Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03543
• Subject: NM_001323897.1
• Aligned Length: 1488
• Identities: 1410
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGTCTAGACTGGGAGCCCTGGGTGGTGCCCGTGCCGGGCTGGGACTGTTGCTGGGTACCGCCGCCGGCCTTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTAGACTGGGAGCCCTGGGTGGTGCCCGTGCCGGGCTGGGACTGTTGCTGGGTACCGCCGCCGGCCTTGG  74

Query   75  ATTCCTGTGCCTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGTCATGGCCGCAGCCAGAGCCTGCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTCCTGTGCCTCCTTTACAGCCAGCGATGGAAACGGACCCAGCGTCATGGCCGCAGCCAGAGCCTGCCCAACT  148

Query  149  CCCTGGACTATACGCAGACTTCAGATCCCGGACGCCACGTGATGCTCCTGCGGGCTGTCCCAGGTGGGGCTGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTGGACTATACGCAGACTTCAGATCCCGGACGCCACGTGATGCTCCTGCGGGCTGTCCCAGGTGGGGCTGGA  222

Query  223  GATGCCTCAGTGCTGCCCAGCCTTCCACGGGAAGGACAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGCCTCAGTGCTGCCCAGCCTTCCACGGGAAGGACAGGAGAAGGTGCTGGACCGCCTGGACTTTGTGCTGAC  296

Query  297  CAGCCTTGTGGCGCTGCGGCGGGAGGTGGAGGAGCTGAGAAGCAGCCTGCGAGGGCTTGCGGGGGAGATTGTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCCTTGTGGCGCTGCGGCGGGAGGTGGAGGAGCTGAGAAGCAGCCTGCGAGGGCTTGCGGGGGAGATTGTTG  370

Query  371  GGGAGGTCCGATGCCACATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAGGTCCGATGCCACATGGAAGAGAACCAGAGAGTGGCTCGGCGGCGAAGGTTTCCGTTTGTCCGGGAGAGG  444

Query  445  AGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGCCACGTTCACAGATGCTGAGAGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGACTCCACTGGCTCCAGCTCTGTCTACTTCACGGCCTCCTCGGGAGCCACGTTCACAGATGCTGAGAGTGA  518

Query  519  AGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGGGGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGGGGTTACACAACAGCCAATGCGGAGTCTGACAATGAGCGGGACTCTGACAAAGAAAGTGAGGACGGGGAAG  592

Query  593  ATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTTCAGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAAGTGAGCTGTGAGACTGTGAAGATGGGGAGAAAGGATTCTCTTGACTTGGAGGAAGAGGCAGCTTCAGGT  666

Query  667  GCCTCCAGTGCCCTGGAGGCTGGAGGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCTCCTGCAGCAGGCCGACGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCTCCAGTGCCCTGGAGGCTGGAGGTTCCTCAGGCTTGGAGGATGTGCTGCCCCTCCTGCAGCAGGCCGACGA  740

Query  741  GCTGCACAGGGGTGATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAACAACAAGCTGGT--------  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  741  GCTGCACAGGGGTGATGAGCAAGGCAAGCGGGAGGGCTTCCAGCTGCTGCTCAACAACAAGCTGGTGGGTGTGG  814

Query  807  ----------------------------------------------------------------------GTAT  810
                                                                                  ||||
Sbjct  815  GGGAAGGCCAAGGCCCCCATTCTCCACAGTTGAGGAAAAAGGGGCCTCACCCGTTTCTGTCTGGTCTGCAGTAT  888

Query  811  GGAAGCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGCTCACTGAGGAGGTGAG  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAGCCGGCAGGACTTTCTCTGGCGCCTGGCCCGAGCCTACAGTGACATGTGTGAGCTCACTGAGGAGGTGAG  962

Query  885  CGAGAAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAGGGGGATGAGAGTGCTG  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGAGAAGAAGTCATATGCCCTAGATGGAAAAGAAGAAGCAGAGGCTGCTCTGGAGAAGGGGGATGAGAGTGCTG  1036

Query  959  ACTGTCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCAGAGGCGCATCCAGAGT  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTGTCACCTGTGGTATGCGGTGCTTTGTGGTCAGCTGGCTGAGCATGAGAGCATCCAGAGGCGCATCCAGAGT  1110

Query 1033  GGCTTTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCATGGCTCACTTTCTTCT  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCTTTAGCTTCAAGGAGCATGTGGACAAAGCCATTGCTCTCCAGCCAGAAAACCCCATGGCTCACTTTCTTCT  1184

Query 1107  TGGCAGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACAGCCTTGCTTGAAAGCC  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGCAGGTGGTGCTATCAGGTCTCTCACCTGAGCTGGCTAGAAAAAAAAACTGCTACAGCCTTGCTTGAAAGCC  1258

Query 1181  CTCTCAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACAGCCAGGATTTTCCAAA  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCTCAGTGCCACTGTGGAAGATGCCCTCCAGAGCTTCCTAAAGGCTGAAGAACTACAGCCAGGATTTTCCAAA  1332

Query 1255  GCAGGAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTAGATGGTGGATGAAGTT  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCAGGAAGGGTATATATTTCCAAGTGCTACAGAGAACTAGGGAAAAACTCTGAAGCTAGATGGTGGATGAAGTT  1406

Query 1329  GGCCCTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAAGAACTGGAAGTCATTT  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCCCTGGAGCTGCCAGATGTCACGAAGGAGGATTTGGCTATCCAGAAGGACCTGGAAGAACTGGAAGTCATTT  1480

Query 1403  TACGAGAC  1410
            ||||||||
Sbjct 1481  TACGAGAC  1488