Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03686
- Subject:
- NM_001252579.1
- Aligned Length:
- 909
- Identities:
- 821
- Gaps:
- 40
Alignment
Query 1 ---------------------------------MGPPSLVLCLLSATVFSLLGGSSAFLSHHRLKGRFQRDRRN 41
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Sbjct 1 MANPEGRGEGIPSSRHHLGLCIQEEAKDQQATPMAPPGLPLWLLSTALLSLLAGSSAFLSHPRLKGRFQRDRRN 74
Query 42 IRPNIILVLTDDQDVELGSMQVMNKTRRIMEQGGAHFINAFVTTPMCCPSRSSILTGKYVHNHNTYTNNENCSS 115
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Sbjct 75 IRPNIILVLTDDQDVELGSMQVMNKTRRIMEQGGAHFINAFVTTPMCCPSRSSILTGKYVHNHNTYTNNENCSS 148
Query 116 PSWQAQHESRTFAVYLNSTGYRTAFFGKYLNEYNGSYVPPGWKEWVGLLKNSRFYNYTLCRNGVKEKHGSDYSK 189
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Sbjct 149 PSWQAQHESRTFAVYLNSTGYRTAFFGKYLNEYNGSYVPPGWKEWVGLLKNSRFYNYTLCRNGVKEKHGSDYST 222
Query 190 DYLTDLITNDSVSFFRTSKKMYPHRPVLMVISHAAPHGPEDSAPQYSRLFPNASQHITPSYNYAPNPDKHWIMR 263
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Sbjct 223 DYLTDLITNDSVSFFRTSKKMYPHRPVLMVISHAAPHGPEDSAPQYSRLFPNASQHITPSYNYAPNPDKHWIMR 296
Query 264 YTGPMKPIHMEFTNMLQRKRLQTLMSVDDSMETIYNMLVETGELDNTYIVYTADHGYHIGQFGLVKGKSMPYEF 337
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Sbjct 297 YTGPMKPIHMEFTNMLQRKRLQTLMSVDDSMETIYDMLVETGELDNTYILYTADHGYHIGQFGLVKGKSMPYEF 370
Query 338 DIRVPFYVRGPNVEAGCLNPHIVLNIDLAPTILDIAGLDIPADMDGKSILKLLDTERPVNRFHLKKKMRVWRDS 411
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Sbjct 371 DIRVPFYVRGPNVEAGSLNPHIVLNIDLAPTILDIAGLDIPADMDGKSILKLLDSERPVNRFHLKKKLRVWRDS 444
Query 412 FLVERGKLLHKRDNDKVDAQEENFLPKYQRVKDLCQRAEYQTACEQLGQKWQCVEDATGKLKLHKCKGPMRL-- 483
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Sbjct 445 FLVERGKLLHKREGDKVNAQEENFLPKYQRVKDLCQRAEYQTACEQLGQKWQCVEDASGTLKLHKCKGPMRFGG 518
Query 484 -GGSRALSNLVPKYYGQGSEACTCDS---GDYKLSLAGRRKKLFKKKYKASYVRSRSIRSVAIEVDGRVYHVGL 553
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Sbjct 519 GGGSRALSNLVPKYDGQSSEACSCDSGGGGDYKLGLAGRR-KLFKKKYKTSYARNRSIRSVAIEVDGEIYHVGL 591
Query 554 GDAAQPRNLTKRHWPGAPEDQDDKDGGDFSGTGGLPDYSAANPIKVTHRCYILENDTVQCDLDLYKSLQAWKDH 627
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Sbjct 592 DTVPQPRNLSKPHWPGAPEDQDDKDGGSFSGTGGLPDYSAPNPIKVTHRCYILENDTVQCDLDLYKSLQAWKDH 665
Query 628 KLHIDHEIETLQNKIKNLREVRGHLKKKRPEECDCHKISYHTQHKGRLKHRGSSLHPFRKGLQEKDKVWLLREQ 701
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Sbjct 666 KLHIDHEIETLQNKIKNLREVRGHLKKKRPEECDCHRISYHSQHKGRLKHKGSSLHPFRKGLQEKDKVWLLREQ 739
Query 702 KRKKKLRKLLKRLQNNDTCSMPGLTCFTHDNQHWQTAPFWTLGPFCACTSANNNTYWCMRTINETHNFLFCEFA 775
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Sbjct 740 KRKKKLRKLLKRLQNNDTCSMPGLTCFTHDNHHWQTAPLWTLGPFCACTSANNNTYWCLRTINETHNFLFCEFA 813
Query 776 TGFLEYFDLNTDPYQLMNAVNTLDRDVLNQLHVQLMELRSCKGYKQCNPRTRNMDLGLKDGGSYEQYRQFQRRK 849
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Sbjct 814 TGFIEYFDLSTDPYQLMNAVNTLDRDVLNQLHVQLMELRSCKGYKQCNPRTRNMDLGLRDGGSYEQYRQFQRRK 887
Query 850 WPEMKRPSSKSLGQLWEGWEG 870
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Sbjct 888 WPEMKRPSSKSLGQLWEGWEG 908