Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03644
- Subject:
- NM_001177707.1
- Aligned Length:
- 1281
- Identities:
- 995
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ATGGCCAGCCCAAGAACCAGGAAGGTTCTTAAAGAAGTCAGGGTGCAGGATGAGAACAACGTTTGTTTTGAGTG 74
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||..|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAGCCCAAGAACCAGGAAAGTTCTTAAGGAAGTCCGGGCACAGGATGAGAATAATGTTTGCTTTGAGTG 74
Query 75 TGGCGCGTTCAATCCTCAGTGGGTCAGTGTGACCTACGGCATCTGGATCTGCCTGGAGTGCTCGGGGAGACACC 148
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TGGTGCGTTCAATCCTCAGTGGGTCAGCGTGACTTATGGCATCTGGATCTGCCTGGAATGCTCTGGGAGACACC 148
Query 149 GCGGGCTTGGGGTTCACCTCAGCTTTGTGCGCTCTGTTACTATGGACAAGTGGAAGGACATTGAGCTTGAGAAG 222
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 GTGGGCTTGGGGTGCACCTCAGCTTTGTGCGCTCTGTTACAATGGACAAATGGAAGGACATTGAGCTGGAGAAG 222
Query 223 ATGAAAGCTGGTGGGAATGCTAAGTTCCGAGAGTTCCTGGAGTCTCAGGAGGATTACGATCCTTGCTGGTCCTT 296
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.|||.|||||||..|
Sbjct 223 ATGAAGGCTGGTGGGAATGCTAAGTTCCGAGAGTTCCTGGAGACACAGGACGACTATGAGCCTAGCTGGTCACT 296
Query 297 GCAGGAGAAGTACAACAGCAGAGCCGCGGCCCTCTTTAGGGATAAGGTGGTCGCTCTGGCCGAAGGCAGAGAGT 370
||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||...||.||||.|||||.|.|||||
Sbjct 297 GCAGGACAAGTACAGCAGCAGAGCCGCGGCGCTCTTCAGGGATAAGGTGGCTACTTTGGCAGAAGGTAAAGAGT 370
Query 371 GGTCTCTGGAGTCATCACCTGCCCAGAACTGGACCCCACCTCAGCCCAGGACGCTGCCGTCCATGGTGCACCGA 444
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||.||..|..||||||
Sbjct 371 GGTCTCTGGAGTCATCGCCTGCACAGAACTGGACCCCACCTCAGCCCAAGACACTGCAGTTCACTGCCCACCGA 444
Query 445 GTCTCTGGCCAGCCGCAGAGTGTGACCGCCTCCTCGGACAAGGCTTTTGAAGACTGGCTGAATGATGACCTCGG 518
|.||||||||||||.|||||||...|||||||...||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GCCTCTGGCCAGCCACAGAGTGCAGCCGCCTCTGGGGACAAGGCTTTTGAAGATTGGCTGAATGATGACCTGGG 518
Query 519 CTCCTATCAAGGGGCCCAGGGGAATCGCTACGTGGGGTTTGGGAACAC---GCCACCGCCTCAGAAGAAAGAAG 589
.|||||.||.||.||.||||.|||||||||.||.|||||||||||||| |||| ||||||||||.|||||
Sbjct 519 TTCCTACCAGGGTGCTCAGGAGAATCGCTATGTAGGGTTTGGGAACACAGTGCCA---CCTCAGAAGAGAGAAG 589
Query 590 ATGACTTCCTCAACAACGCCATGTCCTCCCTGTACTCGGGCTGGAGCAGCTTCACCACTGGAGCCAGCCGGTTT 663
||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||..||||
Sbjct 590 ATGACTTCCTCAACAATGCCATGTCATCGCTGTACTCGGGCTGGAGCAGTTTTACCACTGGGGCGAGCAAGTTT 663
Query 664 GCCTCGGCAGCCAAGGAGGGCGCTACAAAGTTTGGATCCCAAGCGAGTCAGAAGTTTTGGGGTCACAAGCAGCA 737
||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 664 GCATCTGCAGCAAAGGAGGGTGCTACAAAATTTGGATCTCAAGCAAGTCAGAA--------------------- 716
Query 738 GCCGGAGCCGGCGTCCGAGCTGGGCCACAGCCTGAACGAGAACGTCCTCAAGCCTGCGCAGGAGAAGGTGAAGG 811
|||.||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 717 ---------GGCTTCGGAGTTGGGCCACAGCCTGAATGAGAATGTTCTCAAGCCTGCACAGGAGAAGGT----- 776
Query 812 AGGGAAAGATTTTTGATGATGTCTCCAGTGGGGTCTCTCAGTTGGCGTCCAAGGGAGTCGGTAGTAAGGGATGG 885
|.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct 777 -------------------------------------------------CCAGGGAGTTGGCAGTAAGGGATGG 801
Query 886 CGGGACGTCACCACCTTTTTTTCGGGGAAAGCAGAGGGCCCCTTGGACAGCCCCTCGGAGGGCCACAGTTATCA 959
||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.|.|.|.|..|||||.||||..|||||||||||.||.||
Sbjct 802 CGTGATGTCACTACTTTCTTCTCTGGGAAAGCCGAAGACTCTTCAGACAGACCCTTAGAGGGCCACAGCTACCA 875
Query 960 GAACAGCGGTCTGGACCACTTCCAAAACAGCAACATAGACCAGAGCTTCTGGGAGACCTTTGGAAGTGCTGAGC 1033
|||||||.||...|||.|||..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 876 GAACAGCAGTGGAGACAACTCTCAGAACAGCAACATAGACCAGAGCTTCTGGGAGACCTTTGGGAGTGCTGAGC 949
Query 1034 CCACCAAGACCCGCAAGTCCCCGAGCAGCGACAGCTGGACGTGCGCGGACACCTCCACCGAGAGGAGGAGCTCG 1107
||.|||||.| |||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||..|.||.||.|.|||||||||||||
Sbjct 950 CCCCCAAGGC---CAAGTCCCCAAGCAGTGACAGCTGGACCTGTGCAGATGCTTCAACAGGGAGGAGGAGCTCG 1020
Query 1108 GACAGCTGGGAGGTGTGGGGC------TCGGCCTCCACCAACAGGAACAGCAACAGCGACGGC----------- 1164
|||||||||||.||.|||||| ||.||.||||.|||||.|||||||||.|||||.|||
Sbjct 1021 GACAGCTGGGACGTTTGGGGCTCAGGTTCCGCATCCAACAACAAGAACAGCAATAGCGATGGCTGGGAGAGTTG 1094
Query 1165 -------------GGGGAGGGCGGGG---AGGGCACCAAGAAGGCAGTGCCGCCGGCCGTGCCCA---CTGATG 1219
|||||||||.||| |||.||||||||||||| ||| ||.| ||| ||||||
Sbjct 1095 GGAGGGAGCCAGTGGGGAGGGCAGGGCAAAGGCCACCAAGAAGGCA--GCC-----CCAT--CCACGGCTGATG 1159
Query 1220 ATGGCTGGGACAACCAGAACTGG 1242
|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 AGGGCTGGGACAACCAGAACTGG 1182