Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03924
• Subject: XM_011543538.2
• Aligned Length: 813
• Identities: 706
• Gaps: 105

Alignment

Query   1  ATGA------ATCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGA  68
           ||||      ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACCCTCTTCCAGGAGGATCTAGATCCGGATAGTACTACAGATGTGGGAGATGTTACAAATACTGAAGAAGA  74

Query  69  ACTTATTAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTG  142
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACTTATTAGAGAATGTGAAGAAATGTGGAAAGATATGGAAGAATGTCAGAATAAATTATCACTTATTGGAACTG  148

Query 143  AAACACTCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGT  216
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AAACACTCACCGATTCAAATGCTCAGCTATCATTGTTAATTATGCAAGTAAAATGTTTAACCGCTGAACTCAGT  222

Query 217  CAATGGCAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTT  290
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CAATGGCAGAAAAAAACACCTGAAACAATTCCCTTGACTGAAGACGTTCTCATAACATTAGGAAAAGAAGAGTT  296

Query 291  CCAAAAGCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACT  364
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CCAAAAGCTGAGACAAGATCTTGAAATGGTACTGTCCACTAAGGAGTCAAAGAATGAAAAGTTAAAGGAAGACT  370

Query 365  TAGAAAGGGAACAACGGTGGTTGGATGAACAGCAACAGATAATGGAATCTCTTAATGTACTACACAGTGAATTG  438
           ||||                                                                      
Sbjct 371  TAGA----------------------------------------------------------------------  374

Query 439  AAAAATAAGGTTGAAACATTTTCTGAATCAAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGA  512
                                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375  -----------------------------AAGAATCTTTAATGAACTGAAAACTAAAATGCTTAATATAAAAGA  419

Query 513  ATATAAGGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTA  586
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420  ATATAAGGAGAAACTCTTGAGTACCTTGGGCGAGTTTCTAGAAGACCATTTTCCTCTGCCTGATAGAAGTGTTA  493

Query 587  AAAAGAAAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATA  660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494  AAAAGAAAAAGAAAAACATTCAAGAATCATCTGTAAACCTGATAACACTGCATGAAATGTTAGAGATTCTTATA  567

Query 661  AATAGATTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCT  734
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568  AATAGATTATTTGATGTTCCACATGATCCATATGTCAAAATTAGTGATTCCTTTTGGCCACCTTATGTTGAGCT  641

Query 735  GCTGCTGCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  807
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642  GCTGCTGCGTAATGGAATTGCCTTGAGACATCCAGAAGATCCAACCCGAATAAGATTAGAAGCTTTCCATCAG  714