Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03924
• Subject: NM_001349368.2
• Aligned Length: 807
• Identities: 618
• Gaps: 189

Alignment

Query   1  ATGAATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGAACTTAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  148
                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------ATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  58

Query 149  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGTCAATGG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  59  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGTCAATGG  132

Query 223  CAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTTCCAAAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133  CAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTTCCAAAA  206

Query 297  GCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACTTAGAAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 207  GCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACTTAGA--  278

Query 371  GGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTGAAAAAT  444
                                                                                     
Sbjct 279  --------------------------------------------------------------------------  278

Query 445  AAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGAATATAA  518
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 279  -----------------------AAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGAATATAA  329

Query 519  GGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTAAAAAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330  GGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTAAAAAGA  403

Query 593  AAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATAAATAGA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404  AAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATAAATAGA  477

Query 667  TTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCTGCTGCT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478  TTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCTGCTGCT  551

Query 741  GCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  807
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552  GCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  618