Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03879
• Subject: NM_011786.2
• Aligned Length: 2139
• Identities: 1850
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74
            ||||||||.||.||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||.||||||.||||.|||||||.||..||
Sbjct    1  ATGGCAGTATATCGGCTGTGTGTGACCACTGGTTCCTACCTGAAGGCTGGCACATTGGATAACATCTATGCTAC  74

Query   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148
            |.||||.|||||.||||||||||||||.||||||..|||.|||||..|.|||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  ATTGGTAGGCACCTGTGGTGAAAGCCCTAAGCAGAAGCTGGATCGCGTAGGCAGGGACTTCGCCTCTGGATCGG  148

Query  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222
            |.||||||||.||||||||.||...|||.||||||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||..
Sbjct  149  TTCAGAAGTATAAGGTGCGCTGTGAAGCAGAGCTGGGTGAGATCTTGCTGTTGCGCTTACACAAGGAGCGCTTT  222

Query  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGG---TAGTGTATCCCA  293
            |||||||||.||||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||.|..||.|||||   |..|||   |||
Sbjct  223  GCTTTCTTCTGCAAGGACCCTTGGTACTGCAGTCGAATCTGTGTCACTGCCCCCGATGGCTCTGCTGT---CCA  293

Query  294  CTTCCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTC  367
            |||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  294  CTTTCCCTGCTACCAGTGGATCGATGGCTACTGTACTGTGGAGCTGCGGCCAGGAACAGCAAGAACCATCTGTC  367

Query  368  AGGACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAG  441
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||.||||..|||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  368  AGGATTCTCTTCCCCTCCTTCTGGACCACAGGAAACGGGAACTCCAAGCCCGCCAAGAATGTTATCGCTGGAAG  441

Query  442  ATCTATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGC  515
            ||||..||||||||||||||..|.|||||.||.||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  442  ATCTTCGCCCCTGGCTTCCCTCGGATGGTGGATGTCAGCAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGATAAGAAATTTGC  515

Query  516  CTTGACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGA  589
            ||||||.|||||...|.||||||.|||.||||.|||||.|..||||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  516  CTTGACCAAGACAGTACCTTGTGCAGAACAGGATGACAACTCTGGGAACCGGTACCTGCCTGGCTTTCCTATGA  589

Query  590  AAATTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTC  663
            |.||||||||||||||.|||.||.|||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||..|||.|||.||
Sbjct  590  AGATTGACATCCCATCTCTGCTGCACATGGAACCCAACATTCGATACTCAGCCACCAAGACGGCCTCACTGATC  663

Query  664  TTCAATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCT  737
            |||||.|||.|.|||||.|||||.||.||||||.|||||||.||..||||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct  664  TTCAACGCCCTTCCTGCATCCTTTGGCATGAAGATTCGAGGTCTCCTGGACCGCAAGGGCTCCTGGAAGAGGCT  737

Query  738  GGATGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAG  811
            |||.|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  738  GGACGACATCCGGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACTTCAGAGTACGTCACCGAGCATTGGTGTGAGG  811

Query  812  ATCA-CTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAG  884
            | || |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.||||.|||||||||||
Sbjct  812  A-CAGCTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAACCCTGTCATGCTTCATTGCCTCTCCAGCTTGCCCAG  884

Query  885  CAAGCTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGA-CAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAG  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||| |||| |||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  885  CAAGCTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCACCTTTGCTGGGACCAGG-CACCTGCCTACAAACAGAGCTAGAG  957

Query  958  AGGGGGAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCA  1031
            ||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||...|||.|||.|||||||.|.|||.||
Sbjct  958  AGGGGGCACATCTTCCTGGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCAGTCCATTGCATAAACGGTCTCCAACA  1031

Query 1032  GTACGTGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCA  1105
            ||||||..|.||.||.||.||||||.|||||||||.|||.|||||||.||||.||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1032  GTACGTAACAGCGCCCCTCTGCCTGTTGTGGCTCAACCCACAGGGGGTGCTGCTGCCATTGGCAATCCAGCTCA  1105

Query 1106  GCCAGACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACG  1179
            |||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  GCCAGACACCAGGGCCAGAGAGCCCCATCTTTCTGCCCACTGATTGCGAGTTGGACTGGCTGCTGGCCAAGACG  1179

Query 1180  TGGGTGCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGC  1253
            ||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1180  TGGGTGCGCAACTCTGAGTTTTTGGTGCACGAGAACAACACGCATTTTCTGTGCACGCATTTGCTATGCGAGGC  1253

Query 1254  CTTCGCCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGAT  1327
            ||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1254  CTTCTCCATGGCTACACTGCGTCAGCTGCCGCTCTGTCATCCAGTCTACAAGCTCCTGCTTCCTCATACTCGCT  1327

Query 1328  ACACGCTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCC  1401
            ||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1328  ACACGCTGCAAGTGAACACCATCGCAAGAGCCACGCTGCTCAACCCAGACGGCCTCGTGGACAAGGTCACGTCC  1401

Query 1402  ATCGGGAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCC  1475
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||
Sbjct 1402  ATCGGTAGGCAGGGCCTCATCTACCTCATGAGCACCGGGCTGGCCCACTTCACCTACACGGATTTCTGCCTACC  1475

Query 1476  GGACAGCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGG  1549
            |||.|||.|.|||||.||.|||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  GGATAGCATACGGGCTCGTGGCGTCCTGACCATTCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGG  1549

Query 1550  CGGCCATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCAGCAGGATTCG  1623
            ||||.||||||||.|||||||||||.||.|||.|.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|..
Sbjct 1550  CGGCTATTGAGAGGTTTGTCTCAGAGATTGTGAGTTACTATTATCCCAGCGATGCGTCTGTGCAGCAGGACTGT  1623

Query 1624  GAGCTGCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCG  1697
            ||.||||||||||||...||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1624  GAACTGCAGGCCTGGGTGGGTGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTCGGACGGGAAAGTTCAGGCTTCCCAAGCCG  1697

Query 1698  GCTGTGCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTG  1771
            |||||||||||||||||||.|.|||||||..|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1698  GCTGTGCACCCCAGGAGAGCTCGTGAAGTATCTCACCGCAATCATCTTTAATTGCTCCGCCCAGCACGCTGCGG  1771

Query 1772  TCAACAGTGGGCAGCATGACTTTGGGGCCTGGATGCCCAATGCTCCATCATCCATGAGGCAGCCCCCACCCCAG  1845
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1772  TCAATAGTGGGCAGCATGACTTTGGGGCCTGGATGCCCAACGCCCCATCATCCATGAGGCAGCCTCCGCCTCAG  1845

Query 1846  ACCAAGGG-GACCACCACCCTGAAGACTTACCTAGACACCCTCCCTGAAGTGAACATCAGCTGTAACAACCTCC  1918
            |||||||| || |||.||..||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||.||.|||||..|||||.|
Sbjct 1846  ACCAAGGGCGA-CACGACAATGAAGAGTTACCTAGACACCCTCCCAGAGGTGAACACCACCTGTAGAAACCTTC  1918

Query 1919  TCCTCTTCTGGTTGGTTAGCCAAGAACCCAAGGACCAGAGGCCCCTGGGCACCTACCCAGATGAGCACTTCACA  1992
            |||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1919  TCCTCTTCTGGCTGGTCAGCCAAGAGCCAAAGGACCAGAGACCTCTGGGCACCTACCCAGATGAACACTTCACA  1992

Query 1993  GAGGAGGCCCCGAGGCGGAGCATCGCCGCCTTCCAGAGCCGCCTGGCCCAGATCTCAAGGGACATCCAGGAGCG  2066
            |||||||||||..|||.|||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||.|||||||..||||||
Sbjct 1993  GAGGAGGCCCCACGGCAGAGCATCGCAGCCTTCCAGAACTGCCTGGCCCAGATCTCAAAGGACATCAGGGAGCG  2066

Query 2067  GAACCAGGGTCTGGCACTGCCCTACACCTACCTGGACCCTCCCCTCATTGAGAACAGCGTCTCCATC  2133
            .||||||.|.||||||||||||||..|||||.||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 2067  CAACCAGAGCCTGGCACTGCCCTATGCCTACTTGGATCCTCCACTCATTGAGAACAGTGTTTCCATT  2133