Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03879
• Subject: XM_017024922.2
• Aligned Length: 2137
• Identities: 1680
• Gaps: 452

Alignment

Query    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74

Query   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148

Query  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222

Query  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT  296

Query  297  CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG  370

Query  371  ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC  444

Query  445  TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT  518

Query  519  GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA  592

Query  593  TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC  666

Query  667  AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA  740

Query  741  TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC  814

Query  815  ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG  888

Query  889  CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG  962

Query  963  GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG  1036

Query 1037  TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG  1110

Query 1111  ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT  1184

Query 1185  GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG  1258

Query 1259  CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG  1332

Query 1333  CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG  1406

Query 1407  GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA  1480

Query 1481  GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC  1554

Query 1555  ATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCAGCAGGATTCGGAGCT  1628
            ||||||                                                                    
Sbjct 1555  ATTGAG--------------------------------------------------------------------  1560

Query 1629  GCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCGGCTGT  1702
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1561  ------------------------------------------------------AGGTTTCCCAAGCCGGCTGT  1580

Query 1703  GCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTCAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  GCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTCAAC  1654

Query 1777  AGTGGGCAGCATGACTTTGGGGC----CTGGATGCCCAATGCTCCATCATCCATGAGGCAGCCCCCACCCCAGA  1846
            |||||||||   |||     |||    .||||             ||||...|||.                  
Sbjct 1655  AGTGGGCAG---GAC-----GGCAGAGGTGGA-------------ATCAGGGATGG------------------  1689

Query 1847  CCAAGGGGACCACCACCCTGAAGACTTACCTAGACACCCTCCCTGAAGTGAACATCAGCTGTAACAACCTCCTC  1920
                                                                                      
Sbjct 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689

Query 1921  CTCTTCTGGTTGGTTAGCCAAGAACCCAAGGACCAGAGGCCCCTGGGCACCTACCCAGATGAGCACTTCACAGA  1994
                                                                                      
Sbjct 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689

Query 1995  GGAGGCCCCGAGGCGGAGCATCGCCGCCTTCCAGAGCCGCCTGGCCCAGATCTCAAGGGACATCCAGGAGCGGA  2068
                                                                                      
Sbjct 1690  --------------------------------------------------------------------------  1689

Query 2069  ACCAGGGTCTGGCACTGCCCTACACCTACCTGGACCCTCCCCTCATTGAGAACAGCGTCTCCATC  2133
                                                                             
Sbjct 1690  -----------------------------------------------------------------  1689