Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03660
• Subject: XM_011523241.1
• Aligned Length: 2070
• Identities: 1566
• Gaps: 504

Alignment

Query    1  ATGGGTGGGCACCTGTCCCCATGGCCCACATACACCAGTGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCTGTTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGACTACCGGAAGCGAGTAGGGAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTACTTGGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGCTGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAACTAAGGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGACTTCAAAACGTACAAGCCATTACTATCCTCCATCAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGGCTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTC  444
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------ATGAGAGCTGAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTC  36

Query  445  AAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   37  AAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGAGGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGT  110

Query  519  GACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  111  GACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCAGTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCA  184

Query  593  TCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  TCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTAGCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAG  258

Query  667  GACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  GACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCTGACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAA  332

Query  741  CATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  CATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAATGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTC  406

Query  815  AGGAG---------------------CAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCAT  867
            |||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  AGGAGCAGGGCCAATGTCCTTGCCCACAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAGGAGCAT  480

Query  868  GAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  GAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGAGATCCA  554

Query  942  GCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA-----------------------------------  980
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  555  GCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGGTGAGGGCAGCCGGCAGGGCCCCAGGTCCTGCT  628

Query  981  ----------------------------------------AGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAG  1014
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  TACATGTGGGCCCAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAGATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAG  702

Query 1015  ATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCG  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  ATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTGCTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCG  776

Query 1089  GGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGG  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  GGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCATCCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGG  850

Query 1163  AGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAG  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  AGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCAAGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAG  924

Query 1237  CAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTG  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  CAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAGCATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTG  998

Query 1311  GGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGA  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  GGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAACGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGA  1072

Query 1385  TGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAAT  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  TGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGACAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAAT  1146

Query 1459  GCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAA  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147  GCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTCAACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAA  1220

Query 1533  GACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCA  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221  GACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTGGCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCA  1294

Query 1607  ACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATAC  1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295  ACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTGAGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATAC  1368

Query 1681  ATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCT  1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369  ATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAGCTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCT  1442

Query 1755  GCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCC  1828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443  GCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCTGGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCC  1516

Query 1829  AGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTC  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517  AGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTGACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTC  1590

Query 1903  CAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591  CAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGTGTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1662