Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03868
• Subject: XM_006516168.3
• Aligned Length: 2529
• Identities: 2327
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGTCTTTTCCACCTCATTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCACTCCCACCAGGGATCCCACCCCCGCA  74
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGTCTTTCCCCCCTCATTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCTCTCCCTCCAGGGATCCCACCCCCACA  74

Query   75  GTTTCCAGGATTTCCTCCACCTGTACCTCCAGGGACCCCAATGATTCCTGTACCAATGAGCATTATGGCTCCTG  148
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GTTTCCTGGCTTTCCTCCACCAGTACCTCCAGGGACACCGATGATTCCTGTACCAATGAGTATTATGGCTCCTG  148

Query  149  CTCCAACTGTCTTAGTACCCACTGTGTCTATGGTTGGAAAGCATTTGGGCGCAAGAAAGGATCATCCAGGCTTA  222
            |||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCAACTGTCCTAGTACCTACCGTGTCCATGGTTGGAAAGCATTTGGGAGCCAGAAAGGATCATCCAGGCTTA  222

Query  223  AAGGCTAAAGAAAATGATGAAAATTGTGGTCCTACTACCACTGTTTTTGTTGGCAACATTTCCGAGAAAGCTTC  296
            ||....|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  AAATTAAAAGAAAATGATGAAAATTGTGGCCCTACTACTACAGTTTTTGTTGGGAACATTTCTGAGAAGGCTTC  296

Query  297  AGACATGCTTATAAGACAACTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTTTTGAGCTGGAAGAGAGTACAAGGTGCTTCCG  370
            |||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  AGACATGCTTATACGACAGCTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTGTTGAGCTGGAAGAGAGTGCAAGGTGCTTCTG  370

Query  371  GAAAGCTTCAAGCCTTCGGATTCTGTGAGTACAAGGAGCCAGAATCTACCCTCCGTGCACTCAGATTATTACAT  444
            |.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  GGAAACTTCAAGCTTTTGGATTTTGTGAGTATAAAGAGCCTGAATCTACCCTCCGTGCTCTCAGATTATTGCAT  444

Query  445  GACCTGCAAATTGGAGAGAAAAAGCTACTCGTTAAAGTTGATGCAAAGACAAAGGCACAGCTGGATGAATGGAA  518
            |||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  445  GACCTTCAGATTGGAGAGAAGAAGCTACTTGTTAAAGTTGATGCCAAGACAAAGGCACAGTTGGATGAATGGAA  518

Query  519  AGCAAAGAAGAAAGCTTCTAATGGGAATGCAAGGCCAGAAACTGTCACTAATGACGATGAAGAAGCCTTGGATG  592
            ||||||||||||||   ||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AGCAAAGAAGAAAG---CTAATGGGAACGCCAGACCAGAAACTGTCACTAATGATGATGAAGAAGCCTTAGATG  589

Query  593  AAGAAACAAAGAGGAGAGATCAGATGATTAAAGGGGCTATTGAAGTTTTAATTCGTGAATACTCCAGTGAGCTA  666
            |||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  590  AAGAAACAAAGCGAAGAGACCAGATGATTAAAGGGGCCATTGAAGTTTTAATCCGAGAATATTCCAGTGAACTA  663

Query  667  AATGCCCCCTCACAGGAATCTGATTCTCACCCCAGGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGCAG  740
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  664  AATGCCCCCTCACAGGAGTCTGACTCTCACCCCAGAAAGAAGAAAAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGTAG  737

Query  741  ATTTCCAGTGGCCCCACTGATCCCTTATCCACTCATCACTAAGGAGGATATAAATGCTATAGAAATGGAAGAAG  814
            ||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  738  ATTTCCAGTGGCCCCATTGATCCCTTACCCACTCATCACCAAGGAGGATATAAATGCTATTGAAATGGAAGAAG  811

Query  815  ACAAAAGAGACCTGATATCTCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGACACACATAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGC  888
            ||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ACAAAAGAGATTTGATATCCCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGATACACACAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGC  885

Query  889  AAAAAGGAAAAAGAAAGACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAGCGTGAAAGGGAACGAGA  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  886  AAAAAAGAAAAAGAAAGACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAACGTGAAAGGGAACGAGA  959

Query  963  AAGGCGAGAACGGGAACGAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAGAAAGAACGGGAGCGGGAACGAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  AAGGCGAGAACGGGAACGAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAAAAAGAACGGGAGCGGGAACGAG  1033

Query 1037  AACGGGATAGGGACCGTGACCGGACAAAAGAGAGAGACCGAGATCGGGATCGAGAGAGAGATCGTGACCGGGAT  1110
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||      |||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034  AACGGGATAGGGATCGTGACCGCACAAAAGAGAGAGACCGA------GATCGAGAGAGAGATCGGGACCGAGAT  1101

Query 1111  AGAGAAAGGAGCTCAGATCGTAATAAGGATCGCAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACG  1184
            .|||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  CGAGAACGGAGCTCAGATCGAAATAAGGATCGGAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACG  1175

Query 1185  AGAGCGGGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAACGAGAGCGAGAACGAGAACGGGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGAGGG  1258
            .|||||||||      |||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1176  GGAGCGGGAA------AGAGAGAGAGAACGAGAACGGGAACGAGAACGAGAGCGAGAGAGAGAACGGGAGAGAG  1243

Query 1259  AACGGGAGCGAGAAAGAGAAAAAGACAAAAAACGGGACCGAGAAGAAGATGAAGAAGATGCATACGAACGAAGA  1332
            |||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1244  AACGGGAACGGGAAAGAGAGAAAGACAAGAAAAGAGACAGAGAAGAGGATGAAGAAGATGCATATGAACGAAGA  1317

Query 1333  AAACTTGAAAGAAAACTCCGAGAGAAAGAAGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACG  1406
            |||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318  AAACTCGAACGAAAACTGCGAGAGAAAGAGGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACG  1391

Query 1407  AAAGAAAACCCGGGAATATGAGAAAGAAGCTGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCCAAAGAAGCTA  1480
            |||||||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1392  AAAGAAAACTAGGGAATATGAGAAGGAGGCAGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCTAAGGAGGCTA  1465

Query 1481  AACGACTAAAAGAATTCTTAGAAGACTATGATGATGATAGAGATGACCCCAAATATTACAGAGGAAGTGCTCTT  1554
            |||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1466  AACGACTAAAAGAATTCCTAGAAGATTATGATGATGATAGAGATGACCCGAAGTACTACAGGGGTAGTGCTCTT  1539

Query 1555  CAGAAAAGGTTGCGTGATAGAGAAAAGGAAATGGAAGCAGATGAACGAGATAGGAAGAGAGAGAAGGAGGAGCT  1628
            ||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1540  CAGAAACGGTTGCGTGATAGGGAAAAAGAAATGGAAGCTGATGAACGAGACAGGAAGAGAGAGAAGGAAGAGCT  1613

Query 1629  TGAGGAAATCAGGCAGCGCCTTCTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAG  1702
            |||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614  TGAGGAAATCAGGCAGCGCTTACTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAG  1687

Query 1703  AGGCTGAGAGGCGCAGGCAGCCACAAATAAAGCAAGAGCCAGAATCAGAAGAGGAGGAAGAAGAAAAGCAAGAA  1776
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1688  AGGCTGAGAGGCGCAGGCAACCTCAAATAAAGCAAGAACCAGAATCCGAGGAAGAAGAAGAAGAAAAGCAAGAA  1761

Query 1777  AAAGAAGAAAAACGAGAAGAACCCATGGAAGAGGAAGAGGAGCCAGAGCAAAAGCCTTGTCTGAAACCTACTCT  1850
            |||||||||||||||||.||.||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||.|
Sbjct 1762  AAAGAAGAAAAACGAGAGGAGCCTGTGGAAGAGGAGGAAGAACCAGAGCAAAAGCCTTGTCTCAAGCCGACTTT  1835

Query 1851  GAGGCCCATCAGCTCTGCTCCATCTGTTTCCTCTGCCAGTGGCAATGCAACACCTAACACTCCTGGGGATGAGT  1924
            |||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1836  GAGACCCATCAGCTCTGCCCCATCTGTGTCCTCTGCCAGTGGCAACGCAACCCCCAACACTCCTGGGGATGAGT  1909

Query 1925  CTCCCTGTGGTATTATTATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAACCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATA  1998
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910  CTCCTTGTGGTATTATTATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAGCCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATA  1983

Query 1999  GGACTAAGTCTTAAACTGGGTGCTTCCAATAGTCCTGGTCAGCCTAATTCTGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGT  2072
            ||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1984  GGACTAAGCCTTAAATTGGGTGCTTCCAATAGTCCTGGCCAACCTAATTCAGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGT  2057

Query 2073  AGATAGTGTCTTTAACAAATTTGAGGATGAAGACAGTGATGACGTACCCCGAAAAAGGAAACTGGTTCCCTTGG  2146
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 2058  AGATAGTGTCTTTAACAAATTCGAGGATGAGGACAGTGATGATGTGCCCCGAAAAAGGAAACTCGTTCCCCTGG  2131

Query 2147  ATTATGGTGAAGATGATAAAAATGCAACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGTAAACACATTAAGAGT  2220
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2132  ATTATGGCGAAGATGATAAAAATGCCACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGCAAACACATTAAGAGT  2205

Query 2221  CTCATTGAGAAAATCCCTACAGCCAAACCTGAGCTCTTCGCTTATCCCCTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTAT  2294
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2206  CTCATTGAGAAAATTCCCACAGCCAAACCTGAGCTCTTTGCTTATCCTTTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTAT  2279

Query 2295  ACTGATGGAACGTCGAATTAGACCATGGATTAATAAGAAAATCATAGAATATATAGGTGAAGAAGAAGCTACAT  2368
            ||||||||||||..||||..|.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280  ACTGATGGAACGAAGAATCCGGCCATGGATCAATAAGAAAATCATCGAATACATAGGTGAAGAAGAAGCTACAT  2353

Query 2369  TAGTTGATTTTGTTTGTTCTAAGGTTATGGCTCATAGTTCACCCCAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTA  2442
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2354  TAGTTGATTTTGTTTGCTCTAAGGTTATGGCACATAGTTCACCACAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTA  2427

Query 2443  CTTGATGAAGAAGCAGAAGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAAT  2516
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428  CTAGATGAAGAAGCAGAAGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAAT  2501

Query 2517  TGGTCTTGTGAAG  2529
            |||.|||||||||
Sbjct 2502  TGGCCTTGTGAAG  2514