Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03823
• Subject: NM_001204890.1
• Aligned Length: 993
• Identities: 854
• Gaps: 138

Alignment

Query   1  ATGGCCCGAAATGCAGAAAAGGCCATGACGGCCTTAGCAAGATTTCGCCAGGCTCAGCTGGAAGAGGGAAAAGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCCGAAATGCAGAAAAGGCCATGACGGCCTTAGCAAGATTTCGCCAGGCTCAGCTGGAAGAGGGAAAAGT  74

Query  75  GAAGGAACGAAGACCCTTTCTGGCCTCAGAATGTACTGAACTGCCTAAAGCTGAGAAGTGGAGACGACAGATCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAAGGAACGAAGACCCTTTCTGGCCTCAGAATGTACTGAACTGCCTAAAGCTGAGAAGTGGAGACGACAGATCA  148

Query 149  TTGGAGAGATCTCTAAAAAAGTGGCTCAGATTCAGAATGCTGGTTTAGGTGAATTTCGAATTCGTGACCTGAAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTGGAGAGATCTCTAAAAAAGTGGCTCAGATTCAGAATGCTGGTTTAGGTGAATTTCGAATTCGTGACCTGAAT  222

Query 223  GATGAAATTAACAAGCTGCTAAGGGAGAAAGGACACTGGGAGGTCCGGATAAAGGAGCTGGGAGGTCCTGATTA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GATGAAATTAACAAGCTGCTAAGGGAGAAAGGACACTGGGAGGTCCGGATAAAGGAGCTGGGAGGTCCTGATTA  296

Query 297  TGGAAAAGTTGGCCCTAAAATGCTGGATCATGAAGGAAAAGAAGTCCCAGGAAACCGAGGTTACAAGTACTTTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGGAAAAGTTGGCCCTAAAATGCTGGATCATGAAGGAAAAGAAGTCCCAGGAAACCGAGGTTACAAGTACTTTG  370

Query 371  GAGCAGCAAAAGATTTGCCTGGTGTTAGAGAGCTGTTTGAAAAAGAACCTCTTCCTCCTCCCAGAAAGACACGT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GAGCAGCAAAAGATTTGCCTGGTGTTAGAGAGCTGTTTGAAAAAGAACCTCTTCCTCCTCCCAGAAAGACACGT  444

Query 445  GCTGAGCTCATGAAGGCAATCGATTTTGAGTACTATGGTTACCTAGATGAAGATGATGGTGTTATTGTGCCTTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCTGAGCTCATGAAGGCAATCGATTTTGAGTACTATGGTTACCTAGATGAAGATGATGGTGTTATTGTGCCTTT  518

Query 519  GGAACAGGAATATGAAAAGAAACTCAGAGCCGAGTTAGTGGAAAAGTGGAAAGCAGAGAGAGAGGCTCGGCTGG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GGAACAGGAATATGAAAAGAAACTCAGAGCCGAGTTAGTGGAAAAGTGGAAAGCAGAGAGAGAGGCTCGGCTGG  592

Query 593  CAAGAGGAGAAAAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGATCAACATCTATGCAGTCACCGAGGAGGAGTCG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CAAGAGGAGAAAAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGATCAACATCTATGCAGTCACCGAGGAGGAGTCG  666

Query 667  GACGAGGAAGGCAGCCAGGAGAAAGGAGGGGACGACAGCCAGCAGAAGTTCATTGCTCACGTCCCTGTTCCCTC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GACGAGGAAGGCAGCCAGGAGAAAGGAGGGGACGACAGCCAGCAGAAGTTCATTGCTCACGTCCCTGTTCCCTC  740

Query 741  GCAGCAAGAGATTGAGGAGGCACTGGTGCGAAGGAAGAAAATGGAACTCCTCCAGAAGTATGCAAGCGAGACCC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GCAGCAAGAGATTGAGGAGGCACTGGTGCGAAGGAAGAAAATGGAACTCCTCCAGAAGTATGCAAGCGAGACCC  814

Query 815  TGCAGGCCCAAAGTGAAGAAGCCAGAAGGCTCCTGGGGT----AT-----------------------------  855
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|    ||                             
Sbjct 815  TGCAGGCCCAAAGTGAAGAAGCCAGAAGGCTCCTGGGCTGCAGATCTGGGACACGGCCGGCCAGGAGCGGTTCC  888

Query 856  --------------------------------------------------------------------------  855
                                                                                     
Sbjct 889  GCACCATCACCCAGAGCTACTACCGCAGTGCCAATGGGGCCATCCTTGCCTACGACATCACCAAGAGGAGCTCC  962

Query 856  -------------------------------  855
                                          
Sbjct 963  TTCCTGTCGGTGCCTCACTGGATTGAGGATG  993