Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03798
• Subject: NM_001127357.2
• Aligned Length: 2253
• Identities: 2253
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA  74

Query   75  AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG  148

Query  149  TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG  222

Query  223  ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC  296

Query  297  ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA  370

Query  371  CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG  444

Query  445  CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG  518

Query  519  AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG  592

Query  593  TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT  666

Query  667  TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA  740

Query  741  TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG  814

Query  815  AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC  888

Query  889  TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA  962

Query  963  AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTA  1036

Query 1037  CTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGAT  1110

Query 1111  GTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCA  1184

Query 1185  TCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATA  1258

Query 1259  GTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCT  1332

Query 1333  GTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTTGG  1406

Query 1407  AAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACAAC  1480

Query 1481  TCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTATG  1554

Query 1555  GTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGAAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGAAC  1628

Query 1629  TTATAAACAGCGATTACTTTTTGCAAAACTCTTTGGACATTTAACATCTGCAAGGAGGGCTCGAAAATCTGAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTATAAACAGCGATTACTTTTTGCAAAACTCTTTGGACATTTAACATCTGCAAGGAGGGCTCGAAAATCTGAGG  1702

Query 1703  TTCCTCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTATCTCTCCGTTCCTATCTTAAGCGTCGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTCCTCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTATCTCTCCGTTCCTATCTTAAGCGTCGA  1776

Query 1777  GGTCCTCAGCGATCAGTTGATGTAATAGTTTCATCTGCTTTCTTATTGACTATCTCAGTTGTATTTATCTGTTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGTCCTCAGCGATCAGTTGATGTAATAGTTTCATCTGCTTTCTTATTGACTATCTCAGTTGTATTTATCTGTTG  1850

Query 1851  TGCCCAGCTACTTCATGTACACGAGATCTTCCTTGATTGTCACTACAATTGGGAATTGGTAATCTGGTGCATCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGCCCAGCTACTTCATGTACACGAGATCTTCCTTGATTGTCACTACAATTGGGAATTGGTAATCTGGTGCATCT  1924

Query 1925  CGTTAACACTTTTTCTCCTAAGATTTGTTACCCTTGGATCAGAAACAAGTAAAAAATATAGTAATACCTCAATA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGTTAACACTTTTTCTCCTAAGATTTGTTACCCTTGGATCAGAAACAAGTAAAAAATATAGTAATACCTCAATA  1998

Query 1999  TTACTTACTGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAAAAACCTAACAAAAAGGAGGAACTGACACTAGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTACTTACTGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAAAAACCTAACAAAAAGGAGGAACTGACACTAGT  2072

Query 2073  GAATAATGTTTTAAAACTGGCTACTAAACTGCTAAAGGAGTTGGACAGTCCTTTTAGATTATATGGGCTTACAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAATAATGTTTTAAAACTGGCTACTAAACTGCTAAAGGAGTTGGACAGTCCTTTTAGATTATATGGGCTTACAA  2146

Query 2147  TGAATCCGCTGCTTTATAACATCACCCAGGTTGTTATCCTGTCAGCTGTTTCTGGTGTTATCAGTGACTTGCTT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAATCCGCTGCTTTATAACATCACCCAGGTTGTTATCCTGTCAGCTGTTTCTGGTGTTATCAGTGACTTGCTT  2220

Query 2221  GGATTTAATTTAAAGCTATGGAAGATTAAGTCA  2253
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGATTTAATTTAAAGCTATGGAAGATTAAGTCA  2253