Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03798
- Subject:
- NM_001366082.2
- Aligned Length:
- 2258
- Identities:
- 1632
- Gaps:
- 625
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA 74
Query 75 AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG 148
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAA------------GGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATG 136
Query 149 TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 TGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGG 210
Query 223 ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 ACTTCTCTGACCAGAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAAC 284
Query 297 ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 ATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCA 358
Query 371 CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 CTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTG 432
Query 445 CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 CATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAG 506
Query 519 AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 AAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAG 580
Query 593 TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 TTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTT 654
Query 667 TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 TTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGA 728
Query 741 TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 TGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAG 802
Query 815 AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 AAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTC 876
Query 889 TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 TCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGA 950
Query 963 AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 AGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGGTA 1024
Query 1037 CTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAGAT 1098
Query 1111 GTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAATCA 1172
Query 1185 TCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 TCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCATA 1246
Query 1259 GTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 GTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGTCT 1320
Query 1333 GTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 GTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTTGG 1394
Query 1407 AAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 AAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACAAC 1468
Query 1481 TCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTATG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 TCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTATG 1542
Query 1555 GTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGAAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 GTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGAAC 1616
Query 1629 TTATAAACAGCG-----ATTACTTTTTGCAAAACTCTTTGGACATTTAACATCTGCAAGGAGGGCTCGAAAATC 1697
|||||||||| | ||.| ||
Sbjct 1617 TTATAAACAG-GTGGGTATAA-----TG---------------------------------------------- 1638
Query 1698 TGAGGTTCCTCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTATCTCTCCGTTCCTATCTTAAGC 1771
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 1772 GTCGAGGTCCTCAGCGATCAGTTGATGTAATAGTTTCATCTGCTTTCTTATTGACTATCTCAGTTGTATTTATC 1845
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 1846 TGTTGTGCCCAGCTACTTCATGTACACGAGATCTTCCTTGATTGTCACTACAATTGGGAATTGGTAATCTGGTG 1919
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 1920 CATCTCGTTAACACTTTTTCTCCTAAGATTTGTTACCCTTGGATCAGAAACAAGTAAAAAATATAGTAATACCT 1993
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 1994 CAATATTACTTACTGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAAAAACCTAACAAAAAGGAGGAACTGACA 2067
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 2068 CTAGTGAATAATGTTTTAAAACTGGCTACTAAACTGCTAAAGGAGTTGGACAGTCCTTTTAGATTATATGGGCT 2141
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 2142 TACAATGAATCCGCTGCTTTATAACATCACCCAGGTTGTTATCCTGTCAGCTGTTTCTGGTGTTATCAGTGACT 2215
Sbjct 1639 -------------------------------------------------------------------------- 1638
Query 2216 TGCTTGGATTTAATTTAAAGCTATGGAAGATTAAGTCA 2253
Sbjct 1639 -------------------------------------- 1638