Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03803
• Subject: XM_006716065.2
• Aligned Length: 1274
• Identities: 1062
• Gaps: 184

Alignment

Query    1  ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC  74

Query   75  TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA  148

Query  149  GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA  222

Query  223  AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA  296

Query  297  ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG  370

Query  371  AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC  444

Query  445  TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG  518

Query  519  AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA  592

Query  593  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG  666

Query  667  ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT  740

Query  741  GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG  814

Query  815  GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC  888

Query  889  TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATGTCGTACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |.||.
Sbjct  889  TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGA-----GAACC  957

Query  963  CT----------CAGGAGGCTCCACCA--TGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAG  1024
            ||          |.|...||.||||||  ||.||     |.||||  |||     |||                
Sbjct  958  CTGACTGGCACACTGCCCGCACCACCAACTGCTC-----TCTCGG--GCC-----CAG----------------  1003

Query 1025  TGGTG--GATGCTAGGCTG-AGGCTCAGCGAGGAGCTCAGCGGCGGGAGGATCAAGCCGAAGC-CTGTGGAGGT  1094
             ||||  ||||   ||.|| ||.|          |||                  |||||.|| ||      .|
Sbjct 1004  -GGTGGCGATG---GGTTGTAGCC----------GCT------------------GCCGATGCTCT------TT  1039

Query 1095  CCAGGTGGTCACGCATCACATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGT  1168
            ||...||||   ||  ||.|||||||              |||.|                             
Sbjct 1040  CCTTCTGGT---GC--CAGATGCAGC--------------TTCAG-----------------------------  1065

Query 1169  TCTTTCAGGTCTGCCACACCAA----GAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGT  1238
              |.|||  ||||      |||    |..||||..|||.||.|  ||...||||| ||                
Sbjct 1066  --TATCA--TCTG------CAAGTTGGGGGGACCGTGATGATT--GGAGTCAGCA-CT----------------  1110

Query 1239  CTTTGGAGTCATGTCC  1254
                            
Sbjct 1111  ----------------  1110