Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03687
• Subject: NM_001206736.1
• Aligned Length: 1116
• Identities: 1110
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGAGCGACAGGAGGCGCTGAGGGAGTTCGTGGCGGTGACGGGCGCCGAGGAGGACCGGGCCCGCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGAGCGACAGGAGGCGCTGAGGGAGTTCGTGGCGGTGACGGGCGCCGAGGAGGACCGGGCCCGCTT  74

Query   75  CTTTCTCGAGTCGGCCGGCTGGGACTTGCAGATCGCGCTAGCGAGCTTTTATGAGGACGGAGGGGATGAAGACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTTCTCGAGTCGGCCGGCTGGGACTTGCAGATCGCGCTAGCGAGCTTTTATGAGGACGGAGGGGATGAAGACA  148

Query  149  TTGTGACCATTTCGCAGGCAACCCCCAGTTCAGTGTCCAGAGGCACAGCCCCCAGTGATAATAGAGTGACATCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGTGACCATTTCGCAGGCAACCCCCAGTTCAGTGTCCAGAGGCACAGCCCCCAGTGATAATAGAGTGACATCC  222

Query  223  TTCAGAGACCTCATTCATGACCAAGATGAAGATGAGGAGGAAGAGGAAGGCCAG------AGGTTTTATGCTGG  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAGAGACCTCATTCATGACCAAGATGAAGATGAGGAGGAAGAGGAAGGCCAGAGGAGCAGGTTTTATGCTGG  296

Query  291  GGGCTCAGAGAGAAGTGGACAGCAGATTGTTGGCCCTCCCAGGAAGAAAAGTCCCAACGAGCTGGTGGATGATC  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCTCAGAGAGAAGTGGACAGCAGATTGTTGGCCCTCCCAGGAAGAAAAGTCCCAACGAGCTGGTGGATGATC  370

Query  365  TCTTTAAAGGTGCCAAAGAGCATGGAGCTGTAGCTGTGGAGCGAGTGACCAAGAGCCCTGGAGAGACCAGTAAA  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTTTAAAGGTGCCAAAGAGCATGGAGCTGTAGCTGTGGAGCGAGTGACCAAGAGCCCTGGAGAGACCAGTAAA  444

Query  439  CCGAGACCATTTGCAGGAGGTGGCTACCGCCTTGGGGCAGCACCAGAGGAAGAGTCTGCCTATGTGGCAGGAGA  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGAGACCATTTGCAGGAGGTGGCTACCGCCTTGGGGCAGCACCAGAGGAAGAGTCTGCCTATGTGGCAGGAGA  518

Query  513  AAAGAGGCAGCATTCCAGCCAAGATGTTCATGTAGTATTGAAACTCTGGAAGAGTGGATTCAGCCTGGATAATG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAGAGGCAGCATTCCAGCCAAGATGTTCATGTAGTATTGAAACTCTGGAAGAGTGGATTCAGCCTGGATAATG  592

Query  587  GAGAACTCAGAAGCTACCAAGACCCATCCAATGCCCAGTTTCTGGAGTCTATCCGCAGAGGGGAGGTGCCAGCA  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGAACTCAGAAGCTACCAAGACCCATCCAATGCCCAGTTTCTGGAGTCTATCCGCAGAGGGGAGGTGCCAGCA  666

Query  661  GAGCTTCGGAGGCTAGCTCACGGTGGACAGGTGAACTTGGATATGGAGGACCATCGGGACGAGGACTTTGTGAA  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTTCGGAGGCTAGCTCACGGTGGACAGGTGAACTTGGATATGGAGGACCATCGGGACGAGGACTTTGTGAA  740

Query  735  GCCCAAAGGAGCCTTCAAAGCCTTCACTGGCGAGGGTCAGAAACTGGGCAGCACTGCCCCCCAGGTGTTGAGTA  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCAAAGGAGCCTTCAAAGCCTTCACTGGCGAGGGTCAGAAACTGGGCAGCACTGCCCCCCAGGTGTTGAGTA  814

Query  809  CCAGCTCTCCAGCCCAACAGGCAGAAAATGAAGCCAAAGCCAGCTCTTCCATCTTAATCGACGAATCAGAGCCT  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGCTCTCCAGCCCAACAGGCAGAAAATGAAGCCAAAGCCAGCTCTTCCATCTTAATCGACGAATCAGAGCCT  888

Query  883  ACCACAAACATCCAAATTCGGCTTGCAGACGGCGGGAGGCTGGTGCAGAAATTTAACCACAGCCACAGGATCAG  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCACAAACATCCAAATTCGGCTTGCAGACGGCGGGAGGCTGGTGCAGAAATTTAACCACAGCCACAGGATCAG  962

Query  957  CGACATCCGACTCTTCATCGTGGATGCCCGGCCAGCCATGGCTGCCACCAGCTTTATCCTCATGACTACTTTCC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGACATCCGACTCTTCATCGTGGATGCCCGGCCAGCCATGGCTGCCACCAGCTTTATCCTCATGACTACTTTCC  1036

Query 1031  CGAACAAAGAGCTGGCTGATGAGAGCCAGACCCTGAAGGAAGCCAACCTGCTCAATGCTGTCATCGTGCAGCGG  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGAACAAAGAGCTGGCTGATGAGAGCCAGACCCTGAAGGAAGCCAACCTGCTCAATGCTGTCATCGTGCAGCGG  1110

Query 1105  TTAACA  1110
            ||||||
Sbjct 1111  TTAACA  1116