Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03879
• Subject: XM_017024923.2
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1600
• Gaps: 522

Alignment

Query    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGTGTACCGCCTGTGTGTGACCACTGGTCCCTACCTGAGGGCCGGCACACTGGACAACATCTCTGTCAC  74

Query   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGGTGGGCACGTGTGGTGAAAGCCCCAAGCAGCGGCTAGATCGAATGGGCAGGGACTTCGCCCCTGGATCGG  148

Query  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACAGAAGTACAAGGTGCGTTGCACAGCGGAGCTGGGTGAGCTCTTGCTGCTGCGTGTACACAAGGAGCGCTAC  222

Query  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTTTCTTCCGCAAGGACTCTTGGTACTGTAGCCGCATCTGTGTCACCGAACCGGATGGTAGTGTATCCCACTT  296

Query  297  CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCTGCTATCAGTGGATTGAAGGCTACTGCACCGTGGAGCTGAGGCCAGGAACAGCAAGAACTATTTGTCAGG  370

Query  371  ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCTCTTCCCCTCCTCCTGGATCACAGGACACGGGAGCTCCGGGCCCGACAAGAATGCTACCGCTGGAAGATC  444

Query  445  TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGCCCCTGGCTTCCCCTGCATGGTAGACGTCAACAGCTTTCAGGAGATGGAGTCAGACAAGAAATTTGCCTT  518

Query  519  GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAAAGACGACAACTTGTGTAGACCAGGGTGACAGCAGTGGGAATCGGTACCTGCCCGGCTTCCCCATGAAAA  592

Query  593  TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGACATCCCATCCCTGATGTACATGGAGCCCAATGTTCGATACTCAGCCACCAAGACGATCTCGCTGCTCTTC  666

Query  667  AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGCCATCCCTGCGTCCTTGGGAATGAAGCTTCGAGGGCTGTTGGATCGCAAGGGCTCCTGGAAGAAGCTGGA  740

Query  741  TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACATGCAGAACATCTTCTGGTGCCATAAGACCTTCACGACAAAGTATGTCACAGAGCACTGGTGTGAAGATC  814

Query  815  ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTCTTTGGGTACCAGTACCTGAATGGTGTCAATCCCGTCATGCTCCACTGCATCTCTAGCTTGCCCAGCAAG  888

Query  889  CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCCTGTCACCAATGACATGGTGGCCCCCTTGCTGGGACAGGACACATGCCTGCAGACAGAGCTAGAGAGGGG  962

Query  963  GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAACATCTTCCTAGCGGACTACTGGATCCTGGCGGAGGCCCCCACCCACTGCCTAAACGGCCGCCAGCAGTACG  1036

Query 1037  TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGCCGCCCCACTGTGCCTGCTGTGGCTCAGCCCCCAGGGGGCGCTGGTGCCCTTGGCCATCCAGCTCAGCCAG  1110

Query 1111  ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCCCGGGCCTGACAGCCCCATCTTCCTGCCCACTGACTCCGAATGGGACTGGCTGCTGGCCAAGACGTGGGT  1184

Query 1185  GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGCAACTCTGAGTTCCTGGTGCACGAAAACAACACGCACTTTCTGTGCACGCATTTGCTGTGCGAGGCCTTCG  1258

Query 1259  CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATGGCCACGCTGCGCCAGCTGCCGCTCTGCCACCCCATCTACAAGCTCCTACTCCCCCACACTCGATACACG  1332

Query 1333  CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGCAGGTGAACACCATCGCGAGGGCCACGCTGCTCAACCCCGAGGGCCTCGTGGACCAGGTCACGTCCATCGG  1406

Query 1407  GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGGCAAGGCCTCATCTACCTCATGAGCACGGGCCTGGCCCACTTCACCTACACCAATTTCTGCCTTCCGGACA  1480

Query 1481  GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCTGCGGGCCCGCGGCGTCCTGGCTATCCCCAACTACCACTACCGAGACGACGGCCTGAAGATCTGGGCGGCC  1554

Query 1555  ATTGAGAGCTTTGTCTCAGAAATCGTGGGCTACTATTATCCCAGTGACGCATCTGTGCA-GCAGGA--TTCGGA  1625
            ||||||||                                        ||..||||||| |.||||  |..|||
Sbjct 1555  ATTGAGAG----------------------------------------GCCCCTGTGCAGGAAGGAAGTGTGGA  1588

Query 1626  GCTGCAGGCCTGGACTGGCGAGATTTTTGCTCAGGCGTTCCTGGGCCGGGAAAGCTCAGGTTTCCCAAGCCGGC  1699
               |||..|.||                |||||||.||...||||.|.                          
Sbjct 1589  ---GCACCCATG----------------GCTCAGGAGTGAGTGGGACT--------------------------  1617

Query 1700  TGTGCACCCCAGGAGAGATGGTGAAGTTCCTCACTGCAATCATCTTCAATTGCTCTGCCCAGCACGCTGCTGTC  1773
                                                                                      
Sbjct 1618  --------------------------------------------------------------------------  1617

Query 1774  AACAGTGGGCAGCATGACTTTGGGGCCTGGATGCCCAATGCTCCATCATCCATGAGGCAGCCCCCACCCCAGAC  1847
                                                                                      
Sbjct 1618  --------------------------------------------------------------------------  1617

Query 1848  CAAGGGGACCACCACCCTGAAGACTTACCTAGACACCCTCCCTGAAGTGAACATCAGCTGTAACAACCTCCTCC  1921
                                                                                      
Sbjct 1618  --------------------------------------------------------------------------  1617

Query 1922  TCTTCTGGTTGGTTAGCCAAGAACCCAAGGACCAGAGGCCCCTGGGCACCTACCCAGATGAGCACTTCACAGAG  1995
                                                                                      
Sbjct 1618  --------------------------------------------------------------------------  1617

Query 1996  GAGGCCCCGAGGCGGAGCATCGCCGCCTTCCAGAGCCGCCTGGCCCAGATCTCAAGGGACATCCAGGAGCGGAA  2069
                                                                                      
Sbjct 1618  --------------------------------------------------------------------------  1617

Query 2070  CCAGGGTCTGGCACTGCCCTACACCTACCTGGACCCTCCCCTCATTGAGAACAGCGTCTCCATC  2133
                                                                            
Sbjct 1618  ----------------------------------------------------------------  1617