCGGCCTTGG  74

Query   75  ATTCCTGTGCCTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGTCATGGCCGCAGCCAGAGCCTGCCCAACT  148
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  ATTCCTGTGCGTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGCCATGGCCGGAGTCACAGTCTGCCCAACT  148

Query  149  CCCTGGACTATACGCAGACTTCAGATCCCGGACGCCACGTGATGCTCCTGCGGGCTGTCCCAGGTGGGGCTGGA  222
            |||||||||||.|||||.|||||||.|..||||||||.||||..|...|.||||||.|||||||||..||||||
Sbjct  149  CCCTGGACTATGCGCAGGCTTCAGAGCGTGGACGCCAGGTGACACAGTTTCGGGCTATCCCAGGTGAAGCTGGA  222

Query  223  GATGCCTCAGTGCTGCCCAGCCTTCCACGGGAAGGACAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296
            |||||..|..|.|||||||||||..|||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGCTGCCATACTGCCCAGCCTCTCACAGGAAGGGCAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296

Query  297  CAGCCTTGTGGCGCTGCGGCGGGAGGTGGAGGAGCT---GAGAAGCAGCCTGCGAGGGCTTGCGGGGGAGATTG  367
            |||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||   ||||   |||||||.|||.||.||.||||||||||
Sbjct  297  CAGTCTTATGGCGCTGCGGCGCGAGGTGGAGGAGCTTCAGAGA---AGCCTGCAAGGACTAGCTGGGGAGATTG  367

Query  368  TTGGGGAGGTCCGATGCCACATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAG  441
            |||||||||||||.|..||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||.|.|.|||
Sbjct  368  TTGGGGAGGTCCGCTCTCATATAGAAGAGAACCAGAGAGTGGCCCGGCGGCGCAGGTTCCCTTTTGCCAGAGAG  441

Query  442  AGGAGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGC--CACGTTCACAGATGCTGAG  513
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||  |||  |||||||.||.|||
Sbjct  442  AGGAGTGACTCCACGGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACCGCCTCCTCAGGGGCTGCAC--TCACAGACGCCGAG  513

Query  514  AGTGAAGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGG  587
            ||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||..|.|||||||||||.|||||.||.||||..||.|.
Sbjct  514  AGCGAGGGAGGTTATACAACAGCCAACGCGGAGTCTGATTACGAGCGGGACTCCGACAAGGAGAGTGGAGATGC  587

Query  588  GGAAGATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTT  661
            .||.||.|||||||||||.|||||.||||.|||||||||.|||||.|||||.|||.||||.|..|||||     
Sbjct  588  TGAGGACGAAGTGAGCTGCGAGACCGTGAGGATGGGGAGGAAGGACTCTCTGGACCTGGATGTGGAGGC-----  656

Query  662  CAGGTGCCTCCAGT------------GCCCTGGAGGCTGGA-GGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCT  722
                .||.||||||            |||.|||||| .||| |..|||||||||...||||||||||.||...|
Sbjct  657  ----GGCGTCCAGTCCGGCGGCGGCCGCCTTGGAGG-AGGATGACTCCTCAGGCCGAGAGGATGTGCAGCTGGT  725

Query  723  CCTGCAGCAGGCCGACGAGCTGCA-CAGGGGTG-ATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAA  794
            |||||.|||||||||.|||||||| |||||..| |  ||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CCTGCTGCAGGCCGATGAGCTGCACCAGGGCAGCA--AGCAGGACAAGCGGGAAGGCTTCCAGCTGCTGCTCAA  797

Query  795  CAACAAGCTGGTGTATGGAAGCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGC  868
            |||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||..||.|
Sbjct  798  CAATAAGCTGGCGTATGGAAGCCGACAAGACTTTCTGTGGCGCCTGGCCCGGGCCTACAGTGACATGTCAGACC  871

Query  869  TCACTGAGGAGGTGAGCGAGAAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAG  942
            |.||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  872  TTACTGAGGAGGAGAGCGGGAAGAAGTCCTATGCCCTAAATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGAAGAAA  945

Query  943  GGGGATGAGAGTGCTGACTGTCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCA  1016
            ||.|||||||||||||..||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||..
Sbjct  946  GGAGATGAGAGTGCTGCGTGCCACCTGTGGTATGCAGTGCTCTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGGGCATCTC  1019

Query 1017  GAGGCGCATCCAGAGTGGCTTTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCA  1090
            ||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||.|||||||||.||||||
Sbjct 1020  GAAACGCATCCAGAGTGGCTTTAGCTTCAAGGAACATGTGGACAAAGCCATTGAACTTCAGCCAGAAGACCCCA  1093

Query 1091  TGGCTCACTTTCTTCTTGGCAGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACA  1164
            .||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||.||||.|.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1094  GGGGTCACTTTCTTCTTGGCAGGTGGTGCTACCAGGTTTCTCACTTGAACTGGTTGGAAAAAAAAACGGCTACC  1167

Query 1165  GCCTTGCTTGAAAGCCCTCTCAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACA  1238
            ||||||.||||||||||.||.|||||.||||||.|.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1168  GCCTTGTTTGAAAGCCCCCTTAGTGCTACTGTGCAGGACGCTCTGCAGAGTTTCCTTAAGGCTGAGGAACTACA  1241

Query 1239  GCCAGGATTTTCCAAAGCAGGAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTA  1312
            ||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1242  GCCAGGATTTTCAAAAGCTGGACGGGTATATATTTCTAAGTGCTATAGAGAATTAGGAAAAAACTCTGAAGCTA  1315

Query 1313  GATGGTGGATGAAGTTGGCCCTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAA  1386
            ||..||||||||||.||||.|.|||.||||||||.|||||.||.|||||||..|||.||||.||.|||||||||
Sbjct 1316  GAAAGTGGATGAAGCTGGCTCAGGAACTGCCAGACGTCACTAATGAGGATTCAGCTTTCCAAAAAGACCTGGAA  1389

Query 1387  GAACTGGAAGTCATTTTACGAGAC  1410
            |||||.|||||.||||||.||   
Sbjct 1390  GAACTAGAAGTAATTTTAGGA---  1410