Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03880
- Subject:
- NM_001253727.1
- Aligned Length:
- 2352
- Identities:
- 2271
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT 74
Query 75 CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG 148
Query 149 TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA 222
Query 223 TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTT---------- 286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTCTTTTCATTT 296
Query 287 -----------------------------------------------------------------------TGG 289
|||
Sbjct 297 CTTTCTTTTCATTACCCTCCTCTTCCTGGTCCCTCACTGTCATCATGCCTTACCACTTCCCCTTGATTCAGTGG 370
Query 290 TCGGTTCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTT 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCGGTTCTGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTT 444
Query 364 CCATCGGTTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTT 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCATCGGTTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTT 518
Query 438 CAAGAATTATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATGCTTTCA 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAGAATTATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATGCTTTCA 592
Query 512 GAGGACTGAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAA 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGGACTGAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAA 666
Query 586 GATCTTCACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGG 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATCTTCACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGG 740
Query 660 ACTAAATTCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAAC 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTAAATTCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAAC 814
Query 734 ACATGCCAAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCC 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACATGCCAAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCC 888
Query 808 TGCAGTAATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCT 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCAGTAATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCT 962
Query 882 CCAGAAACTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGA 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCAGAAACTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGA 1036
Query 956 AGGAGCTGTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTC 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGAGCTGTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTC 1110
Query 1030 AAACTCAAGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAACTCAAGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAA 1184
Query 1104 TCTCTCTCACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACA 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTCTCTCACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACA 1258
Query 1178 CTGATGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCA 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGATGGAATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCA 1332
Query 1252 GTTACCTGCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCAT 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTTACCTGCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCAT 1406
Query 1326 GTCAATCATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAA 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTCAATCATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAA 1480
Query 1400 AGTTTCGTGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTG 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGTTTCGTGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTG 1554
Query 1474 GCCATTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTA 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCCATTCTGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTA 1628
Query 1548 TCCTTTTAGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTA 1621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCCTTTTAGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTA 1702
Query 1622 TAGTGGCTTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCT 1695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TAGTGGCTTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCT 1776
Query 1696 CTTCATTCAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGC 1769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTTCATTCAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGC 1850
Query 1770 CGCATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTG 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGCATTTATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTG 1924
Query 1844 AAATACGGAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTA 1917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAATACGGAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTA 1998
Query 1918 TGCTGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTG 1991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCTGGATACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTG 2072
Query 1992 GGTAGTGATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTA 2065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGTAGTGATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTA 2146
Query 2066 AAGAAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATAT 2139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AAGAAATGATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATAT 2220
Query 2140 GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTT 2213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GCTCCATCATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTT 2294
Query 2214 CACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CACATACCCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA 2352