Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_03918
Subject:
XM_017009686.2
Aligned Length:
894
Identities:
618
Gaps:
276

Alignment

Query   1  ATGACCTCGCTGACCCAGCGCAGCTCCGGCCTGGTGCAGCGGCGCACCGAGGCCTCCCGCAACGCCGCCGACAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GGAGCGGGCGGCGGGCGGCGGCGCCGGCAGCAGCGAGGACGACGCGCAGAGCCGCCGCGACGAGCAGGACGACG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  ACGACAAGGGCGACTCCAAGGAAACGCGGCTGACCCTGATGGAGGAAGTGCTCCTGCTGGGCCTCAAGGACCGC  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  GAGGGTTACACATCATTTTGGAATGACTGTATATCATCTGGATTACGTGGCTGTATGTTAATTGAATTAGCATT  296
                                                                 ||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------ATGTTAATTGAATTAGCATT  20

Query 297  GAGAGGAAGGTTACAACTAGAGGCTTGTGGAATGAGACGTAAAAGTCTATTAACAAGAAAGGTAATCTGTAAGT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  21  GAGAGGAAGGTTACAACTAGAGGCTTGTGGAATGAGACGTAAAAGTCTATTAACAAGAAAGGTAATCTGTAAGT  94

Query 371  CAGATGCTCCAACAGGGGATGTTCTTCTTGATGAAGCTCTGAAGCATGTTAAGGAAACTCAGCCTCCAGAAACG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  95  CAGATGCTCCAACAGGGGATGTTCTTCTTGATGAAGCTCTGAAGCATGTTAAGGAAACTCAGCCTCCAGAAACG  168

Query 445  GTCCAGAACTGGATTGAATTACTTAGTGGTGAGACATGGAATCCATTAAAATTGCATTATCAGTTAAGAAATGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169  GTCCAGAACTGGATTGAATTACTTAGTGGTGAGACATGGAATCCATTAAAATTGCATTATCAGTTAAGAAATGT  242

Query 519  ACGGGAACGATTAGCTAAAAACCTGGTGGAAAAGGGTGTATTGACAACAGAGAAACAGAACTTCCTACTTTTTG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243  ACGGGAACGATTAGCTAAAAACCTGGTGGAAAAGGGTGTATTGACAACAGAGAAACAGAACTTCCTACTTTTTG  316

Query 593  ACATGACAACACATCCCCTCACCAATAACAACATTAAGCAGCGCCTCATCAAGAAAGTACAGGAAGCCGTTCTT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317  ACATGACAACACATCCCCTCACCAATAACAACATTAAGCAGCGCCTCATCAAGAAAGTACAGGAAGCCGTTCTT  390

Query 667  GACAAATGGGTGAATGACCCTCACCGCATGGACAGGCGCTTGCTGGCCCTCATTTACCTGGCTCATGCCTCGGA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391  GACAAATGGGTGAATGACCCTCACCGCATGGACAGGCGCTTGCTGGCCCTCATTTACCTGGCTCATGCCTCGGA  464

Query 741  CGTCCTGGAGAATGCTTTTGCTCCTCTTCTGGACGAGCAGTATGATTTGGCTACCAAGAGAGTGCGGCAGCTTC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465  CGTCCTGGAGAATGCTTTTGCTCCTCTTCTGGACGAGCAGTATGATTTGGCTACCAAGAGAGTGCGGCAGCTTC  538

Query 815  TCGACTTAGACCCTGAAGTGGAATGTCTGAAGGCCAACACCAATGAGGTTCTGTGGGCGGTGGTGGCGGCGTTC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539  TCGACTTAGACCCTGAAGTGGAATGTCTGAAGGCCAACACCAATGAGGTTCTGTGGGCGGTGGTGGCGGCGTTC  612

Query 889  ACCAAG  894
           ||||||
Sbjct 613  ACCAAG  618