Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03924
• Subject: NM_001349369.2
• Aligned Length: 810
• Identities: 570
• Gaps: 234

Alignment

Query   1  ATGAATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGAACTTAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  148
                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------ATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTGAAACAC  58

Query 149  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGTCAATGG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  59  TCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGTCAATGG  132

Query 223  CAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTTCCAAAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133  CAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTTCCAAAA  206

Query 297  GCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACTTAGAAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207  GCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACTTAGAAA  280

Query 371  GGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTGAAAAAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281  GGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTGAAAAAT  354

Query 445  AAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGAATATAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355  AAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGAATATAA  428

Query 519  GGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTAAAAAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429  GGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTAAAAAGA  502

Query 593  AAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATAAATAGA  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||          
Sbjct 503  AAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGGTCCT----------  566

Query 667  TTAT---TTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCTGCT  737
           .|.|   |||..|                                                             
Sbjct 567  CTCTGCCTTGGGG-------------------------------------------------------------  579

Query 738  GCTGCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  807
                                                                                 
Sbjct 580  ----------------------------------------------------------------------  579