Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03600
• Subject: XM_011248463.2
• Aligned Length: 1977
• Identities: 1711
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGTTTTGTACACGACCCCCTTTCCTAACAGCTGTCTGTCCGCCCTGCACTGTGTGTCCTGGGCCCTTATCTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||...||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGTTTTGTACACGACCCCCTTTCCTAATAGCTGTCTGTCTGCCCTCCACGCCGTGTCCTGGGCCCTCATCTT  74

Query   75  TCCATGCTACTGGCTGGTGGACCGGCTCGCT-GCCTCCTTCATACCCACCACCTACGAGAAGCGCCAGCGGGCA  147
            .|||||.|||||||||||||||||||| |.| |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct   75  CCCATGTTACTGGCTGGTGGACCGGCT-GTTGGCCTCTTTCATACCCACCACCTATGAGAAGCGCCAGAGGGCA  147

Query  148  GACGACCCGTGCTGCCTGCAGCTGCTCTGCACTGCCCTCTTCACGCCCATCTACCTGGCCCTCCTGGTGGCCTC  221
            ||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||..||||||||||.||.||.|||||..|
Sbjct  148  GATGACCCCTGCTGCCTGCAGCTGTTCTGCACGGTCCTCTTCACGCCAGTCTACCTGGCTCTGCTTGTGGCTGC  221

Query  222  GCTGCCCTTTGCGTTTCTCGGCTTTCTCTTCTGGTCCCCACTGCAGTCGGCCCGCCGGCCCTACATCTATTCAC  295
            .|||||||||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||..|||.||.|
Sbjct  222  ACTGCCCTTTGCCTTTCTCGGGTTCATCTTCTGGTCTCCACTGCAGTCTGCCCGCCGGCCCTACTCCTACTCCC  295

Query  296  GGCTGGAAGACAAGGGCCTGGCCGGTGGGGCAGCCCTGCTCAGTGAATGGAAGGGCACGGGGCCTGGCAAAAGC  369
            ||||.|||||||||..||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  296  GGCTAGAAGACAAGAACCCAGCTGGTGGGGCAGCCCTGCTTAGTGAATGGAAGGGCACGGGGGCAGGCAAAAGC  369

Query  370  TTCTGCTTTGCCACTGCCAACGTCTGCCTCCTGCCCGACTCACTCGCCAGGGTCAACAACCTTTTTAACACCCA  443
            ||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||..|.||.|||||.||
Sbjct  370  TTTTGCTTCGCCACGGCCAATGTCTGCCTCCTCCCCGACTCACTCGCGAGGCTCAATAATGTGTTCAACACTCA  443

Query  444  AGCGCGGGCCAAGGAGATCGGGCAGAGAATCCGCAATGGGGCCGCCCGGCCCCAGATCAAAATTTACATCGACT  517
            |||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  444  AGCTCGGGCCAAAGAGATTGGGCAGAGAATCCGCAATGGGGCCGCCAGGCCTCAGATCAAGATCTACATCGATT  517

Query  518  CCCCCACCAATACCTCCATCAGCGCCGCTAGCTTCAGCAGCCTGGTGTCACCACAGGGCGGCGATGGGGTGGCC  591
            |.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||   ..||
Sbjct  518  CTCCCACCAACACCTCCATCAGTGCAGCCAGCTTCAGCAGCCTGGTGTCGCCACAGGGTGGTGATGG---ATCC  588

Query  592  CGGGCCGTCCCCGGGAGCATTAAGAGGACAGCCTCTGTGGAGTACAAGGGTGACGGTGGGCGGCACCCCGGTGA  665
            .|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||.|.||
Sbjct  589  AGAGCTGTTCCTGGGAGCATTAAGAGGACAGCCTCTGTGGAATACAAGGGGGATGGTGGGCGTCACCCCAGCGA  662

Query  666  CGAGGCTGCCAACGGCCCAGCCTCTGGGGACC---CTGTCGACAGCAGCAGCCCGGAGGATGCCTGCATCGTGC  736
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|   |||.||      |.||||..|||||...||||||.||||
Sbjct  663  CGAGGCTGCCAACGGCCCAGCCTCTGGAGAACAGGCTGACG------GAAGCCTTGAGGACAGCTGCATTGTGC  730

Query  737  GCATCGGTGGCGAGGAGGGCGGCCGGCCACCTGAAGCTGACGACCCTG-TGCCTGGGGGCCAGGCCAGGAACGG  809
            |.||.|||||||||||.||.||.|||||||..||||||||.||||||| |||| |||.||||.||||||||.||
Sbjct  731  GAATTGGTGGCGAGGAAGGAGGTCGGCCACAAGAAGCTGATGACCCTGCTGCC-GGGAGCCAAGCCAGGAATGG  803

Query  810  AGCTGGCGGGGGCCCAAGGGGCCAGACGCCCAACCATAATCAGCAGGACGGGGATTCAGGGAGCCTGGGCAGCC  883
            .|||||.|||..|||||.|||||||||.||||||||.|||||||..||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  804  GGCTGGTGGGACCCCAAAGGGCCAGACACCCAACCACAATCAGCGAGATGGGGATTCTGGGAGCCTGGGCAGCC  877

Query  884  CCTCGGCCTCCCGGGAGTCCCTGGTGAAGGGGCGAGCTGGGCCAGACACCAGTGCCAGCGGGGAGCCAGGTGCC  957
            ||||.||||||.||||||||.|||||||||..||.|||||||.|||||...|||.||||||.||||||||.||.
Sbjct  878  CCTCAGCCTCCAGGGAGTCCTTGGTGAAGGCACGGGCTGGGCAAGACAGTGGTGGCAGCGGAGAGCCAGGGGCT  951

Query  958  AACAGCAAGCTCCTGTACAAGGCCTCGGTGGTGAAGAAGGCGGCTGCACGCAGGAGGCGGCACCCCGACGAGGC  1031
            |||||||||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  952  AACAGCAAGCTGCTGTATAAGACCTCTGTGGTGAAGAAGGCAGCAGCCCGCAGGAGGCGCCACCCTGATGAAGC  1025

Query 1032  CTTCGACCATGAGGTCTCCGCCTTCTTCCCCGCCAACCTGGACTTCCTGTGCCTGCAGGAGGTGTTTGACAAGC  1105
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  CTTTGACCACGAGGTCTCAGCCTTCTTCCCGGCCAATCTGGACTTCCTGTGCCTGCAGGAGGTGTTTGACAAGC  1099

Query 1106  GAGCAGCCACCAAATTGAAAGAGCAGCTGCACGGCTACTTCGAGTACATCCTGTACGACGTCGGGGTCTACGGC  1179
            |.||.||..|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1100  GTGCGGCTGCTAAGTTGAAAGAGCAGCTACACGGCTACTTCGAGTACATCCTGTATGATGTTGGGGTCTACGGT  1173

Query 1180  TGCCAGGGCTGCTGCAGCTTCAAGTGTCTCAACAGCGGCCTCCTCTTTGCCAGCCGCTACCCCATCATGGACGT  1253
            ||.||.||.|||||||..|||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1174  TGTCATGGTTGCTGCAATTTCAAATGTCTCAACAGCGGTCTCTTCTTCGCCAGCCGCTACCCTGTCATGGACGT  1247

Query 1254  GGCCTATCACTGTTACCCCAACAAGTGTAACGACGATGCCCTGGCCTCTAAGGGAGCTCTGTTTCTCAAGGTGC  1327
            |||||||||||||||||||||...|||.|.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  GGCCTATCACTGTTACCCCAATGGGTGCAGCTTCGATGCCCTGGCCTCTAAGGGAGCTCTGTTTCTCAAGGTGC  1321

Query 1328  AGGTGGGAAGCACACCTCAGGACCAAAGAATCGTCGGGTACATCGCCTGCACACACCTGCATGCCCCGCAAGAG  1401
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1322  AGGTGGGAAGCACACCTCAGGACCAAAGAATTGTTGGGTACATCGCCTGCACACACCTGCATGCCCCACCAGAG  1395

Query 1402  GACAGCGCCATCCGGTGTGGGCAGCTGGACCTGCTTCAGGACTGGCTGGCTGATTTCCGAAAATCTACCTCCTC  1475
            |||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  GACAGTGCCGTCCGGTGTGAGCAGCTGGACCTGCTTCAGGACTGGCTGGCTGATTTCCGAAAATCTACCTCCTC  1469

Query 1476  GTCCAGCGCAGCCAACCCCGAGGAGCTGGTGGCATTTGACGTCGTCTGTGGAGATTTCAACTTTGATAACTGCT  1549
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1470  GACCAGCACAGCCAACCCCGAGGAGCTGGTGGTGTTTGACGTCATCTGTGGAGATTTGAACTTTGATAACTGCT  1543

Query 1550  CCTCTGACGACAAGCTGGAGCAGCAACACTCCCTGTTCACCCACTACAGGGACCCCTGCCGCCTGGGGCCTGGT  1623
            |.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||||..||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1544  CTTCTGATGACAAACTGGAGCAGCAGCACTCGCTCTTTACTCGCTACAAAGACCCCTGCCGCCTTGGGCCCGGG  1617

Query 1624  GAGGAGAAGCCGTGGGCCATCGGTACTCTGCTGGACACGAACGGCCTGTACGATGAGGATGTGTGCACCCCCGA  1697
            |||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1618  GAGGAGAAGCCTTGGGCCATTGGCACCCTGCTGGACACAAACGGTCTCTATGATGAGGATGTGTGTACCCCGGA  1691

Query 1698  CAACCTGCAGAAGGTCCTGGAGAGTGAGGAGGGCCGCAGGGAGTACCTGGCGTTTCCCACCAGCAAGAGCTC--  1769
            ||||||.||.|||||..|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|  
Sbjct 1692  CAACCTTCAAAAGGTGTTGGAGAGCGAGGAAGGCCGCAGGGAGTATCTGGCCTTCCCCACCAGCAAGAGCCCAG  1765

Query 1770  -----GGGCCAGAAGGGGCGGAAGGAGCTGCTGAAGGGCAACGGCCGGCGCATCGACTACATGCTGCATGCAGA  1838
                 ||| ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1766  GTGCTGGG-CAGAAGGGCCGGAAGGATCTGCTGAAGGGCAATGGCCGCCGCATCGACTACATGCTGCACGCCGA  1838

Query 1839  GGAGGGGCTGTGCCCAGACTGGAAGGCCGAGGTGGAAGAATTCAGTTTTATCACCCAGCTGTCCGGCCTGACGG  1912
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1839  GGAGGGGCTGTGCCCTGACTGGAAGGCTGAGGTAGAAGAATTCAGTTTTATCACCCAGCTGTCCGGCCTGACCG  1912

Query 1913  ACCACCTGCCAGTAGCCATGCGACTGATGGTGTCTTCGGGGGAGGAGGAGGCA  1965
            |||||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 1913  ACCACCTCCCCGTGGCCATGCGGCTGATGGTGTCTGCAGGGGAAGAGGAGGCA  1965