Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03880
- Subject:
- NM_001253730.1
- Aligned Length:
- 2271
- Identities:
- 1878
- Gaps:
- 393
Alignment
Query 1 ATGACATCTGGTTCTGTCTTCTTCTACATCTTAATTTTTGGAAAATATTTTTCTCATGGGGGTGGACAGGATGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAGTGCTCCCTTGGCTATTTCCCCTGTGGGAACATCACAAAGTGCTTGCCTCAGCTCCTGCACTGTAACGGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGACGACTGCGGGAATCAGGCCGATGAGGACAACTGTGGAGACAACAATGGATGGTCTCTGCAATTTGACAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TATTTTGCCAGTTACTACAAAATGACTTCCCAATATCCTTTTGAGGCAGAAACACCTGAATGTTTGGTCGGTTC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGTGCCAGTGCAATGTCTTTGCCAAGGTCTGGAGCTTGACTGTGATGAAACCAATTTACGAGCTGTTCCATCGG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTTCTTCAAATGTGACTGCAATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGAAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------ATGTCACTTCAGTGGAACTTAATAAGAAAGCTTCCTCCTGATTGCTTCAAGAAT 54
Query 445 TATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGGACT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TATCATGATCTTCAGAAGCTGTACCTGCAAAACAATAAGATTACATCCATCTCCATCTATGCTTTCAGAGGACT 128
Query 519 GAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATCTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 GAATAGCCTTACTAAACTGTATCTCAGTCATAACAGAATAACCTTCCTGAAGCCGGGTGTTTTTGAAGATCTTC 202
Query 593 ACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTAAAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 ACAGACTAGAATGGCTGATAATTGAAGATAATCACCTCAGTCGAATTTCCCCACCAACATTTTATGGACTAAAT 276
Query 667 TCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACATGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 TCTCTTATTCTCTTAGTCCTGATGAATAACGTCCTCACCCGTTTACCTGATAAACCTCTCTGTCAACACATGCC 350
Query 741 AAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCAGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 AAGACTACATTGGCTGGACCTTGAAGGCAACCATATCCATAATTTAAGAAATTTGACTTTTATTTCCTGCAGTA 424
Query 815 ATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAGAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 ATTTAACTGTTTTAGTGATGAGGAAAAACAAAATTAATCACTTAAATGAAAATACTTTTGCACCTCTCCAGAAA 498
Query 889 CTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGAGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CTGGATGAATTGGATTTAGGAAGTAATAAGATTGAAAATCTTCCACCGCTTATATTCAAGGACCTGAAGGAGCT 572
Query 963 GTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAACTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 GTCACAATTGAATCTTTCCTATAATCCAATCCAGAAAATTCAAGCAAACCAATTTGATTATCTTGTCAAACTCA 646
Query 1037 AGTCTCTCAGCCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTCTCT 1110
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 AGTCTCT---CCTAGAAGGGATTGAAATTTCAAATATCCAACAAAGGATGTTTAGACCTCTTATGAATCTCTCT 717
Query 1111 CACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGATGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CACATATATTTTAAGAAATTCCAGTACTGTGGGTATGCACCACATGTTCGCAGCTGTAAACCAAACACTGATGG 791
Query 1185 AATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTACCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 AATTTCATCTCTAGAGAATCTCTTGGCAAGCATTATTCAGAGAGTATTTGTCTGGGTTGTATCTGCAGTTACCT 865
Query 1259 GCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCAATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 GCTTTGGAAACATTTTTGTCATTTGCATGCGACCTTATATCAGGTCTGAGAACAAGCTGTATGCCATGTCAATC 939
Query 1333 ATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTTTCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 ATTTCTCTCTGCTGTGCCGACTGCTTAATGGGAATATATTTATTCGTGATCGGAGGCTTTGACCTAAAGTTTCG 1013
Query 1407 TGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCATTC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 TGGAGAATACAATAAGCATGCGCAGCTGTGGATGGAGAGTACTCATTGTCAGCTTGTAGGATCTTTGGCCATTC 1087
Query 1481 TGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCTTTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 TGTCCACAGAAGTATCAGTTTTACTGTTAACATTTCTGACATTGGAAAAATACATCTGCATTGTCTATCCTTTT 1161
Query 1555 AGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGTGGC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 AGATGTGTGAGACCTGGAAAATGCAGAACAATTACAGTTCTGATTCTCATTTGGATTACTGGTTTTATAGTGGC 1235
Query 1629 TTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTTCATT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TTTCATTCCATTGAGCAATAAGGAATTTTTCAAAAACTACTATGGCACCAATGGAGTATGCTTCCCTCTTCATT 1309
Query 1703 CAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGCATTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 CAGAAGATACAGAAAGTATTGGAGCCCAGATTTATTCAGTGGCAATTTTTCTTGGTATTAATTTGGCCGCATTT 1383
Query 1777 ATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAATACG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 ATCATCATAGTTTTTTCCTATGGAAGCATGTTTTATAGTGTTCATCAAAGTGCCATAACAGCAACTGAAATACG 1457
Query 1851 GAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGCTGGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 GAATCAAGTTAAAAAAGAGATGATCCTTGCCAAACGTTTTTTCTTTATAGTATTTACTGATGCATTATGCTGGA 1531
Query 1925 TACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGTAGTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 TACCCATTTTTGTAGTGAAATTTCTTTCACTGCTTCAGGTAGAAATACCAGGTACCATAACCTCTTGGGTAGTG 1605
Query 1999 ATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAGAAAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606 ATTTTTATTCTGCCCATTAACAGTGCTTTGAACCCAATTCTCTATACTCTGACCACAAGACCATTTAAAGAAAT 1679
Query 2073 GATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATATGCTCCAT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GATTCATCGGTTTTGGTATAACTACAGACAAAGAAAATCTATGGACAGCAAAGGTCAGAAAACATATGCTCCAT 1753
Query 2147 CATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTTCACATAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754 CATTCATCTGGGTGGAAATGTGGCCACTGCAGGAGATGCCACCTGAGTTAATGAAGCCGGACCTTTTCACATAC 1827
Query 2221 CCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA 2271
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1828 CCCTGTGAAATGTCACTGATTTCTCAATCAACGAGACTCAATTCCTATTCA 1878