Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03795
• Subject: XM_006516252.3
• Aligned Length: 1576
• Identities: 1002
• Gaps: 386

Alignment

Query    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC  444
                    |||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct    1  --------ATGCAAGAGGTCCGGCAGGTCATCCGAGAAGACCTGGGCAAGGAGATCCACGATTTGTTCCTGAGC  66

Query  445  TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT  518
            |||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||
Sbjct   67  TTCGATGACACCCCTCTTGGGGCAGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCGGTGTTGCATGATGGTCGGACAGT  140

Query  519  GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC  592
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  141  GGCAGTTAAGGTCCAGCACCCGAAGGTTCAGGCTCAAAGCTCTAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTTGTCC  214

Query  593  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  666
            ||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct  215  TGGCCGTGAAGCAACTTTTCCCAGATTTTGAATTCATGTGGCTGGTGGATGAAGCGAAGAAGAACCTGCCTCTC  288

Query  667  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  740
            |||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||.|.||
Sbjct  289  GAGTTGGACTTCCTGAATGAAGGGAGGAACGCTGAGAAAGTGGCCCACATGCTCAGGCACTTTGACTTCCTAAA  362

Query  741  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  814
            |||.||||..|||||||||||.|||||.||..||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||
Sbjct  363  GGTTCCCCAGATCCACTGGGAGCTGTCTACCAAGAGGGTGCTCCTGATGGAATTTGTAGAGGGAGGTCAAGTCA  436

Query  815  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGT  888
            |.|||||.|.|||||||||||.||||.|||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct  437  ACGACAGGGCCTACATGGAGAAGAACCAGATCGATGTGAATGAGATCTCCTGCCACCTGGGCAAGATGTACAGT  510

Query  889  GAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGGTGCGGAAGCACCCCGG  962
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||..||.|.
Sbjct  511  GAGATGATCTTTGTCAATGGCTTCGTGCACTGTGACCCCCACCCAGGCAACGTACTGGTACGGAAGCGTCCTGA  584

Query  963  CACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATT  1036
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct  585  CACGGGCAAGGCTGAGATTGTCCTCTTAGACCATGGGCTTTACCAGGTGCTCACGGAGGAGTTCCGCCTGGACT  658

Query 1037  ACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGGAGTACAGCCAGCGACTGGGAGCC  1110
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..|..||||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct  659  ACTGCCATCTGTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGGACGGGCTGAAACAGTACAGCCAGCGCCTGGGAGCT  732

Query 1111  GGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTC-AACAGAGGCATCAGCC  1183
            |..||.||||||||..||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||| ||||| |||||..|.|
Sbjct  733  GCAGACCTCTACCCACTGTTTGCCTGTATGCTGACAGCCCGGTCCTGGGACTCAGTCAAACAG-GGCATTGGGC  805

Query 1184  AAGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCAT  1257
            |||||||.|||.||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||..||||||.||..||||||||||.
Sbjct  806  AAGCTCCAGTCTCTGCTACTGAGGACTCAGAGATTCGCAATAATGCAGCCTGCTACCTGCCTGAGATCAGCCAG  879

Query 1258  CTCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGCCGC  1331
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||.|||.||||||||.||.|
Sbjct  880  CTCCTTAACCATGTGCCTCGCCAGATGCTGCTCATCCTGAAGACTAATGATCTACTCCGTAGCATTGAGACCAC  953

Query 1332  CCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGCACA  1405
            |||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  954  CCTGGGCACGCGCTCCAGTGCCAGTTCCTTCCTCAACATGTCTCGGTGTTGTATCAGGGCGCTGGCTGAACACA  1027

Query 1406  AGAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTTATGGCAGATC  1479
            ||||||.|.||.||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.|.|.|||||||||
Sbjct 1028  AGAAGAGGGATGCCGGCTCTTTCTTCAGAAGGACTCAGATATCTTTCAGTGAGGCCTTTAGCCTGTGGCAGATC  1101

Query 1480  AACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCT  1553
            |||||.|||||.||..|.||.||.||||.||..||||.|||.|||..|.||||||..||.||..|..|||||||
Sbjct 1102  AACCTTCATGAACTTCTGCTTCGAGTGAGGGCCTTGAGGCTAGCTTGCTGGGTCTCAGCTCTCCTGGGCTGGCT  1175

Query 1554  GTTCCCTGCTCCACTC------  1569
            |...|..|||||||.|      
Sbjct 1176  GACTCGGGCTCCACACAGAATG  1197