Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03543
• Subject: NM_001323895.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1023
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ATGTCTAGACTGGGAGCCCTGGGTGGTGCCCGTGCCGGGCTGGGACTGTTGCTGGGTACCGCCGCCGGCCTTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATTCCTGTGCCTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGTCATGGCCGCAGCCAGAGCCTGCCCAACT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCTGGACTATACGCAGACTTCAGATCCCGGACGCCACGTGATGCTCCTGCGGGCTGTCCCAGGTGGGGCTGGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATGCCTCAGTGCTGCCCAGCCTTCCACGGGAAGGACAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGCCTTGTGGCGCTGCGGCGGGAGGTGGAGGAGCTGAGAAGCAGCCTGCGAGGGCTTGCGGGGGAGATTGTTG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGGAGGTCCGATGCCACATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAGAGG  444
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------ATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAGAGG  57

Query  445  AGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGCCACGTTCACAGATGCTGAGAGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   58  AGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGCCACGTTCACAGATGCTGAGAGTGA  131

Query  519  AGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGGGGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  132  AGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGGGGAAG  205

Query  593  ATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTTCAGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  ATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTTCAGGT  279

Query  667  GCCTCCAGTGCCCTGGAGGCTGGAGGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCTCCTGCAGCAGGCCGACGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  280  GCCTCCAGTGCCCTGGAGGCTGGAGGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCTCCTGCAGCAGGCCGACGA  353

Query  741  GCTGCACAGGGGTGATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAACAACAAGCTGGTGTATGGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354  GCTGCACAGGGGTGATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAACAACAAGCTGGTGTATGGAA  427

Query  815  GCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGCTCACTGAGGAGGTGAGCGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  428  GCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGCTCACTGAGGAGGTGAGCGAG  501

Query  889  AAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAGGGGGATGAGAGTGCTGACTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  502  AAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAGGGGGATGAGAGTGCTGACTG  575

Query  963  TCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCAGAGGCGCATCCAGAGTGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  576  TCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCAGAGGCGCATCCAGAGTGGCT  649

Query 1037  TTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCATGGCTCACTTTCTTCTTGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  650  TTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCATGGCTCACTTTCTTCTTGGC  723

Query 1111  AGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACAGCCTTGCTTGAAAGCCCTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  724  AGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACAGCCTTGCTTGAAAGCCCTCT  797

Query 1185  CAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACAGCCAGGATTTTCCAAAGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  798  CAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACAGCCAGGATTTTCCAAAGCAG  871

Query 1259  GAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTAGATGGTGGATGAAGTTGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872  GAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTAGATGGTGGATGAAGTTGGCC  945

Query 1333  CTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAAGAACTGGAAGTCATTTTACG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  946  CTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAAGAACTGGAAGTCATTTTACG  1019

Query 1407  AGAC  1410
            ||||
Sbjct 1020  AGAC  1023