Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03879
- Subject:
- NM_001165960.1
- Aligned Length:
- 843
- Identities:
- 711
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MPRGAFRPCLPALYFAFLTCPTPEQRMSGTQAPDIHLGEPARGTGCVRGKQTSIRVQDCGRREEARAASRELRR 74
Query 1 ----------------------------------------------------------MAVYRLCVTTGPYLRA 16
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Sbjct 75 EKAQEHPRESWAHPQPYPAPQPLALRPETQPCPACRSSPPGRLLLRPALPGHPFLLPIMAVYRLCVTTGPYLRA 148
Query 17 GTLDNISVTLVGTCGESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAELGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVT 90
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Sbjct 149 GTLDNISVTLVGTCGESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAELGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVT 222
Query 91 EPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTARTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQE 164
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Sbjct 223 EPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTARTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQE 296
Query 165 MESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLD 238
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Sbjct 297 MESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLD 370
Query 239 RKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDT 312
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Sbjct 371 RKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDT 444
Query 313 CLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGALVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEW 386
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Sbjct 445 CLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGALVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEW 518
Query 387 DWLLAKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEG 460
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Sbjct 519 DWLLAKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEG 592
Query 461 LVDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSD 534
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Sbjct 593 LVDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSD 666
Query 535 ASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSS 608
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Sbjct 667 ASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSS 740
Query 609 MRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLPEVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQI 682
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Sbjct 741 MRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLPEVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQI 814
Query 683 SRDIQERNQGLALPYTYLDPPLIENSVSI 711
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Sbjct 815 SRDIQERNQGLALPYTYLDPPLIENSVSI 843